LiteFold/SwissSidechain · Datasets at Hugging Face

D:DFVL

DFVL

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)C(C)(C)F

DFVL.pdb

D_SMI/DFVL.smi

D_PDB/DFVL.pdb

D_MOL2/DFVL.mol2

D_top/DFVL.top

D_rtp/DFVL.rtp

D_rtp/DFVL.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DFV" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "OXT", "FG3", "HA", "HG11", "HG12", "HG13", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "O", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

19

9

10

DFVL.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "OXT", "FG3", "HA", "HG11", "HG12", "HG13", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "O.co2", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.386, 0.0005, 0.0751, -0.3107, 0.0992, -0.0324, -0.0324, -0.8486, -0.2438, 0.0183, 0.0259, 0.0259, 0.0259, 0.0259, 0.0259, 0.0259, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

19

18

-1.0001

DFVLL

0

3-Fluoro-valine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "FG3", "CG1", "HG11", "HG12", "HG13", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "F1", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.34, -0.34, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

16

DFVL

3-Fluoro-valine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "FG3", "CG1", "HG11", "HG12", "HG13", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "F1", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.34, -0.34, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

16

2

4

3

4,107

8

D:DGBT

DGBT

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCNC(=[NH2])N

DGBT.pdb

D_SMI/DGBT.smi

D_PDB/DGBT.pdb

D_MOL2/DGBT.mol2

D_top/DGBT.top

D_rtp/DGBT.rtp

D_rtp/DGBT.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DGB" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "ND", "CE", "NZ1", "NZ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD", "HZ11", "HZ12", "HZ21", "HZ22", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "N", "C", "N", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

24

11

13

DGBT.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "ND", "CE", "NZ1", "NZ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD", "HZ11", "HZ12", "HZ21", "HZ22", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "N.pl3", "C.cat", "N.pl3", "N.pl3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.384, -0.0306, 0.0722, -0.3108, -0.0295, 0.0634, -0.2788, 0.341, -0.2919, -0.2919, -0.8487, 0.0153, 0.0283, 0.0283, 0.0654, 0.0654, 0.2578, 0.2545, 0.2545, 0.2545, 0.2545, -0.0891, -0.0891, -0.0891 ]

24

23

-0.0104

DGBTT

1

Guanidinobutryric

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "ND", "HD", "CE", "NZ2", "HZ22", "HZ21", "NZ1", "HZ12", "HZ11", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NC2", "HC", "C", "NC2", "HC", "HC", "NC2", "HC", "HC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.2, 0.09, 0.09, -0.7, 0.44, 0.64, -0.8, 0.46, 0.46, -0.8, 0.46, 0.46, 0.51, -0.51 ]

21

DGBT

Guanidinobutryric

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "ND", "HD", "CE", "NZ2", "HZ22", "HZ21", "NZ1", "HZ12", "HZ11", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NC2", "HC", "C", "NC2", "HC", "HC", "NC2", "HC", "HC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.2, 0.09, 0.09, -0.7, 0.44, 0.64, -0.8, 0.46, 0.46, -0.8, 0.46, 0.46, 0.51, -0.51 ]

21

3

7

27

36,963

2

D:DGGB

DGGB

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCON=C(N)N

DGGB.pdb

D_SMI/DGGB.smi

D_PDB/DGGB.pdb

D_MOL2/DGGB.mol2

D_top/DGGB.top

D_rtp/DGGB.rtp

D_rtp/DGGB.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DGG" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OD", "NE", "CZ", "NH1", "NH2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HH11", "HH12", "HH21", "HH22", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "N", "C", "N", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

24

12

DGGB.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OD", "NE", "CZ", "NH1", "NH2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HH11", "HH12", "HH21", "HH22", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "O.2", "N.pl3", "C.cat", "N.pl3", "N.pl3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.384, -0.0303, 0.0722, -0.3108, -0.0218, 0.1347, -0.3249, 0.1157, 0.4202, -0.2863, -0.2863, -0.8487, 0.0153, 0.0287, 0.0287, 0.0739, 0.0739, 0.2548, 0.2548, 0.2548, 0.2548, -0.0891, -0.0891, -0.0891 ]

