mnaguib commited on
Commit
dd83dc0
·
verified ·
1 Parent(s): 88cdb48

Updated model version

Browse files
README.md CHANGED
@@ -8,40 +8,39 @@ tags:
8
  - loss:CosineSimilarityLoss
9
  base_model: dangvantuan/sentence-camembert-large
10
  widget:
11
- - source_sentence: Lors de l’exploration, est trouvée une masse kystique développée
12
- aux dépens de la surrénale.
13
  sentences:
14
- - Une fibroscopie digestive avait objectivé des varices oesophagiennes stade II.
15
- - Il n’y avait pas de foyer tumoral (Figure 5).
16
- - La paroi a été refermée sur un drainage type Mickulicz.
17
- - source_sentence: Les suites post-opératoires étaient simples.
 
18
  sentences:
19
- - Elle ne présente aucun autre antécédent médical pertinent.
20
- - Les suites opératoires étaient simple.
21
- - Le bilan d’extension comprenait une tomodensitométrie (TDM) thoraco-abdomino-pelvienne.
22
- - source_sentence: La T.D.M (Figure 2) montrait une tumeur surrénalienne surrénalien
23
- bilatérale de densité hétérogène.
24
- sentences:
25
- - L’évolution était favorable avec un recul de 12 mois.
26
- - L’exploration découvrait une tumeur surrénalienne sphérique de la taille d’une
27
- mandarine.
28
  - Une mise à plat avec ligature de l’artère hypogastrique a été réalisée.
29
- - source_sentence: La patiente ne fume pas, ne prend pas d’alcool et ne souffre d’aucune
30
- allergie médicamenteuse.
 
 
31
  sentences:
 
 
 
 
32
  - La patiente ne fume pas, ne prend que très rarement de l’alcool et n’a pas d’allergie
33
  aux médicaments.
34
- - Le reste de l’examen somatique était sans particularité.
35
- - Celle-ci semblait occuper grossièrement la forme des cavités rénales (Figure 1).
36
- - source_sentence: Le bilan étiologique, comprenant le dosage des acides à chaînes
37
- très longues, des arylsulfatases A, B et C, des hexoaminidases, de la galactosidase
38
- et de lacide lactique sérique, était négatif.
 
 
 
39
  sentences:
40
- - L’examen clinique trouvait un nodule sous-cutané, solide, mobile, sur la face
41
- dorsale du fourreau du pénis d’environ 1,5 cm de diamètre.
42
- - L’examen clinique révélait une déformation et une augmentation du volume du genou
43
- droit, un globe vésical et une fuite d’urine à la palpation de la région hypogastrique.
44
- - Une cystoprostatectomie totale avec dérivation selon Bricker est réalisée.
45
  pipeline_tag: sentence-similarity
46
  library_name: sentence-transformers
47
  ---
@@ -92,12 +91,12 @@ Then you can load this model and run inference.
92
  from sentence_transformers import SentenceTransformer
93
 
94
  # Download from the 🤗 Hub
95
- model = SentenceTransformer("mnaguib/sentence-camembert-large-finetuned-clister")
96
  # Run inference
97
  sentences = [
98
- 'Le bilan étiologique, comprenant le dosage des acides à chaînes très longues, des arylsulfatases A, B et C, des hexoaminidases, de la galactosidase et de l’acide lactique sérique, était négatif.',
99
- 'L’examen clinique trouvait un nodule sous-cutané, solide, mobile, sur la face dorsale du fourreau du pénis d’environ 1,5 cm de diamètre.',
100
- 'Une cystoprostatectomie totale avec dérivation selon Bricker est réalisée.',
101
  ]
102
  embeddings = model.encode(sentences)
103
  print(embeddings.shape)
@@ -175,19 +174,19 @@ You can finetune this model on your own dataset.
175
 
