OTAR3088/Variant_AllLabel_Large · Datasets at Hugging Face

tokens listlengths 1 2.94k	tags listlengths 1 2.94k
[ " ", "suggesting", "they", "are", "distantly", "related", "\n", "Notably", ",", "another", "mutation", ",", "c.713C", " ", ">", " ", "T", ",", "p.(Ser238Leu", ")", ",", "has", "been", "detected", "in", "four", "Turkish", "families", "to", "date", ",", "s...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O...
[ " ", "p.(Arg111Cys", ")", "(", "rs202073531", ")", "identified", "in", "as", "biallelic", "in", "Family", "5", "and", "as", "heterozygous", "in", "Family", "6", "[", "15", ",", " ", "19", "]", "\n", "The", "p.(Pro249Leu", ")", "variant", "has", "now", ...	[ "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...
[ " ", "although", "the", "function", "of", "this", "phosphatase", "during", "enamel", "formation", "remains", "unclear", "[", "16", "]", "\n", "To", "date", ",", "including", "families", "reported", "here", ",", "22", "families", "with", "AI", "due", "to", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "which", "results", "primarily", "from", "the", "increased", "incidence", "of", "consanguinity", "and", "the", "resulting", "recessive", "disease", "in", "the", "Bradford", "Asian", "community", "[", "43", "]", "\n", "Previously", "published", "reports", "o...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "unlike", "many", "other", "genes", "causative", "for", "recessive", "hypoplastic", "AI", "\n", "As", "additional", "individuals", "with", "AI", "due", "to", " ", "ACP4", " ", "variants", "are", "identified", ",", "including", "via", "state-driven", "geno...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "the", "individual", "who", "carried", "compound", "heterozygous", " ", "ACP4", " ", "variants", ":", "c.626", "T", " ", ">", " ", "C", ",", "p.(Leu209Pro);c.1199C", " ", ">", " ", "A", ",", "p.(Ala400Asp", ")", ",", "also", "had", "agenesis", "of",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O",...
[ " ", "although", "the", "effect", "might", "result", "from", "reduced", "dentine", "volume", "[", "44", "]", "\n", "Of", "the", " ", "ACP4", " ", "variants", "reported", "to", "date", ",", "c.626", "T", " ", ">", " ", "C", ",", "p.(Leu209Pro", ")", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVS...
[ " ", "fifteen", "missense", ",", "one", "splice", "and", "two", "frame-breaking", "deletion", " ", "ACP4", " ", "pathogenic", "variants", "have", "been", "identified", "\n", "Most", "variants", "are", "clustered", "in", "exons", "3", "(", "3", "missense", "v...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "making", "up", "the", "majority", "of", "the", "protein", "(", "amino", "acids", "29", "-", "390", ")", ",", "a", "transmembrane", "domain", "(", "amino", "acids", "391", "-", "414", ")", "and", "a", "cytoplasmic", "domain", "(", "amino", "acids"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "denoted", "as", "the", "histidine", "acid", "phosphatase", "active", "sites", ":", "amino", "acids", "32", "-", "46", "and", "282", "-", "298", "[", "15", "]", "\n", "It", "has", "been", "suggested", "that", "biallelic", " ", "ACP4", " ", "varian...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "we", "performed", "computational", "modelling", "of", "the", "fifteen", "likely", "pathogenic", "missense", " ", "ACP4", " ", "variants", "and", ",", "for", "comparison", ",", "three", "likely", "ACP4", "missense", "polymorphisms", ",", "using", "Rosetta",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "with", "a", "range", "of", "effects", "varying", "from", "no", "effect", "on", "stability", "to", "very", "substantial", "changes", "\n", "The", "median", "score", "for", "disease", "causing", "variants", "was", "5.06", " ", "kcal/mol", ",", "while", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "but", "the", "relatively", "similar", "value", "may", "suggest", "that", "protein", "stability", "is", "only", "significantly", "affected", "by", "particular", "variants", "which", "are", "also", "more", "likely", "to", "exert", "a", "pathogenic", "effect"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "with", "residues", "at", "the", "interface", "between", "the", "monomers", "important", "to", "its", "structure", "and", "residues", "at", "its", "catalytic", "core", "fundamental", "to", "its", "function", "[", "15", ",", " ", "16", "]", "\n", "The"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar"...
[ " ", "Arg111Cys", "is", "predicted", "to", "maintain", "stability", "similar", "to", "wild-type", "\n", "However", ",", "the", "InterPro", "Protein", "family", "database", "predicts", "that", "residues", "41", ",", "44", ",", "111", ",", "288", "and", "289",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "p.(Ala400Asp", ")", "also", "shows", "only", "a", "minor", "effect", "on", "stability", ",", "but", "this", "variant", ",", "which", "is", "in", "the", "transmembrane", "domain", "(", "residues", "391", "-", "414", ")", ",", "replaces", "a", "hydro...	[ "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...
[ " ", "ACP4-related", "AI", "teeth", "revealed", "a", "generalised", "hypoplastic", "appearance", "\n", "Clinical", "information", "suggests", "a", "characteristic", "yellow", "appearance", "of", "the", "posterior", "molars", ",", "with", "evidence", "of", "striated"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "radiographs", "before", "eruption", "are", "required", "to", "measure", "the", "enamel", "volume", "and", "exclude", "any", "post-eruptive", "breakdown", "of", "the", "enamel", "\n", "A", "previous", "study", "examining", "an", "extracted", "tooth", "from"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-H...
[ " ", "although", "this", "was", "calculated", "from", "teeth", "that", "had", "experienced", "post-eruptive", "wear", "[", "19", "]", "\n", "Further", "phenotypic", "studies", "of", "unerupted", "teeth", "are", "required", "to", "reveal", "the", "phenotypic", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "as", "well", "as", "exome", "sequencing", "[", "17", "]", "\n", "These", "data", "suggest", "that", "biallelic", " ", "ACP4", " ", "variants", "account", "for", "a", "significant", "proportion", "of", "recessive", "AI", "families", "\n", "We", "have"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "KCNQ2", " ", "variants", "were", "identified", "through", "WES", "in", "all", "patients", "\n", "All", "detected", "variants", "were", "subsequently", "confirmed", "by", "orthogonal", "methods", "when", "applicable", "(", "e.g.", ",", "Sanger", "sequencing", "f...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "parental", "origin", "or", "de", "novo", ")", "\n", "All", " ", "KCNQ2", " ", "variants", "were", "systematically", "interpreted", "using", "the", "American", "College", "of", "Medical", "Genetics", "and", "Genomics/Association", "for", "Molecular", "Patho...