24

23

-0.0099

DGGB

0

Canavanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "HG1", "HG2", "OD", "NE", "CZ", "NH2", "HH21", "HH22", "NH1", "HH12", "HH11", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "OCC", "N=C", "CC", "NH2", "H", "H", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.1, 0.09, 0.09, -0.217, -0.513, 0.55, -0.85, 0.4, 0.4, -0.85, 0.4, 0.4, 0.51, -0.51 ]

21

DGGB

Canavanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "HG1", "HG2", "OD", "NE", "CZ", "NH2", "HH21", "HH22", "NH1", "HH12", "HH11", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "OCC", "N=C", "CC", "NH2", "H", "H", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.1, 0.09, 0.09, -0.217, -0.513, 0.55, -0.85, 0.4, 0.4, -0.85, 0.4, 0.4, 0.51, -0.51 ]

21

5

6

81

110,889

2

D:DGHG

DGHG

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)C[C@H](O)C(=O)N

DGHG.pdb

D_SMI/DGHG.smi

D_PDB/DGHG.pdb

D_MOL2/DGHG.mol2

D_top/DGHG.top

D_rtp/DGHG.rtp

D_rtp/DGHG.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DGH" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OG1", "CD", "NE2", "OE1", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HG1", "HE21", "HE22", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "C", "N", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

21

11

10

DGHG.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OG1", "CD", "NE2", "OE1", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HG1", "HE21", "HE22", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "O.3", "C.2", "N.am", "O.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.384, -0.0307, 0.0722, -0.3108, -0.0255, 0.1295, -0.3826, 0.2391, -0.3272, -0.2732, -0.8487, 0.0153, 0.0282, 0.0282, 0.0689, 0.2104, 0.145, 0.145, -0.0891, -0.0891, -0.0891 ]

21

20

-1.0002

DGHG

-0

(2s,4s)-2,5-diamino-4-hydroxy-5-oxopentanoic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "OG1", "HG1", "CD", "OE1", "NE2", "HE21", "HE22", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CC", "O", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, 0.55, -0.55, -0.62, 0.32, 0.3, 0.51, -0.51 ]

18

DGHG

(2s,4s)-2,5-diamino-4-hydroxy-5-oxopentanoic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "OG1", "HG1", "CD", "OE1", "NE2", "HE21", "HE22", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CC", "O", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, 0.55, -0.55, -0.62, 0.32, 0.3, 0.51, -0.51 ]

18

4

6

36

49,284

5

D:DGL

DGL

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCC(=O)O

DGL.pdb

D_SMI/DGL.smi

D_PDB/DGL.pdb

D_MOL2/DGL.mol2

D_top/DGL.top

D_rtp/DGL.rtp

D_rtp/DGL.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DGL" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "OE1", "OE2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

18

10

8

DGL.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "OE1", "OE2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.021, 0.342, -0.2483, -0.0458, 0.0482, 0.356, -0.2464, -0.2464, -0.2483, 0.0198, 0.0259, 0.0259, 0.0378, 0.0378, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

18

17

-0.0004

DGL

-1

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "OE1", "OE2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "OC", "OC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.28, 0.09, 0.09, 0.62, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]

15

DGL

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "OE1", "OE2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "OC", "OC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.28, 0.09, 0.09, 0.62, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]

15

3

4

27

36,963

7

D:DGME

DGME

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCC(=O)OC

DGME.pdb

D_SMI/DGME.smi

D_PDB/DGME.pdb

D_MOL2/DGME.mol2

D_top/DGME.top

D_rtp/DGME.rtp

D_rtp/DGME.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DGM" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "OE1", "OE2", "CZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "O", "O", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

22

11

DGME.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "OE1", "OE2", "CZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.2", "O.2", "O.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.021, 0.342, -0.2483, -0.0459, 0.0439, 0.3068, -0.2509, -0.4679, 0.0817, -0.2483, 0.0198, 0.0259, 0.0259, 0.0377, 0.0377, 0.0661, 0.0661, 0.0661, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