176
  #### Unnamed Dataset
177
 
178
- * Size: 200 evaluation samples
179
  * Columns: <code>id_1</code>, <code>id_2</code>, and <code>label</code>
180
- * Approximate statistics based on the first 200 samples:
181
  | | id_1 | id_2 | label |
182
  |:--------|:----------------------------------------------------------------------------------|:----------------------------------------------------------------------------------|:---------------------------------------------------------------|
183
  | type | string | string | float |
184
- | details | <ul><li>min: 8 tokens</li><li>mean: 22.58 tokens</li><li>max: 97 tokens</li></ul> | <ul><li>min: 7 tokens</li><li>mean: 21.83 tokens</li><li>max: 81 tokens</li></ul> | <ul><li>min: 0.0</li><li>mean: 2.21</li><li>max: 5.0</li></ul> |
185
  * Samples:
186
- | id_1 | id_2 | label |
187
- |:-------------------------------------------------------------------|:----------------------------------------------------------------------------------------------------|:-----------------|
188
- | <code>Le taux de PSA était de 218 ng/ml (normale ≤ 4ng/ml).</code> | <code>Le taux de PSA post-irradiation était de 1.8ng/ml et était resté stable pendant 5 ans.</code> | <code>1.0</code> |
189
- | <code>Morphine 1 à 2 mg IV</code> | <code>Morphine perfusion IV x x x x x</code> | <code>2.0</code> |
190
- | <code>Le reste de l’examen était sans particularité.</code> | <code>Le reste de l’examen est sans particularité.</code> | <code>5.0</code> |
191
  * Loss: [<code>CosineSimilarityLoss</code>](https://sbert.net/docs/package_reference/sentence_transformer/losses.html#cosinesimilarityloss) with these parameters:
192
  ```json
193
  {
@@ -202,7 +201,7 @@ You can finetune this model on your own dataset.
202
  - `per_device_train_batch_size`: 16
203
  - `per_device_eval_batch_size`: 16
204
  - `learning_rate`: 2e-05
205
- - `num_train_epochs`: 5
206
  - `warmup_ratio`: 0.1
207
  - `fp16`: True
208
  - `batch_sampler`: no_duplicates
@@ -227,7 +226,7 @@ You can finetune this model on your own dataset.
227
  - `adam_beta2`: 0.999
228
  - `adam_epsilon`: 1e-08
229
  - `max_grad_norm`: 1.0
230
- - `num_train_epochs`: 5
231
  - `max_steps`: -1
232
  - `lr_scheduler_type`: linear
233
  - `lr_scheduler_kwargs`: {}
@@ -331,7 +330,20 @@ You can finetune this model on your own dataset.
331
  ### Training Logs
332
  | Epoch | Step | Training Loss | Validation Loss |
333
  |:------:|:----:|:-------------:|:---------------:|
334
- | 2.6316 | 100 | 5.1271 | 4.4980 |
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
335
 
336
 
337
  ### Framework Versions
 
8
  - loss:CosineSimilarityLoss
9
  base_model: dangvantuan/sentence-camembert-large
10
  widget:
11
+ - source_sentence: Le toucher rectal est normal.
 
12
  sentences:
13
+ - Devant la réticence initiale, une symptomatologie délirante est suspectée, mais
14
+ elle ne sera jamais verbalisée par la patiente.
15
+ - Le toucher vaginal était normal.
16
+ - 'Sur le plan biologique , ce patient présente à l''admission :'
17
+ - source_sentence: Une résection endoscopique de la tumeur a été réalisée.
18
  sentences:
 
 
 
 
 
 
 
 
 
19
  - Une mise à plat avec ligature de l’artère hypogastrique a été réalisée.
20
+ - La figure 1 présente la chronologie des événements et de la prise des médicaments.
21
+ - L'ECBU était stérile.
22
+ - source_sentence: La quadrithérapie est poursuivie douze jours sans qu’aucune amélioration
23
+ clinique ou biologique ne soit entrevue.
24
  sentences:
25
+ - Un double abord abdominal et périnéal permit de réaliser une uréthro-cystectomie
26
+ avec colpohystérectomie suivie d’une poche iléocaecale continente périombilicale.
27
+ - Aucune récidive tumorale n’a été retrouvée par cytologie urinaire, urétéro-pyélographie
28
+ rétrograde et urétéroscopie souple.
29
  - La patiente ne fume pas, ne prend que très rarement de l’alcool et n’a pas d’allergie
30
  aux médicaments.
31
+ - source_sentence: La cystographie se révéla normale.
32
+ sentences:
33
+ - La cystographie rétrograde était normale.
34
+ - Le reste de l’urètre était normal.
35
+ - Lexamen anatomo-pathologique conclut à un carcinome indifférencié, de stade pT
36
+ 1 grade 3.
37
+ - source_sentence: Le patient a été mis sous antibiothérapie adaptée (pénicilline
38
+ A + aminoside).
39
  sentences:
40
+ - Les prélèvements de sang et d'urine sont effectués 10 heures plus tard.
41
+ - En octobre 2003, la patiente était en excellent état général.
42
+ - L’étude anatomopathologique de la biopsie était en faveur d’un adénocarcinome
43
+ à cellules claires.
 
44
  pipeline_tag: sentence-similarity
45
  library_name: sentence-transformers
46
  ---
 
91
  from sentence_transformers import SentenceTransformer
92
 
93
  # Download from the 🤗 Hub
94
+ model = SentenceTransformer("sentence_transformers_model_id")
95
  # Run inference
96
  sentences = [
97
+ 'Le patient a été mis sous antibiothérapie adaptée (pénicilline A + aminoside).',
98
+ 'En octobre 2003, la patiente était en excellent état général.',
99
+ "Les prélèvements de sang et d'urine sont effectués 10 heures plus tard.",
100
  ]
101
  embeddings = model.encode(sentences)
102
  print(embeddings.shape)
 
174
 
175
  #### Unnamed Dataset
176
 
177
+ * Size: 400 evaluation samples
178
  * Columns: <code>id_1</code>, <code>id_2</code>, and <code>label</code>
179
+ * Approximate statistics based on the first 400 samples:
180
  | | id_1 | id_2 | label |
181
  |:--------|:----------------------------------------------------------------------------------|:----------------------------------------------------------------------------------|:---------------------------------------------------------------|
182
  | type | string | string | float |
183
+ | details | <ul><li>min: 8 tokens</li><li>mean: 23.05 tokens</li><li>max: 97 tokens</li></ul> | <ul><li>min: 7 tokens</li><li>mean: 22.45 tokens</li><li>max: 88 tokens</li></ul> | <ul><li>min: 0.0</li><li>mean: 2.25</li><li>max: 5.0</li></ul> |
184
  * Samples:
185
+ | id_1 | id_2 | label |
186
+ |:---------------------------------------------------------|:-------------------------------------------------------------------|:-----------------|
187
+ | <code>L’examen clinique était sans particularité.</code> | <code>La formule sanguine était sans particularité.</code> | <code>2.0</code> |
188
+ | <code>Le bilan biologique était correct.</code> | <code>Le geste était complet.</code> | <code>0.0</code> |
189
+ | <code>La sérologie VIH était négative.</code> | <code>La cytologie urinaire pyélique droite était négative.</code> | <code>1.0</code> |
190
  * Loss: [<code>CosineSimilarityLoss</code>](https://sbert.net/docs/package_reference/sentence_transformer/losses.html#cosinesimilarityloss) with these parameters:
191
  ```json
192
  {
 