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "and", "(", "3", ")", "predicted", "loss", "of", "function", "for", "nonsense", ",", "frameshift", ",", "canonical", "±1/±2", "splice-site", "variants", ",", "and", "exon-level", "deletions/copy-number", "variants", "(", "PVS1", ")", "\n", "Each", "varian...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "splice-region", "variants", ")", "were", "classified", "conservatively", "without", "applying", "PVS1", "in", "the", "absence", "of", "RNA", "or", "functional", "evidence", "\n", "Familial", "segregation", "analysis", "was", "performed", "when", "parental", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "phase", "(", "in", "cis", "vs", "in", "trans", ")", "was", "not", "assumed", "unless", "formally", "determined", "\n", "For", "topology", "mapping", ",", "each", "variant", "was", "further", "assigned", "to", "transmembrane", "segments", "(", "S1-S6/po...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "drug-resistant", "seizures", "accompanied", "by", "global", "developmental", "impairment", "\n", "Neurodevelopmental", "outcomes", "were", "determined", "using", "a", "standardized", "milestone", "interview", "covering", "4", "domains", "(", "gross", "motor", ",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "<", "70", "severe", ")", "and", "were", "used", "to", "calibrate", "milestone-based", "ratings", "\n", "When", "standardized", "testing", "was", "unavailable", ",", "prespecified", "age-specific", "thresholds", "were", "applied", "as", "follows", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "We", "identified", " ", "KCNQ2", " ", "variants", "(", "RefSeq", ":", " ", "NM_172107.2", ")", "in", "30", "neonates", "\n", "Overall", ",", "32", "variant", "occurrences", "were", "observed", "across", "the", "cohort", ",", "representing", "29", "distinct"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "B-H...
[ " ", "phase", "(", "in", "cis", "vs", "in", "trans", ")", "was", "not", "determined", "and", "was", "not", "assumed", "\n", "Grouped", "by", "predicted", "effect", ",", "the", "variants", "fell", "into", "nontruncating", "and", "truncating/NMD", "categories"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "[", "p.", "E515D", ",", "paternally", "inherited", ";", "ACMG/AMP", "likely", "benign", "]", ")", ",", "2", "in-frame", "deletions", ",", "and", "1", "splice-region", "variant", "(", "total", "24/30", ",", "80", "%", ")", "\n", "In", "addition", ...	[ "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...
[ " ", "ACMG/AMP", "likely", "benign", ")", "in", "the", "same", "individual", "as", "a", "truncating", "variant", "c.109delG", "(", "p.", "D37Tfs*5", ",", "paternally", "inherited", ")", "\n", "The", "truncating/NMD", "group", "(", "predicted", "loss", "of", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...
[ " ", "Case", "29", "carried", "the", "frameshift", "(", "c.109delG", ")", "alongside", "the", "missense", "change", "\n", "Details", "are", "presented", "in", " ", "Table", "2", "\n", "By", "ACMG/AMP", "classification", ",", "17", "of", "32", "variants", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...
[ " ", "Case", "29", "had", "variants", "inherited", "from", "each", "parent", ")", ",", "10", "were", "confirmed", "de", "novo", ",", "and", "6", "were", "undetermined", "because", "of", "unavailable", "parental", "samples", "\n", "Among", "carrier", "parents...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "no", "epilepsy", "history", "was", "reported", "in", "other", "carrier", "parents", "when", "information", "was", "available", "\n", "Among", "the", "25", "patients", "with", "a", "single", " ", "KCNQ2", " ", "variant", "and", "a", "single", "variant",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "nontransmembrane", "region", "(", "mostly", "nontruncating", ")", ",", "whereas", "variants", "linked", "to", "developmental", "delay", "clustered", "within", "transmembrane", "segments-particularly", "the", "S5-pore-S6", "corridor-dominated", "by", "nontruncating",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "(", "100.2", "kb", ")", "(", "truncating/NMD", ")", "discontinued", "medication", "by", "1", "year", "and", "had", "normal", "development", "at", "2.5", "years", "(", "SeL(F)NE", "course", ")", "\n", "Two", "patients", "with", "splice-affecting", "vari...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "1", "canonical", "splice-site", "[", "truncating/NMD", "]", "and", "1", "splice-region", "[", "nontruncating", "]", ")", "likewise", "showed", "normal", "development", "at", "last", "follow-up", "(", "2.5", "and", "3.5", "years", ")", "\n", "By", "cont...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "Case", "29", "(", "missense", "+", "frameshift", ")", "required", "ongoing", "medication", "at", "5", "years", "and", "had", "significant", "delays", "\n", "In", "both", "Cases", "20", "and", "29", ",", "phase", "was", "not", "determined", "(", "Ta...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "In", "this", "two-center", "retrospective", "study", "of", "30", "neonates", "with", "epilepsy", "harboring", " ", "KCNQ2", " ", "variants", ",", "we", "systematically", "analyzed", "clinical", "features", ",", "genetic", "findings", ",", "treatment", "responses"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "with", "a", "median", "onset", "age", "of", "3", "days", "\n", "This", "early-onset", "pattern", "is", "consistent", "with", "previous", "studies", "that", "identify", " ", "KCNQ2", " ", "as", "a", "leading", "genetic", "cause", "of", "neonatal", "ep...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "this", "distribution", "aligns", "with", "earlier", "reports", "showing", "that", " ", "KCNQ2", "-related", "epilepsy", "often", "begins", "with", "focal", "tonic", "or", "motor", "seizures", "and", ",", "in", "more", "severe", "cases", "," ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "may", "progress", "to", "multifocal", "or", "generalized", "seizures", "\n", "17,19", "-", "21", "Three", "patients", "(", "10", "%", ")", "exhibited", "markedly", "abnormal", "neonatal", "EEG", "patterns", "indicative", "of", "severe", "encephalopathy-one...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "adverse", "neurodevelopment", "in", " ", "KCNQ2", "-related", "epilepsies", "\n", "Brain", "MRI", "obtained", "shortly", "after", "seizure", "onset", "was", "normal", "in", "53", "%", ";" ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "among", "abnormal", "scans", "(", "47", "%", ")", ",", "the", "most", "frequent", "findings", "were", "mild", "prominence", "of", "extra-axial", "CSF", "spaces", "and", "increased", "signal", "in", "the", "globus", "pallidus", "\n", "Major", "structura...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "longitudinal", "neuroimaging", "is", "warranted", "to", "clarify", "trajectories", "and", "their", "relevance", "to", "disease", "severity", "and", "long-term", "outcomes", "\n", "Across", "the", "cohort", ",", "we", "observed", "32", "variant", "occurrences...