22

21

-0.0002

DGME

0

5-o-methyl-glutamic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "OE2", "OE1", "CZ", "HZ2", "HZ1", "HZ3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "OCC", "O", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.12, 0.09, 0.09, 0.66, -0.43, -0.57, 0.01, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

19

DGME

5-o-methyl-glutamic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "OE2", "OE1", "CZ", "HZ2", "HZ1", "HZ3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "OCC", "O", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.12, 0.09, 0.09, 0.66, -0.43, -0.57, 0.01, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

19

3

5

81

110,889

8

D:DGN

DGN

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCC(=O)N

DGN.pdb

D_SMI/DGN.smi

D_PDB/DGN.pdb

D_MOL2/DGN.mol2

D_top/DGN.top

D_rtp/DGN.rtp

D_rtp/DGN.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DGN" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "NE2", "OE1", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE21", "HE22", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "N", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

20

10

DGN.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "NE2", "OE1", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE21", "HE22", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.2", "N.am", "O.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.0209, 0.342, -0.2483, -0.0477, 0.0227, 0.2104, -0.3293, -0.276, -0.2483, 0.0198, 0.0259, 0.0259, 0.0358, 0.0358, 0.1449, 0.1449, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

20

19

-0.0002

DGN

0

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "OE1", "NE2", "HE21", "HE22", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.55, -0.55, -0.62, 0.32, 0.3, 0.51, -0.51 ]

17

DGN

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "OE1", "NE2", "HE21", "HE22", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.55, -0.55, -0.62, 0.32, 0.3, 0.51, -0.51 ]

17

6

5

36

49,284

9

D:DGPA

DGPA

D

[NH3][C@@H](C($O)$O)CNC(=[NH2])N

DGPA.pdb

D_SMI/DGPA.smi

D_PDB/DGPA.pdb

D_MOL2/DGPA.mol2

D_top/DGPA.top

D_rtp/DGPA.rtp

D_rtp/DGPA.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "GDP" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "NG", "CD", "NE1", "NE2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HE11", "HE12", "HE21", "HE22", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "N", "C", "N", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

21

10

11

DGPA.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "NG", "CD", "NE1", "NE2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HE11", "HE12", "HE21", "HE22", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.3", "O.3", "C.3", "N.pl3", "C.cat", "N.pl3", "N.pl3", "O.3", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3858, 0.0139, 0.2819, -0.1894, 0.057, -0.2801, 0.3409, -0.2919, -0.2919, -0.1894, 0.0171, 0.064, 0.064, 0.2577, 0.2545, 0.2545, 0.2545, 0.2545, -0.0893, -0.0893, -0.0893 ]

21

20

0.9897

DGPAR

1

2-Amino-3-guanidinopropionic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "NG", "HG", "CD", "NE1", "HE11", "HE12", "NE2", "HE22", "HE21", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "NC2", "HC", "C", "NC2", "HC", "HC", "NC2", "HC", "HC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.2, 0.09, 0.09, -0.7, 0.44, 0.64, -0.8, 0.46, 0.46, -0.8, 0.46, 0.46, 0.51, -0.51 ]

18

DGPA

2-Amino-3-guanidinopropionic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "NG", "HG", "CD", "NE1", "HE11", "HE12", "NE2", "HE22", "HE21", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "NC2", "HC", "C", "NC2", "HC", "HC", "NC2", "HC", "HC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.2, 0.09, 0.09, -0.7, 0.44, 0.64, -0.8, 0.46, 0.46, -0.8, 0.46, 0.46, 0.51, -0.51 ]

18

3

6

9

12,321

9

D:DHCS

DHCS

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCS

DHCS.pdb

D_SMI/DHCS.smi

D_PDB/DHCS.pdb

D_MOL2/DHCS.mol2

D_top/DHCS.top

D_rtp/DHCS.rtp

D_rtp/DHCS.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DHC" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "SD", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "S", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

17

8

9

DHCS.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "SD", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "S.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.0212, 0.3421, -0.2483, -0.0472, -0.0103, -0.1783, -0.2483, 0.0198, 0.0262, 0.0262, 0.0373, 0.0373, 0.1016, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