201
  - `per_device_train_batch_size`: 16
202
  - `per_device_eval_batch_size`: 16
203
  - `learning_rate`: 2e-05
204
+ - `num_train_epochs`: 10
205
  - `warmup_ratio`: 0.1
206
  - `fp16`: True
207
  - `batch_sampler`: no_duplicates
 
226
  - `adam_beta2`: 0.999
227
  - `adam_epsilon`: 1e-08
228
  - `max_grad_norm`: 1.0
229
+ - `num_train_epochs`: 10
230
  - `max_steps`: -1
231
  - `lr_scheduler_type`: linear
232
  - `lr_scheduler_kwargs`: {}
 
330
  ### Training Logs
331
  | Epoch | Step | Training Loss | Validation Loss |
332
  |:------:|:----:|:-------------:|:---------------:|
333
+ | 0.7895 | 30 | - | 4.3935 |
334
+ | 1.5789 | 60 | - | 4.3560 |
335
+ | 2.3684 | 90 | - | 4.3697 |
336
+ | 2.6316 | 100 | 5.1713 | - |
337
+ | 3.1579 | 120 | - | 4.3491 |
338
+ | 3.9474 | 150 | - | 4.3335 |
339
+ | 4.7368 | 180 | - | 4.3450 |
340
+ | 5.2632 | 200 | 4.8927 | - |
341
+ | 5.5263 | 210 | - | 4.3487 |
342
+ | 6.3158 | 240 | - | 4.3535 |
343
+ | 7.1053 | 270 | - | 4.3496 |
344
+ | 7.8947 | 300 | 4.811 | 4.3402 |
345
+ | 8.6842 | 330 | - | 4.3467 |
346
+ | 9.4737 | 360 | - | 4.3389 |
347
 