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "phase", "(", "in", "cis", "vs", "in", "trans", ")", "was", "not", "determined", "and", "was", "not", "assumed", "\n", "Missense", "variants", "were", "most", "common", "(", "21", "patients", ")", ",", "consistent", "with", "prior", "reports", "\n",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "in", "6", "patients", ",", "parental", "origin", "could", "not", "be", "confirmed", ",", "given", "unavailable", "samples", "\n", "These", "data", "highlight", "that", " ", "KCNQ2", " ", "variants", "arise", "both", "de", "novo", "and", "within", "fa...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "are", "predicted", "to", "impair", "channel", "function", "and", "exacerbate", "excitability", "\n", "16,25", " ", "Our", "cohort", "echoes", "these", "gradients", ":", "5", "infants", "with", "missense", "variants", "in", "or", "near", "S6", "presented"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "these", "patterns", "reinforce", "the", "clinical", "utility", "of", "variant", "topology", "for", "risk", "stratification", "\n", "The", "Kv7.2/Kv7.3", "heterotetramer", "provides", "a", "unifying", "framework", "across", "the", "SeL(F)NE-DEE", "spectrum", "\...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "and", "exon-level", "deletions", ")", "tend", "toward", "haploinsufficiency", "with", "residual", "assembly", "and", "more", "frequently", "align", "with", "SeL(F)NE", "and", "favorable", "development", "\n", "Rare", "individuals", "carrying", "2", "KCNQ3", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "variants", "(", "Cases", "20", "and", "29", ")", "\n", "Case", "20", "had", "significant", "developmental", "delay", "and", "persistent", "seizures", "despite", "treatment", "\n", "Case", "29", "achieved", "neonatal", "seizure", "control", "with", "oxcarbazepin...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "PIP", "2", "-dependent", "loss", "of", "function", "reversible", "by", "retigabine", "in", "vitro", "\n", "28", " ", "However", ",", "in", "our", "two-variant", "cases", ",", "phase", "was", "not", "determined", "and", "p.", "E515D", "was", "classifi...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "therefore", ",", "we", "can", "not", "conclude", "that", "2", "pathogenic", "alleles", "contributed", "to", "the", "phenotype", "\n", "Collectively", ",", "they", "support", "a", "dosage/topology", "framework", "whereby", "pore-region", "missense", "in", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "most", "often", "with", "monotherapy", "\n", "Among", "seizure-free", "patients", "on", "monotherapy", "(", "18/28", ",", "64", "%", ")", ",", "the", "most", "commonly", "used", "drug", "was", "oxcarbazepine", "(", "OXC", ")", ",", "a", "sodium-chann...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "6", "(", "60", "%", ")", "achieved", "seizure", "control", "after", "the", "addition", "of", "OXC", "\n", "These", "findings", "are", "consistent", "with", "Chinese", "series", "demonstrating", "OXC", "efficacy", "in", " ", "KCNQ2", "-related", "epilep...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "whereas", "ongoing", "seizures", "occurred", "exclusively", "in", "DEE", "(", "2", "patients", ")", "\n", "Most", "controlled", "patients", "entered", "remission", "within", "the", "first", "6", "months", "of", "life", ",", "a", "hallmark", "of", "SeL(...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "drug-specific", "observations-particularly", "regarding", "OXC-should", "be", "understood", "as", "associations", "rather", "than", "causal", "effects", "\n", "While", "carbamazepine", "is", "more", "frequently", "cited", "internationally", "for", "neonatal-onset", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "however", ",", "neonatal", "OXC", "use", "is", "off-label", ",", "and", ",", "in", "our", "cohort", ",", "most", "initiations", "occurred", "after", "the", "neonatal", "period", "\n", "Prospective", ",", "standardized", "studies", "are", "needed", "to"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "a", "Kv7", "opener", "that", "stabilizes", "channels", "(", "Kv7.2-Kv7.5", ")", "in", "the", "open", "state", "and", "reduces", "excitability", "\n", "31", "-", "33", " ", "Despite", "early", "promise", "for", " ", "KCNQ2", "-related", "epilepsy", ",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "Trobalt", "in", "the", "EU", ")", "was", "voluntarily", "withdrawn", "from", "US", "and", "EU", "markets", "by", "the", "manufacturer", "in", "2017", "because", "of", "concerns", "about", "skin", "and", "retinal", "discoloration", "in", "regions", "reg...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "while", "DEE", "frequently", "required", "combination", "therapy", "and", "carried", "a", "higher", "risk", "of", "persistent", "seizures", "and", "developmental", "impairment", "\n", "Given", "the", "observational", "design", "and", "potential", "confounding"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "standardized", "developmental", "testing", "was", "often", "unavailable", "in", "real-world", "practice", "(", "particularly", "among", "children", "with", "more", "pronounced", "delays", ")", ",", "so", "outcome", "assignment", "relied", "primarily", "on", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "but", "ratings", "were", "not", "masked", "dual", "reviews", "\n", "EEG", "and", "MRI", "were", "obtained", "in", "the", "neonatal", "period", "only", ";", "follow-up", "studies", "were", "performed", "opportunistically", "at", "nonstandardized", "ages", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "no", "in", "vitro", "functional", "assays", "were", "undertaken", ",", "so", "links", "between", "variant", "topology", "and", "channel", "dysfunction", "are", "inferred", "rather", "than", "directly", "demonstrated", "\n", "Finally", ",", "nonrandomized", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "which", "should", "be", "confirmed", "prospectively", "\n", "KCNQ2", "-related", "neonatal", "epilepsy", "shows", "high", "early", "seizure", "controllability", "but", "divergent", "developmental", "trajectories", "that", "are", "associated", "with", "variant", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Peripheral", "blood", "samples", "(", "10", "mL", ")", "were", "collected", "from", "all", "participants", ",", "and", "genomic", "DNA", "was", "isolated", "using", "the", "standard", "phenol-chloroform", "method", "\n", "Genomic", "DNA", "from", "index", "pa...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "To", "assess", "the", "impact", "of", "the", "c.1159", "+", "2T", ">", "A", "variant", "on", " ", "VRK1", " ", "exon", "12", "splicing", "in", "the", "affected", "individual", "(", "F8:II-1", ")", ",", "mRNA", "was", "extracted", "from", "peripheral", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"...