17

16

-0.0003

DHCS

0

homocysteine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "HD", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "S", "HS", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.11, 0.09, 0.09, -0.23, 0.16, 0.51, -0.51 ]

14

DHCS

homocysteine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "HD", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "S", "HS", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.11, 0.09, 0.09, -0.23, 0.16, 0.51, -0.51 ]

14

2

5

9

12,321

5

D:DHGA

DHGA

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCC(=O)NO

DHGA.pdb

D_SMI/DHGA.smi

D_PDB/DHGA.pdb

D_MOL2/DHGA.mol2

D_top/DHGA.top

D_rtp/DHGA.rtp

D_rtp/DHGA.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DHG" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "NE2", "OE1", "OZ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE", "HZ" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "N", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

21

11

10

DHGA.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "NE2", "OE1", "OZ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE", "HZ" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.2", "N.am", "O.2", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.0209, 0.342, -0.2483, -0.0477, 0.0249, 0.2354, -0.1975, -0.2737, -0.2952, -0.2483, -0.0889, -0.0889, -0.0889, 0.0198, 0.0259, 0.0259, 0.0358, 0.0358, 0.1822, 0.2414 ]

21

20

-0.0003

DHGA

0

glutamine hydroxamate

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "OE1", "NE2", "HE", "OZ", "HZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "NH1", "H", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.12, 0.09, 0.09, 0.57, -0.57, -0.4, 0.37, -0.43, 0.4, 0.51, -0.51 ]

18

DHGA

glutamine hydroxamate

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "OE1", "NE2", "HE", "OZ", "HZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "NH1", "H", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.12, 0.09, 0.09, 0.57, -0.57, -0.4, 0.37, -0.43, 0.4, 0.51, -0.51 ]

18

4

6

54

73,926

1

D:DHHK

DHHK

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCCCCC[NH3]

DHHK.pdb

D_SMI/DHHK.smi

D_PDB/DHHK.pdb

D_MOL2/DHHK.mol2

D_top/DHHK.top

D_rtp/DHHK.rtp

D_rtp/DHHK.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DHH" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE", "CZ", "CH", "NJ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ1", "HZ2", "HH1", "HH2", "HJ1", "HJ2", "HJ3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

31

12

19

DHHK.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE", "CZ", "CH", "NJ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ1", "HZ2", "HH1", "HH2", "HJ1", "HJ2", "HJ3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "N.4", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.0205, 0.342, -0.2483, -0.056, -0.0541, -0.0532, -0.0548, -0.0689, -0.0963, 0.3781, -0.2483, 0.0198, 0.0254, 0.0254, 0.0265, 0.0265, 0.0265, 0.0265, 0.0265, 0.0265, 0.0247, 0.0247, 0.0049, 0.0049, -0.0901, -0.0901, -0.0901, -0.0889, -0.0889, -0.08...

31

30

-0.0004

DHHK

1

(2s)-2,8-diaminooctanoic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "HE2", "HE1", "CZ", "HZ1", "HZ2", "CH", "HH1", "HH2", "NJ", "HJ1", "HJ2", "HJ3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NH3", "HC", "HC", "HC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.21, 0.05, 0.05, -0.3, 0.33, 0.33, 0.33, 0.51, -0.51 ]

28

DHHK

(2s)-2,8-diaminooctanoic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "HE2", "HE1", "CZ", "HZ1", "HZ2", "CH", "HH1", "HH2", "NJ", "HJ1", "HJ2", "HJ3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NH3", "HC", "HC", "HC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.21, 0.05, 0.05, -0.3, 0.33, 0.33, 0.33, 0.51, -0.51 ]

28

2

9

729

998,001

2

D:DHI

DHI

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1c[nH]cn1

DHI.pdb

D_SMI/DHI.smi

D_PDB/DHI.pdb

D_MOL2/DHI.mol2

D_top/DHI.top

D_rtp/DHI.rtp

D_rtp/DHI.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DHI" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD2", "ND1", "CE1", "NE2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "HE2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "N", "C", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

