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RAG ESL + ISLP + FES + PDSH + R4DS — ChromaDB Index (v2.2.0)

Base vectorial ChromaDB con embeddings de los capítulos de 5 libros de referencia en estadística, machine learning y data science:

  • ESLThe Elements of Statistical Learning (Hastie, Tibshirani, Friedman, 2nd Ed., 2009)
  • ISLPAn Introduction to Statistical Learning with Python (James, Witten, Hastie, Tibshirani, 2nd Ed., 2023)
  • FESFeature Engineering and Selection: A Practical Approach for Predictive Models (Kuhn, Johnson, 2019)
  • PDSHPython Data Science Handbook: Essential Tools for Working with Data (VanderPlas, 2nd Ed.)
  • R4DSR for Data Science, 2nd Edition (Wickham, Çetinkaya-Rundel, Grolemund, 2023)

Pensado para consumo por servidores MCP / clientes RAG vía huggingface_hub.snapshot_download. No es un dataset estilo Arrow/Parquet: es una carpeta ChromaDB persistente (chroma.sqlite3 + índices HNSW).

Atribución

Todo el contenido vectorizado en este dataset proviene de obras protegidas por derechos de autor de sus respectivos titulares. Las consultas que devuelven fragmentos de texto deben usarse exclusivamente como apoyo educativo y deben acompañarse de la cita al libro original. Los autores y editores son:

Libro Autores Editor / Sitio
ESL Trevor Hastie, Robert Tibshirani, Jerome Friedman Springer · https://hastie.su.domains/ElemStatLearn/
ISLP Gareth James, Daniela Witten, Trevor Hastie, Robert Tibshirani, Jonathan Taylor Springer · https://www.statlearning.com/
FES Max Kuhn, Kjell Johnson CRC Press / Chapman & Hall · http://www.feat.engineering/
PDSH Jake VanderPlas O'Reilly · https://jakevdp.github.io/PythonDataScienceHandbook/
R4DS Hadley Wickham, Mine Çetinkaya-Rundel, Garrett Grolemund O'Reilly · https://r4ds.hadley.nz/

Política de uso de los libros

Este dataset se construye y publica exclusivamente con fines académicos no comerciales (apoyo a un curso universitario de Data Science).

Libro Licencia / Disponibilidad Política
ESL Versión PDF gratuita autorizada por los autores. ✅ Incluido.
ISLP Versión PDF gratuita autorizada por los autores. ✅ Incluido.
FES Versión bookdown gratuita autorizada por los autores. ✅ Incluido.
PDSH Versión gratuita en GitHub (código MIT, texto CC BY-NC-ND). ⚠️ Incluido bajo el mismo régimen de uso académico que R4DS.
R4DS CC BY-NC-ND 3.0 US (NoDerivatives). ⚠️ Incluido para uso académico. Ver "Sobre R4DS y la cláusula NoDerivatives".

Sobre R4DS y la cláusula NoDerivatives

R for Data Science, 2nd Ed. (R4DS) está publicado bajo Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 3.0 United States. La cláusula ND restringe la creación y distribución de obras derivadas. Existe debate sobre si una indexación RAG (chunking + embeddings) constituye una obra derivada en sentido legal o un uso transformativo equivalente a una cita extensa con propósito educativo.

Decisión adoptada en este dataset:

  1. R4DS se incluye en el dataset porque su uso aquí es estrictamente académico-no-comercial, no se redistribuye el libro completo, los chunks son fragmentos cortos pensados para apoyar la enseñanza y los embeddings no permiten reconstruir el texto íntegro.
  2. Cada cita generada por las tools del MCP server lleva la atribución explícita a Wickham, Çetinkaya-Rundel y Grolemund y un disclaimer indicando que el código original está en R/tidyverse.
  3. Compromiso de takedown: si los autores o el editor (O'Reilly) consideran que esta indexación excede su política, el material se retirará en menos de 24 horas tras solicitud por issue o correo. Para acelerar el proceso, se documenta la operación así:
    # Restaurar el comportamiento previo (excluir R4DS)
    # 1. En BOOKS_CONFIG, marcar "r4ds": {..., "local_only": True}
    # 2. Republicar el dataset con --revision-tag v2.x.0
    # 3. Republicar el Space v1 con HF_USER=... uv run python deploy_to_hf_space.py
    