[ "In", "our", "axonal", "CMTR", "cohort", ",", "AR", "families", "and", "undiagnosed", "sporadic", "cases", "accounted", "for", "45.8", "%", "(", "161/351", ")", "of", "the", "cases", "\n", "Among", "these", ",", "10", "distinct", " ", "VRK1", " ", "(", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Arg3Cys", ")", ",", "c.83T", ">", "G(p", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]
[ "Ile28Arg", ")", ",", "c.215T", ">", "G(p", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]
[ "Val72Gly", ")", ",", "c.974T", ">", "A", "(", "p.", "Leu325", "", ")", ",", "c.879_882del", "(", "p.", "Lys295Glnfs11", ")", ",", "c.1073_1076del(p", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "B-HGVSVar", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ "Glu361Leufs*65", ")", ",", "c.1159", "+", "2T", ">", "A", "(", "splicing", ")", ",", "and", "c.539C", ">", "T(p", "." ]	[ "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]
[ "Ala180Val", ")", ",", "which", "were", "reported", "for", "the", "first", "time", "in", " ", "VRK1", "-related", "PN", "\n", "The", "variants", "c.1124G", ">", "A", "(", "p.", "Trp375", "*", ")", "and", "c.706G", ">", "A", "(", "p.", "Val236Met", ")...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar"...
[ "To", "contextualize", "these", "findings", ",", "we", "reviewed", "23", "globally", "reported", "studies", "(", "2009", "-", "2025", ")", "and", "included", "our", "cohort", ",", "compiling", "data", "from", "37", "families", "encompassing", "53", "patients",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "In", "this", "study", ",", "we", "identified", "10", " ", "VRK1", " ", "variants", "across", "8", "Chinese", "families", "diagnosed", "with", "autosomal", "recessive", "or", "sporadic", "axonal", "CMTR", "\n", "Notably", ",", "8", "of", "these", "variants",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "Exome", "capture", "was", "performed", "according", "to", "the", "Illumina", "Nextera", "Rapid", "Capture", "Enrichment", "library", "preparation", "protocol", "using", "50", " ", "ng", "of", "genomic", "DNA", "from", "patients", "\n", "Paired-end", "sequencing",...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "We", "detected", "205", "variants", "in", "our", "400", "NDD", "patients", "\n", "Thirty-two", "percent", "(", "n", " ", "=", " ", "66", ")", "of", "all", "detected", "205", "variants", "were", "in", "chromatinopathy", "genes", "\n ", "Variants", "in", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "We", "conducted", "genome-wide", "methylation", "analysis", "using", "the", "EpiSign", "platform", "for", "60", "patients", "with", "62", "different", "variants", "in", "chromatinopathy", "genes", "\n", "This", "cohort", "included", "patients", "carrying", "variant...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "patients", "were", "not", "assessed", "as", "positive", "or", "negative", "\n", "Instead", ",", "an", "unbiased", "screen", "against", "the", "EpiSign", "V5", "reference", "database", "was", "performed", "to", "determine", "whether", "the", "patient", "’...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "though", "a", "match", "does", "not", "confirm", "pathogenicity", "for", "the", "gene", "of", "interest", "\n", "Notably", ",", "two", "patients", "showed", "partial", "overlap", "with", "existing", "episignatures", ":", "P17", ",", "carrying", "a", " ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "preventing", "definitive", "classifier-based", "interpretation", "(", "Fig", "\n ", "2", ")", "\n", "23", "patients", "carried", "a", "single", "pathogenic", "or", "likely", "pathogenic", "variant", "in", "a", "gene", "with", "a", "known", "episignature", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "as", "indicated", "by", "elevated", "MVP", "scores(Fig", "." ]	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]
[ " ", "2", ")", "\n", "P22", ",", "with", "a", " ", "CHD4", " ", "frameshift", "variant", "(", "c.4213del", ",", "p.(Ala1405Profs*41", ")", ",", "was", "reported", "negative", "for", "the", "associated", "Sifrim-Hitz-Weiss", "syndrome", "(", "SIHIWES", ",", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...
[ " ", "one", "in", " ", "ANKRD11", " ", "and", "one", "in", " ", "DNMT3A", ",", "associated", "with", "KBGS", "and", "Tatton-Brown-Rahman", "syndrome", "(", "TBRS", ",", "MIM#615,879", ")", ",", "respectively", "\n", "The", "genome-wide", "methylation", "prof...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "both", "of", "which", "matched", "the", "expected", "values", "(", "Table", " ", "S1", ")", "\n", "The", "15", "remaining", "patients", "carried", "16", "different", "VUS", "in", "a", "gene", "with", "an", "established", "episignature", ":", "BAFopat...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "11", "of", "them", "tested", "negative", "regarding", "established", "episignature", "profiles", "using", "EpiSign", "V5", "(", "Table", " ", "1", ")", "\n", "P12", "carries", "a", "VUS", "in", " ", "ARID", "2", "(", "c.5030", "G", " ", ">", " "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "B-HGVSVar", "O", "...
[ " ", "which", "matched", "the", "episignature", "for", "the", "associated", "Mowat-Wilson", "syndrome", "(", "MOWS", ",", "MIM", "#", "235,730", ")", "with", "moderate", "confidence", "(", "Table", " ", "1", ",", "Fig.", " ", "3", ")", "\n", "Two", "pa...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGV...
[ " ", "concordance", "between", "the", "genetic", "findings", "and", "the", "expected", "episignature", "was", "observed", "in", "approximately", "half", "of", "the", "cases", "\n", "This", "finding", "underscores", "the", "variable", "sensitivity", "of", "episigna...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "episignature", "analysis", "was", "applied", "as", "additional", "functional", "or", "phenotypic", "evidence", "to", "support", "variant", "interpretation", "\n", "The", "ACMG", "criteria", "applied", "to", "each", "variant", "are", "reported", "in", "Table"...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ " ", "epigenetic", "results", "were", "never", "used", "alone", "but", "always", "interpreted", "in", "the", "context", "of", "genetic", "and", "clinical", "data", "to", "ensure", "robust", "variant", "assessment", "\n", "Not", "all", "VUSs", "could", "be", ...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...
[ "With", "the", "advent", "of", "clinical", "exome", "sequencing", ",", "chromatinopathies", "have", "emerged", "as", "an", "expanding", "group", "of", "individually", "rare", "conditions", "showing", "partial", "phenotypic", "overlap", "\n", "Collectively", ",", "...	[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "suggesting", "they", "are", "distantly", "related", "\n", "Notably", ",", "another", "mutation", ",", "c.713C", " ", ">", " ", "T", ",", "p.(Ser238Leu", ")", ",", "has", "been", "detected", "in", "four", "Turkish", "families", "to", "date", ",", "s...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O...