20

11

9

DHI.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD2", "ND1", "CE1", "NE2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "HE2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "N.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.026, 0.3424, -0.2482, -0.0118, 0.0578, 0.0242, -0.2409, 0.0936, -0.3506, -0.2482, 0.0202, 0.0318, 0.0318, 0.0825, 0.1027, 0.1662, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

20

0.0001

DHW

1

Protonated D-His

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "ND1", "CG", "CE1", "HE1", "NE2", "HE2", "CD2", "HD2", "C", "O", "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "ND1", "HD1", "CG", "CE1", "HE1", "NE2", "CD2", "HD2", "C", "O", "N", "HN", "CA", "HA", "...

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "NR2", "CPH1", "CPH2", "HR1", "NR1", "H", "CPH1", "HR3", "C", "O", "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "NR1", "H", "CPH1", "CPH2", "HR1", "NR2", "CPH1", "HR3", "C", "O", "NH1", "H", "CT1", "...

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.08, 0.09, 0.09, -0.7, 0.22, 0.25, 0.13, -0.36, 0.32, -0.05, 0.09, 0.51, -0.51, -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, 0.09, -0.36, 0.32, -0.05, 0.25, 0.13, -0.7, 0.22, 0.1, 0.51, -0.51, -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0...

52

55

DH5

Neutral D-histidine, proton on NE2

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "ND1", "CG", "CE1", "HE1", "NE2", "HE2", "CD2", "HD2", "C", "O", "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "ND1", "HD1", "CG", "CE1", "HE1", "NE2", "CD2", "HD2", "C", "O", "N", "HN", "CA", "HA", "...

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "NR2", "CPH1", "CPH2", "HR1", "NR1", "H", "CPH1", "HR3", "C", "O", "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "NR1", "H", "CPH1", "CPH2", "HR1", "NR2", "CPH1", "HR3", "C", "O", "NH1", "H", "CT1", "...

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.08, 0.09, 0.09, -0.7, 0.22, 0.25, 0.13, -0.36, 0.32, -0.05, 0.09, 0.51, -0.51, -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, 0.09, -0.36, 0.32, -0.05, 0.25, 0.13, -0.7, 0.22, 0.1, 0.51, -0.51, -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0...

52

55

22

21

6

9

12,321

8

D:DHIL

DHIL

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)[C@H]([C@@H](C)O)C

DHIL.pdb

D_SMI/DHIL.smi

D_PDB/DHIL.pdb

D_MOL2/DHIL.mol2

D_top/DHIL.top

D_rtp/DHIL.rtp

D_rtp/DHIL.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DHI" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD2", "OD1", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HG11", "HG21", "HG22", "HG23", "HD11", "HD21", "HD22", "HD23" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

23

10

13

DHIL.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD2", "OD1", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HG11", "HG21", "HG22", "HG23", "HD11", "HD21", "HD22", "HD23" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3837, -0.0378, 0.0276, -0.5515, -0.026, 0.0538, -0.0613, -0.0387, -0.3918, -0.5515, -0.0891, -0.0891, -0.0891, 0.0148, 0.031, 0.0592, 0.0233, 0.0233, 0.0233, 0.2098, 0.0255, 0.0255, 0.0255 ]

23

22

-0.9996

DHIL4

0

4-Hydroxy-L-isoleucine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "CG1", "HG11", "OD1", "HD11", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "CD2", "HD21", "HD22", "HD23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

20

DHIL

4-Hydroxy-L-isoleucine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "CG1", "HG11", "OD1", "HD11", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "CD2", "HD21", "HD22", "HD23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

20

2

7

9

12,321

4

D:DHL1

DHL1

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCC(C)C

DHL1.pdb

D_SMI/DHL1.smi

D_PDB/DHL1.pdb

D_MOL2/DHL1.mol2

D_top/DHL1.top

D_rtp/DHL1.rtp

D_rtp/DHL1.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DHL" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE1", "CE2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD", "HE11", "HE12", "HE13", "HE21", "HE22", "HE23" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