  4. Para usuarios que quieran un dataset estrictamente conservador: el tag anterior v2.1.0 del dataset NO contiene R4DS y queda inmutable. Pinea con revision="v2.1.0" en snapshot_download si lo prefieres así.

Si eres autor o editor de cualquiera de los libros indexados y quieres que retire este dataset, abre un issue en el repo del MCP server v2 y se hará inmediatamente.

Cambios entre versiones

Aspecto v1 (legacy) v2.0 v2.1 v2.2
Libros indexados 2 4 4 publicados + 1 local-only 5 publicados
Total chunks publicados 1977 3005 3005 3689
R4DS local-only (excluido) incluido (uso académico)
Filtrado local_only en publish sí (sin colecciones marcadas)
Distribución Empaquetado en HF Space Dataset HF independiente Idem + gating de licencia Idem + R4DS con atribución

Contenido publicado (v2.2.0)

Libro Colección ChromaDB Chunks Capítulos / archivos Cobertura
ESL esl_chapters 1093 22 Teoría estadística rigurosa, métodos lineales, árboles, boosting, SVM, redes neuronales, random forests, ensemble learning
ISLP islp_chapters 884 16 Explicaciones intuitivas, regresión, clasificación, resampling, regularización, árboles, SVM, deep learning, survival analysis
FES fes_chapters 465 13 Feature engineering práctico, encoding categóricos, ingeniería numérica, interacciones, missing data, feature selection
PDSH pdsh_chapters 563 7 Código práctico Python: IPython, NumPy, Pandas, Matplotlib, Machine Learning con scikit-learn
R4DS r4ds_chapters 684 38 Workflow iterativo de EDA (Cap. 10), data wrangling con tidyverse, visualización con ggplot2, importación, joins, factores, fechas

Total publicado: 3689 chunks vectorizados en 5 colecciones.

⚠️ R4DS está escrito en R con tidyverse, no en Python. Su valor en este dataset son los principios (ciclo iterativo de EDA, qué mirar primero, heurísticas de variación/covariación, manejo de valores faltantes), que se traducen 1-a-1 a pandas/seaborn. Cualquier consumidor del MCP server debe presentar el código resultante en el lenguaje del usuario, no copiar R como solución.

Cómo usarlo

from huggingface_hub import snapshot_download
import chromadb
from chromadb.utils.embedding_functions import SentenceTransformerEmbeddingFunction

# Descargar el índice (se cachea automáticamente)
local_path = snapshot_download(
    repo_id="gusdelact/rag-esl-islp-chromadb",
    repo_type="dataset",
    revision="v2.2.0",  # opcional: pin a un tag
)

# Conectar a ChromaDB
client = chromadb.PersistentClient(path=local_path)
embed = SentenceTransformerEmbeddingFunction(model_name="all-MiniLM-L6-v2")

# Consultar cualquiera de las 5 colecciones publicadas
esl = client.get_collection("esl_chapters", embedding_function=embed)
islp = client.get_collection("islp_chapters", embedding_function=embed)
fes = client.get_collection("fes_chapters", embedding_function=embed)
pdsh = client.get_collection("pdsh_chapters", embedding_function=embed)
r4ds = client.get_collection("r4ds_chapters", embedding_function=embed)

# Ejemplo: búsqueda semántica
res = r4ds.query(
    query_texts=["exploratory data analysis iterative cycle"],
    n_results=3,
)
print(res["documents"][0][0][:500])

⚠️ Asegúrate de instanciar el embedding_function con el mismo modelo que se usó en la ingesta (all-MiniLM-L6-v2); si usas otro, las queries no producirán resultados coherentes.