[ " ", "p.(Arg111Cys", ")", "(", "rs202073531", ")", "identified", "in", "as", "biallelic", "in", "Family", "5", "and", "as", "heterozygous", "in", "Family", "6", "[", "15", ",", " ", "19", "]", "\n", "The", "p.(Pro249Leu", ")", "variant", "has", "now", ...

[ "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "B-RefSNP", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...

[ " ", "although", "the", "function", "of", "this", "phosphatase", "during", "enamel", "formation", "remains", "unclear", "[", "16", "]", "\n", "To", "date", ",", "including", "families", "reported", "here", ",", "22", "families", "with", "AI", "due", "to", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "which", "results", "primarily", "from", "the", "increased", "incidence", "of", "consanguinity", "and", "the", "resulting", "recessive", "disease", "in", "the", "Bradford", "Asian", "community", "[", "43", "]", "\n", "Previously", "published", "reports", "o...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "unlike", "many", "other", "genes", "causative", "for", "recessive", "hypoplastic", "AI", "\n", "As", "additional", "individuals", "with", "AI", "due", "to", " ", "ACP4", " ", "variants", "are", "identified", ",", "including", "via", "state-driven", "geno...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "the", "individual", "who", "carried", "compound", "heterozygous", " ", "ACP4", " ", "variants", ":", "c.626", "T", " ", ">", " ", "C", ",", "p.(Leu209Pro);c.1199C", " ", ">", " ", "A", ",", "p.(Ala400Asp", ")", ",", "also", "had", "agenesis", "of",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O",...

[ " ", "although", "the", "effect", "might", "result", "from", "reduced", "dentine", "volume", "[", "44", "]", "\n", "Of", "the", " ", "ACP4", " ", "variants", "reported", "to", "date", ",", "c.626", "T", " ", ">", " ", "C", ",", "p.(Leu209Pro", ")", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVS...

[ " ", "fifteen", "missense", ",", "one", "splice", "and", "two", "frame-breaking", "deletion", " ", "ACP4", " ", "pathogenic", "variants", "have", "been", "identified", "\n", "Most", "variants", "are", "clustered", "in", "exons", "3", "(", "3", "missense", "v...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "making", "up", "the", "majority", "of", "the", "protein", "(", "amino", "acids", "29", "-", "390", ")", ",", "a", "transmembrane", "domain", "(", "amino", "acids", "391", "-", "414", ")", "and", "a", "cytoplasmic", "domain", "(", "amino", "acids"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "denoted", "as", "the", "histidine", "acid", "phosphatase", "active", "sites", ":", "amino", "acids", "32", "-", "46", "and", "282", "-", "298", "[", "15", "]", "\n", "It", "has", "been", "suggested", "that", "biallelic", " ", "ACP4", " ", "varian...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "we", "performed", "computational", "modelling", "of", "the", "fifteen", "likely", "pathogenic", "missense", " ", "ACP4", " ", "variants", "and", ",", "for", "comparison", ",", "three", "likely", "ACP4", "missense", "polymorphisms", ",", "using", "Rosetta",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "with", "a", "range", "of", "effects", "varying", "from", "no", "effect", "on", "stability", "to", "very", "substantial", "changes", "\n", "The", "median", "score", "for", "disease", "causing", "variants", "was", "5.06", " ", "kcal/mol", ",", "while", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "but", "the", "relatively", "similar", "value", "may", "suggest", "that", "protein", "stability", "is", "only", "significantly", "affected", "by", "particular", "variants", "which", "are", "also", "more", "likely", "to", "exert", "a", "pathogenic", "effect"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "with", "residues", "at", "the", "interface", "between", "the", "monomers", "important", "to", "its", "structure", "and", "residues", "at", "its", "catalytic", "core", "fundamental", "to", "its", "function", "[", "15", ",", " ", "16", "]", "\n", "The"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar"...

[ " ", "Arg111Cys", "is", "predicted", "to", "maintain", "stability", "similar", "to", "wild-type", "\n", "However", ",", "the", "InterPro", "Protein", "family", "database", "predicts", "that", "residues", "41", ",", "44", ",", "111", ",", "288", "and", "289",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "p.(Ala400Asp", ")", "also", "shows", "only", "a", "minor", "effect", "on", "stability", ",", "but", "this", "variant", ",", "which", "is", "in", "the", "transmembrane", "domain", "(", "residues", "391", "-", "414", ")", ",", "replaces", "a", "hydro...

[ "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...

[ " ", "ACP4-related", "AI", "teeth", "revealed", "a", "generalised", "hypoplastic", "appearance", "\n", "Clinical", "information", "suggests", "a", "characteristic", "yellow", "appearance", "of", "the", "posterior", "molars", ",", "with", "evidence", "of", "striated"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "radiographs", "before", "eruption", "are", "required", "to", "measure", "the", "enamel", "volume", "and", "exclude", "any", "post-eruptive", "breakdown", "of", "the", "enamel", "\n", "A", "previous", "study", "examining", "an", "extracted", "tooth", "from"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-H...