348
 
349
  ### Framework Versions
config.json CHANGED
@@ -1,5 +1,5 @@
1
  {
2
- "_name_or_path": "models/trial1/final",
3
  "architectures": [
4
  "CamembertModel"
5
  ],
 
1
  {
2
+ "_name_or_path": "dangvantuan/sentence-camembert-large",
3
  "architectures": [
4
  "CamembertModel"
5
  ],
model.safetensors CHANGED
@@ -1,3 +1,3 @@
1
  version https://git-lfs.github.com/spec/v1
2
- oid sha256:0ea520d9a9dba4ea2fc6db2a43601051bad09b65794da8d722911a0b8b7dee26
3
  size 1346690896
 
1
  version https://git-lfs.github.com/spec/v1
2
+ oid sha256:69195b5de992592ebf6c5517c64e85a51c7e62b0988b96b4b9563b1e3f4dda75
3
  size 1346690896
special_tokens_map.json CHANGED
@@ -3,27 +3,9 @@
3
  "<s>NOTUSED",
4
  "</s>NOTUSED"
5
  ],
6
- "bos_token": {
7
- "content": "<s>",
8
- "lstrip": false,
9
- "normalized": false,
10
- "rstrip": false,
11
- "single_word": false
12
- },
13
- "cls_token": {
14
- "content": "<s>",
15
- "lstrip": false,
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- "normalized": false,
17
- "rstrip": false,
18
- "single_word": false
19
- },
20
- "eos_token": {
21
- "content": "</s>",
22
- "lstrip": false,
23
- "normalized": false,
24
- "rstrip": false,
25
- "single_word": false
26
- },
27
  "mask_token": {
28
  "content": "<mask>",
29
  "lstrip": true,
@@ -31,25 +13,7 @@
31
  "rstrip": false,
32
  "single_word": false
33
  },
34
- "pad_token": {
35
- "content": "<pad>",
36
- "lstrip": false,
37
- "normalized": false,
38
- "rstrip": false,
39
- "single_word": false
40
- },
41
- "sep_token": {
42
- "content": "</s>",
43
- "lstrip": false,
44
- "normalized": false,
45
- "rstrip": false,
46
- "single_word": false
47
- },
48
- "unk_token": {
49
- "content": "<unk>",
50
- "lstrip": false,
51
- "normalized": false,
52
- "rstrip": false,
53
- "single_word": false
54
- }
55
  }
 
3
  "<s>NOTUSED",
4
  "</s>NOTUSED"
5
  ],
6
+ "bos_token": "<s>",
7
+ "cls_token": "<s>",
8
+ "eos_token": "</s>",
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
9
  "mask_token": {
10
  "content": "<mask>",
11
  "lstrip": true,
 
13
  "rstrip": false,
14
  "single_word": false
15
  },
16
+ "pad_token": "<pad>",
17
+ "sep_token": "</s>",
18
+ "unk_token": "<unk>"
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
19
  }
tokenizer.json CHANGED
The diff for this file is too large to render. See raw diff
 
tokenizer_config.json CHANGED
@@ -67,17 +67,10 @@
67
  "eos_token": "</s>",
68
  "extra_special_tokens": {},
69
  "mask_token": "<mask>",
70
- "max_length": 514,
71
- "model_max_length": 514,
72
- "pad_to_multiple_of": null,
73
  "pad_token": "<pad>",
74
- "pad_token_type_id": 0,
75
- "padding_side": "right",
76
  "sep_token": "</s>",
77
  "sp_model_kwargs": {},
78
- "stride": 0,
79
  "tokenizer_class": "CamembertTokenizer",
80
- "truncation_side": "right",
81
- "truncation_strategy": "longest_first",
82
  "unk_token": "<unk>"
83
  }
 
67
  "eos_token": "</s>",
68
  "extra_special_tokens": {},
69
  "mask_token": "<mask>",
70
+ "model_max_length": 1000000000000000019884624838656,
 
 
71
  "pad_token": "<pad>",
 
 
72
  "sep_token": "</s>",
73
  "sp_model_kwargs": {},
 
74
  "tokenizer_class": "CamembertTokenizer",
 
 
75
  "unk_token": "<unk>"
76
  }