Uso con el MCP Server v2

Este dataset es el backend del MCP Server RAG Books v2, que expone 4 herramientas:

Tool Descripción
search_theory Búsqueda semántica en los 5 libros (o filtrar por libro específico). book ∈ {esl, islp, fes, pdsh, r4ds, both, all}.
get_section Recuperar una sección específica por referencia exacta (libro + capítulo + sección).
cite_foundation Fundamentación teórica multi-libro: intuitivo (ISLP) → riguroso (ESL) → práctico (FES) → código Python (PDSH) → workflow R/tidyverse traducido a pandas (R4DS).
list_available_topics Listar todos los capítulos y secciones indexados.

El server descarga este dataset automáticamente con snapshot_download la primera vez que se invoca una tool.

Pipeline de generación

  1. Los capítulos en formato Markdown se extraen de los originales (PDFs en ESL/ISLP/PDSH, bookdown en FES, .qmd en R4DS) con scripts de extracción. No se incluyen los archivos originales en este dataset por respeto a las licencias de los libros.
  2. rag_books_mcp.ingest los divide en chunks (~600 tokens, overlap ~100), limpia artefactos de extracción (frontmatter YAML, marcadores de página, números sueltos, copyright notices) y vectoriza con sentence-transformers/all-MiniLM-L6-v2.
  3. publish_chroma_dataset.py copia el chroma_db/ a un staging temporal, elimina las colecciones marcadas local_only=True (en v2.2.0 ninguna lo está) y sube el resto a este dataset.

Código fuente: rag-books-mcp-v2

Embedding

Atributo Valor
Modelo sentence-transformers/all-MiniLM-L6-v2
Dimensión 384
Distancia cosine
Backend ChromaDB persistente con HNSW
HNSW config ef_construction=100, max_neighbors=16, ef_search=100

Metadata por chunk

Cada chunk almacena los siguientes campos de metadata:

Campo Tipo Descripción
book str Clave del libro (esl, islp, fes, pdsh, r4ds)
book_full_name str Nombre completo del libro con autores
chapter str Título del capítulo
section str Título de la sección
section_level int Nivel del header markdown (1-3)
chunk_index int Índice del chunk dentro de la sección
total_chunks_in_section int Total de chunks en esa sección
file str Nombre del archivo fuente

Licencia del dataset

Los embeddings y los fragmentos cortos de texto derivados se publican bajo Apache 2.0. Los libros originales son propiedad de sus autores y editores (Springer, CRC Press, O'Reilly). Este dataset NO incluye los PDFs ni reproduce los libros completos; contiene únicamente fragmentos de texto necesarios para la operación del RAG.

Ver "Política de uso de los libros" arriba para la decisión por libro, incluyendo el caso especial de R4DS bajo CC BY-NC-ND.

Referencias

Reproducibilidad

Atributo Valor
Embedding model sentence-transformers/all-MiniLM-L6-v2
Chunker custom (Markdown-aware, ~600 tokens, overlap ~100)
Total chunks publicados 3689
Colecciones publicadas 5 (esl_chapters, islp_chapters, fes_chapters, pdsh_chapters, r4ds_chapters)
ChromaDB version >=0.5.0
Versión del paquete rag-books-mcp-v2 2.2.0
Tag HF v2.2.0
Tag previo (sin R4DS) v2.1.0
Fecha de generación Mayo 2026

Re-generar localmente:

git clone <repo-del-mcp-server-v2>
cd rag-books-mcp-v2
uv sync
uv run python -m rag_books_mcp.ingest --books-dir /ruta/a/ebook
HF_USER=tu-usuario HF_TOKEN=hf_xxx uv run python publish_chroma_dataset.py \
    --revision-tag v2.2.0
Downloads last month
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Spaces using gusdelact/rag-esl-islp-chromadb 2