[ " ", "although", "this", "was", "calculated", "from", "teeth", "that", "had", "experienced", "post-eruptive", "wear", "[", "19", "]", "\n", "Further", "phenotypic", "studies", "of", "unerupted", "teeth", "are", "required", "to", "reveal", "the", "phenotypic", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "as", "well", "as", "exome", "sequencing", "[", "17", "]", "\n", "These", "data", "suggest", "that", "biallelic", " ", "ACP4", " ", "variants", "account", "for", "a", "significant", "proportion", "of", "recessive", "AI", "families", "\n", "We", "have"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "KCNQ2", " ", "variants", "were", "identified", "through", "WES", "in", "all", "patients", "\n", "All", "detected", "variants", "were", "subsequently", "confirmed", "by", "orthogonal", "methods", "when", "applicable", "(", "e.g.", ",", "Sanger", "sequencing", "f...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "parental", "origin", "or", "de", "novo", ")", "\n", "All", " ", "KCNQ2", " ", "variants", "were", "systematically", "interpreted", "using", "the", "American", "College", "of", "Medical", "Genetics", "and", "Genomics/Association", "for", "Molecular", "Patho...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "and", "(", "3", ")", "predicted", "loss", "of", "function", "for", "nonsense", ",", "frameshift", ",", "canonical", "±1/±2", "splice-site", "variants", ",", "and", "exon-level", "deletions/copy-number", "variants", "(", "PVS1", ")", "\n", "Each", "varian...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "splice-region", "variants", ")", "were", "classified", "conservatively", "without", "applying", "PVS1", "in", "the", "absence", "of", "RNA", "or", "functional", "evidence", "\n", "Familial", "segregation", "analysis", "was", "performed", "when", "parental", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "phase", "(", "in", "cis", "vs", "in", "trans", ")", "was", "not", "assumed", "unless", "formally", "determined", "\n", "For", "topology", "mapping", ",", "each", "variant", "was", "further", "assigned", "to", "transmembrane", "segments", "(", "S1-S6/po...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "drug-resistant", "seizures", "accompanied", "by", "global", "developmental", "impairment", "\n", "Neurodevelopmental", "outcomes", "were", "determined", "using", "a", "standardized", "milestone", "interview", "covering", "4", "domains", "(", "gross", "motor", ",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "<", "70", "severe", ")", "and", "were", "used", "to", "calibrate", "milestone-based", "ratings", "\n", "When", "standardized", "testing", "was", "unavailable", ",", "prespecified", "age-specific", "thresholds", "were", "applied", "as", "follows", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "We", "identified", " ", "KCNQ2", " ", "variants", "(", "RefSeq", ":", " ", "NM_172107.2", ")", "in", "30", "neonates", "\n", "Overall", ",", "32", "variant", "occurrences", "were", "observed", "across", "the", "cohort", ",", "representing", "29", "distinct"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "B-H...

[ " ", "phase", "(", "in", "cis", "vs", "in", "trans", ")", "was", "not", "determined", "and", "was", "not", "assumed", "\n", "Grouped", "by", "predicted", "effect", ",", "the", "variants", "fell", "into", "nontruncating", "and", "truncating/NMD", "categories"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "[", "p.", "E515D", ",", "paternally", "inherited", ";", "ACMG/AMP", "likely", "benign", "]", ")", ",", "2", "in-frame", "deletions", ",", "and", "1", "splice-region", "variant", "(", "total", "24/30", ",", "80", "%", ")", "\n", "In", "addition", ...

[ "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...

[ " ", "ACMG/AMP", "likely", "benign", ")", "in", "the", "same", "individual", "as", "a", "truncating", "variant", "c.109delG", "(", "p.", "D37Tfs*5", ",", "paternally", "inherited", ")", "\n", "The", "truncating/NMD", "group", "(", "predicted", "loss", "of", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...

[ " ", "Case", "29", "carried", "the", "frameshift", "(", "c.109delG", ")", "alongside", "the", "missense", "change", "\n", "Details", "are", "presented", "in", " ", "Table", "2", "\n", "By", "ACMG/AMP", "classification", ",", "17", "of", "32", "variants", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...

[ " ", "Case", "29", "had", "variants", "inherited", "from", "each", "parent", ")", ",", "10", "were", "confirmed", "de", "novo", ",", "and", "6", "were", "undetermined", "because", "of", "unavailable", "parental", "samples", "\n", "Among", "carrier", "parents...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "no", "epilepsy", "history", "was", "reported", "in", "other", "carrier", "parents", "when", "information", "was", "available", "\n", "Among", "the", "25", "patients", "with", "a", "single", " ", "KCNQ2", " ", "variant", "and", "a", "single", "variant",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "nontransmembrane", "region", "(", "mostly", "nontruncating", ")", ",", "whereas", "variants", "linked", "to", "developmental", "delay", "clustered", "within", "transmembrane", "segments-particularly", "the", "S5-pore-S6", "corridor-dominated", "by", "nontruncating",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "(", "100.2", "kb", ")", "(", "truncating/NMD", ")", "discontinued", "medication", "by", "1", "year", "and", "had", "normal", "development", "at", "2.5", "years", "(", "SeL(F)NE", "course", ")", "\n", "Two", "patients", "with", "splice-affecting", "vari...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "1", "canonical", "splice-site", "[", "truncating/NMD", "]", "and", "1", "splice-region", "[", "nontruncating", "]", ")", "likewise", "showed", "normal", "development", "at", "last", "follow-up", "(", "2.5", "and", "3.5", "years", ")", "\n", "By", "cont...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "Case", "29", "(", "missense", "+", "frameshift", ")", "required", "ongoing", "medication", "at", "5", "years", "and", "had", "significant", "delays", "\n", "In", "both", "Cases", "20", "and", "29", ",", "phase", "was", "not", "determined", "(", "Ta...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "In", "this", "two-center", "retrospective", "study", "of", "30", "neonates", "with", "epilepsy", "harboring", " ", "KCNQ2", " ", "variants", ",", "we", "systematically", "analyzed", "clinical", "features", ",", "genetic", "findings", ",", "treatment", "responses"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "with", "a", "median", "onset", "age", "of", "3", "days", "\n", "This", "early-onset", "pattern", "is", "consistent", "with", "previous", "studies", "that", "identify", " ", "KCNQ2", " ", "as", "a", "leading", "genetic", "cause", "of", "neonatal", "ep...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "this", "distribution", "aligns", "with", "earlier", "reports", "showing", "that", " ", "KCNQ2", "-related", "epilepsy", "often", "begins", "with", "focal", "tonic", "or", "motor", "seizures", "and", ",", "in", "more", "severe", "cases", "," ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "may", "progress", "to", "multifocal", "or", "generalized", "seizures", "\n", "17,19", "-", "21", "Three", "patients", "(", "10", "%", ")", "exhibited", "markedly", "abnormal", "neonatal", "EEG", "patterns", "indicative", "of", "severe", "encephalopathy-one...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "adverse", "neurodevelopment", "in", " ", "KCNQ2", "-related", "epilepsies", "\n", "Brain", "MRI", "obtained", "shortly", "after", "seizure", "onset", "was", "normal", "in", "53", "%", ";" ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "among", "abnormal", "scans", "(", "47", "%", ")", ",", "the", "most", "frequent", "findings", "were", "mild", "prominence", "of", "extra-axial", "CSF", "spaces", "and", "increased", "signal", "in", "the", "globus", "pallidus", "\n", "Major", "structura...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "longitudinal", "neuroimaging", "is", "warranted", "to", "clarify", "trajectories", "and", "their", "relevance", "to", "disease", "severity", "and", "long-term", "outcomes", "\n", "Across", "the", "cohort", ",", "we", "observed", "32", "variant", "occurrences...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "phase", "(", "in", "cis", "vs", "in", "trans", ")", "was", "not", "determined", "and", "was", "not", "assumed", "\n", "Missense", "variants", "were", "most", "common", "(", "21", "patients", ")", ",", "consistent", "with", "prior", "reports", "\n",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "in", "6", "patients", ",", "parental", "origin", "could", "not", "be", "confirmed", ",", "given", "unavailable", "samples", "\n", "These", "data", "highlight", "that", " ", "KCNQ2", " ", "variants", "arise", "both", "de", "novo", "and", "within", "fa...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "are", "predicted", "to", "impair", "channel", "function", "and", "exacerbate", "excitability", "\n", "16,25", " ", "Our", "cohort", "echoes", "these", "gradients", ":", "5", "infants", "with", "missense", "variants", "in", "or", "near", "S6", "presented"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "these", "patterns", "reinforce", "the", "clinical", "utility", "of", "variant", "topology", "for", "risk", "stratification", "\n", "The", "Kv7.2/Kv7.3", "heterotetramer", "provides", "a", "unifying", "framework", "across", "the", "SeL(F)NE-DEE", "spectrum", "\...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "and", "exon-level", "deletions", ")", "tend", "toward", "haploinsufficiency", "with", "residual", "assembly", "and", "more", "frequently", "align", "with", "SeL(F)NE", "and", "favorable", "development", "\n", "Rare", "individuals", "carrying", "2", "KCNQ3", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "variants", "(", "Cases", "20", "and", "29", ")", "\n", "Case", "20", "had", "significant", "developmental", "delay", "and", "persistent", "seizures", "despite", "treatment", "\n", "Case", "29", "achieved", "neonatal", "seizure", "control", "with", "oxcarbazepin...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "PIP", "2", "-dependent", "loss", "of", "function", "reversible", "by", "retigabine", "in", "vitro", "\n", "28", " ", "However", ",", "in", "our", "two-variant", "cases", ",", "phase", "was", "not", "determined", "and", "p.", "E515D", "was", "classifi...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "therefore", ",", "we", "can", "not", "conclude", "that", "2", "pathogenic", "alleles", "contributed", "to", "the", "phenotype", "\n", "Collectively", ",", "they", "support", "a", "dosage/topology", "framework", "whereby", "pore-region", "missense", "in", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "most", "often", "with", "monotherapy", "\n", "Among", "seizure-free", "patients", "on", "monotherapy", "(", "18/28", ",", "64", "%", ")", ",", "the", "most", "commonly", "used", "drug", "was", "oxcarbazepine", "(", "OXC", ")", ",", "a", "sodium-chann...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "6", "(", "60", "%", ")", "achieved", "seizure", "control", "after", "the", "addition", "of", "OXC", "\n", "These", "findings", "are", "consistent", "with", "Chinese", "series", "demonstrating", "OXC", "efficacy", "in", " ", "KCNQ2", "-related", "epilep...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "whereas", "ongoing", "seizures", "occurred", "exclusively", "in", "DEE", "(", "2", "patients", ")", "\n", "Most", "controlled", "patients", "entered", "remission", "within", "the", "first", "6", "months", "of", "life", ",", "a", "hallmark", "of", "SeL(...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "drug-specific", "observations-particularly", "regarding", "OXC-should", "be", "understood", "as", "associations", "rather", "than", "causal", "effects", "\n", "While", "carbamazepine", "is", "more", "frequently", "cited", "internationally", "for", "neonatal-onset", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "however", ",", "neonatal", "OXC", "use", "is", "off-label", ",", "and", ",", "in", "our", "cohort", ",", "most", "initiations", "occurred", "after", "the", "neonatal", "period", "\n", "Prospective", ",", "standardized", "studies", "are", "needed", "to"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "a", "Kv7", "opener", "that", "stabilizes", "channels", "(", "Kv7.2-Kv7.5", ")", "in", "the", "open", "state", "and", "reduces", "excitability", "\n", "31", "-", "33", " ", "Despite", "early", "promise", "for", " ", "KCNQ2", "-related", "epilepsy", ",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "Trobalt", "in", "the", "EU", ")", "was", "voluntarily", "withdrawn", "from", "US", "and", "EU", "markets", "by", "the", "manufacturer", "in", "2017", "because", "of", "concerns", "about", "skin", "and", "retinal", "discoloration", "in", "regions", "reg...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "while", "DEE", "frequently", "required", "combination", "therapy", "and", "carried", "a", "higher", "risk", "of", "persistent", "seizures", "and", "developmental", "impairment", "\n", "Given", "the", "observational", "design", "and", "potential", "confounding"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "standardized", "developmental", "testing", "was", "often", "unavailable", "in", "real-world", "practice", "(", "particularly", "among", "children", "with", "more", "pronounced", "delays", ")", ",", "so", "outcome", "assignment", "relied", "primarily", "on", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "but", "ratings", "were", "not", "masked", "dual", "reviews", "\n", "EEG", "and", "MRI", "were", "obtained", "in", "the", "neonatal", "period", "only", ";", "follow-up", "studies", "were", "performed", "opportunistically", "at", "nonstandardized", "ages", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "no", "in", "vitro", "functional", "assays", "were", "undertaken", ",", "so", "links", "between", "variant", "topology", "and", "channel", "dysfunction", "are", "inferred", "rather", "than", "directly", "demonstrated", "\n", "Finally", ",", "nonrandomized", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "which", "should", "be", "confirmed", "prospectively", "\n", "KCNQ2", "-related", "neonatal", "epilepsy", "shows", "high", "early", "seizure", "controllability", "but", "divergent", "developmental", "trajectories", "that", "are", "associated", "with", "variant", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Peripheral", "blood", "samples", "(", "10", "mL", ")", "were", "collected", "from", "all", "participants", ",", "and", "genomic", "DNA", "was", "isolated", "using", "the", "standard", "phenol-chloroform", "method", "\n", "Genomic", "DNA", "from", "index", "pa...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "To", "assess", "the", "impact", "of", "the", "c.1159", "+", "2T", ">", "A", "variant", "on", " ", "VRK1", " ", "exon", "12", "splicing", "in", "the", "affected", "individual", "(", "F8:II-1", ")", ",", "mRNA", "was", "extracted", "from", "peripheral", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O"...

[ "In", "our", "axonal", "CMTR", "cohort", ",", "AR", "families", "and", "undiagnosed", "sporadic", "cases", "accounted", "for", "45.8", "%", "(", "161/351", ")", "of", "the", "cases", "\n", "Among", "these", ",", "10", "distinct", " ", "VRK1", " ", "(", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Arg3Cys", ")", ",", "c.83T", ">", "G(p", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]

[ "Ile28Arg", ")", ",", "c.215T", ">", "G(p", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]

[ "Val72Gly", ")", ",", "c.974T", ">", "A", "(", "p.", "Leu325", "*", ")", ",", "c.879_882del", "(", "p.", "Lys295Glnfs*11", ")", ",", "c.1073_1076del(p", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "B-HGVSVar", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ "Glu361Leufs*65", ")", ",", "c.1159", "+", "2T", ">", "A", "(", "splicing", ")", ",", "and", "c.539C", ">", "T(p", "." ]

[ "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O" ]

[ "Ala180Val", ")", ",", "which", "were", "reported", "for", "the", "first", "time", "in", " ", "VRK1", "-related", "PN", "\n", "The", "variants", "c.1124G", ">", "A", "(", "p.", "Trp375", "*", ")", "and", "c.706G", ">", "A", "(", "p.", "Val236Met", ")...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar"...

[ "To", "contextualize", "these", "findings", ",", "we", "reviewed", "23", "globally", "reported", "studies", "(", "2009", "-", "2025", ")", "and", "included", "our", "cohort", ",", "compiling", "data", "from", "37", "families", "encompassing", "53", "patients",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "In", "this", "study", ",", "we", "identified", "10", " ", "VRK1", " ", "variants", "across", "8", "Chinese", "families", "diagnosed", "with", "autosomal", "recessive", "or", "sporadic", "axonal", "CMTR", "\n", "Notably", ",", "8", "of", "these", "variants",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "Exome", "capture", "was", "performed", "according", "to", "the", "Illumina", "Nextera", "Rapid", "Capture", "Enrichment", "library", "preparation", "protocol", "using", "50", " ", "ng", "of", "genomic", "DNA", "from", "patients", "\n", "Paired-end", "sequencing",...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "We", "detected", "205", "variants", "in", "our", "400", "NDD", "patients", "\n", "Thirty-two", "percent", "(", "n", " ", "=", " ", "66", ")", "of", "all", "detected", "205", "variants", "were", "in", "chromatinopathy", "genes", "\n ", "Variants", "in", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "We", "conducted", "genome-wide", "methylation", "analysis", "using", "the", "EpiSign", "platform", "for", "60", "patients", "with", "62", "different", "variants", "in", "chromatinopathy", "genes", "\n", "This", "cohort", "included", "patients", "carrying", "variant...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "patients", "were", "not", "assessed", "as", "positive", "or", "negative", "\n", "Instead", ",", "an", "unbiased", "screen", "against", "the", "EpiSign", "V5", "reference", "database", "was", "performed", "to", "determine", "whether", "the", "patient", "’...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "though", "a", "match", "does", "not", "confirm", "pathogenicity", "for", "the", "gene", "of", "interest", "\n", "Notably", ",", "two", "patients", "showed", "partial", "overlap", "with", "existing", "episignatures", ":", "P17", ",", "carrying", "a", " ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "preventing", "definitive", "classifier-based", "interpretation", "(", "Fig", "\n ", "2", ")", "\n", "23", "patients", "carried", "a", "single", "pathogenic", "or", "likely", "pathogenic", "variant", "in", "a", "gene", "with", "a", "known", "episignature", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "as", "indicated", "by", "elevated", "MVP", "scores(Fig", "." ]

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O" ]

[ " ", "2", ")", "\n", "P22", ",", "with", "a", " ", "CHD4", " ", "frameshift", "variant", "(", "c.4213del", ",", "p.(Ala1405Profs*41", ")", ",", "was", "reported", "negative", "for", "the", "associated", "Sifrim-Hitz-Weiss", "syndrome", "(", "SIHIWES", ",", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", ...

[ " ", "one", "in", " ", "ANKRD11", " ", "and", "one", "in", " ", "DNMT3A", ",", "associated", "with", "KBGS", "and", "Tatton-Brown-Rahman", "syndrome", "(", "TBRS", ",", "MIM#615,879", ")", ",", "respectively", "\n", "The", "genome-wide", "methylation", "prof...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "both", "of", "which", "matched", "the", "expected", "values", "(", "Table", " ", "S1", ")", "\n", "The", "15", "remaining", "patients", "carried", "16", "different", "VUS", "in", "a", "gene", "with", "an", "established", "episignature", ":", "BAFopat...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "11", "of", "them", "tested", "negative", "regarding", "established", "episignature", "profiles", "using", "EpiSign", "V5", "(", "Table", " ", "1", ")", "\n", "P12", "carries", "a", "VUS", "in", " ", "ARID", "2", "(", "c.5030", "G", " ", ">", " "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGVSVar", "O", "B-HGVSVar", "O", "...

[ " ", "which", "matched", "the", "episignature", "for", "the", "associated", "Mowat-Wilson", "syndrome", "(", "MOWS", ",", "MIM", "#", "235,730", ")", "with", "moderate", "confidence", "(", "Table", " ", "1", ",", "Fig.", " ", "3", ")", "\n", "Two", "pa...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "B-HGVSVar", "I-HGVSVar", "I-HGV...

[ " ", "concordance", "between", "the", "genetic", "findings", "and", "the", "expected", "episignature", "was", "observed", "in", "approximately", "half", "of", "the", "cases", "\n", "This", "finding", "underscores", "the", "variable", "sensitivity", "of", "episigna...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "episignature", "analysis", "was", "applied", "as", "additional", "functional", "or", "phenotypic", "evidence", "to", "support", "variant", "interpretation", "\n", "The", "ACMG", "criteria", "applied", "to", "each", "variant", "are", "reported", "in", "Table"...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ " ", "epigenetic", "results", "were", "never", "used", "alone", "but", "always", "interpreted", "in", "the", "context", "of", "genetic", "and", "clinical", "data", "to", "ensure", "robust", "variant", "assessment", "\n", "Not", "all", "VUSs", "could", "be", ...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...

[ "With", "the", "advent", "of", "clinical", "exome", "sequencing", ",", "chromatinopathies", "have", "emerged", "as", "an", "expanding", "group", "of", "individually", "rare", "conditions", "showing", "partial", "phenotypic", "overlap", "\n", "Collectively", ",", "...

[ "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "O", "...