25

10

15

DHL1.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE1", "CE2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD", "HE11", "HE12", "HE13", "HE21", "HE22", "HE23" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3834, -0.0428, 0.0273, -0.5515, -0.0609, -0.0519, -0.0468, -0.0627, -0.0627, -0.5515, -0.0891, -0.0891, -0.0891, 0.0144, 0.0253, 0.0253, 0.0267, 0.0267, 0.0295, 0.0232, 0.0232, 0.0232, 0.0232, 0.0232, 0.0232 ]

25

24

-1.0003

DHL1U

0

Homoleucine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD", "CE1", "HE11", "HE12", "HE13", "CE2", "HE21", "HE22", "HE23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

22

DHL1

Homoleucine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD", "CE1", "HE11", "HE12", "HE13", "CE2", "HE21", "HE22", "HE23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

22

2

7

27

36,963

3

D:DHLU

DHLU

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)[C@H]([C@@H](C)C)O

DHLU.pdb

D_SMI/DHLU.smi

D_PDB/DHLU.pdb

D_MOL2/DHLU.mol2

D_top/DHLU.top

D_rtp/DHLU.rtp

D_rtp/DHLU.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DHL" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "OH", "OXT", "HA", "HB", "HG", "HD11", "HD12", "HD13", "HD21", "HD22", "HD23", "HH", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

23

10

13

DHLU.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "OH", "OXT", "HA", "HB", "HG", "HD11", "HD12", "HD13", "HD21", "HD22", "HD23", "HH", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3851, -0.0174, 0.0122, -0.5528, 0.05, -0.019, -0.0478, -0.0601, -0.3928, -0.6327, 0.0169, 0.0583, 0.0322, 0.1015, 0.0269, 0.0269, 0.0233, 0.0233, 0.0233, 0.2097, -0.089, -0.089, -0.089 ]

23

22

-1

DHLU

0

2s,3s)-2-amino-3-hydroxy-4-methylpentanoic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OH", "HH", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "HD12", "HD13", "CD2", "HD21", "HD22", "HD23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

20

DHLU

2s,3s)-2-amino-3-hydroxy-4-methylpentanoic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OH", "HH", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "HD12", "HD13", "CD2", "HD21", "HD22", "HD23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

20

2

7

9

12,321

8

D:DHOX

DHOX

D

[NH3][C@@H](C($O)$O)Cc1ccc(cc1)N

DHOX.pdb

D_SMI/DHOX.smi

D_PDB/DHOX.pdb

D_MOL2/DHOX.mol2

D_top/DHOX.top

D_rtp/DHOX.rtp

D_rtp/DHOX.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "HOX" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "NH", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HH1", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

25

13

12

DHOX.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "NH", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HH1", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.3", "O.3", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.pl3", "O.3", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3839, -0.0132, 0.2793, -0.1895, -0.0355, -0.0486, -0.0569, -0.0569, -0.0408, -0.0408, 0.0246, -0.358, -0.1895, 0.0143, 0.0299, 0.0299, 0.0621, 0.0621, 0.0636, 0.0636, 0.1423, 0.1423, -0.0894, -0.0894, -0.0894 ]

25

0

DHOX

-0

4-amino-L-phenylalanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "NH", "HH1", "HH2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.1, -0.9, 0.4, 0.4, 0.51, -0.51 ]

22

23

DHOX

4-amino-L-phenylalanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "NH", "HH1", "HH2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.1, -0.9, 0.4, 0.4, 0.51, -0.51 ]

22

23

4

8

6

8,214

4

D:DHPE

DHPE

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCc1ccccc1

DHPE.pdb

D_SMI/DHPE.smi

D_PDB/DHPE.pdb

D_MOL2/DHPE.mol2

D_top/DHPE.top

D_rtp/DHPE.rtp

D_rtp/DHPE.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DHP" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE1", "CE2", "CZ1", "CZ2", "CH", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HZ1", "HZ2", "HH" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

26

13

DHPE.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE1", "CE2", "CZ1", "CZ2", "CH", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HZ1", "HZ2", "HH" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3834, -0.0425, 0.0273, -0.5515, -0.0571, -0.0288, -0.0474, -0.0586, -0.0586, -0.0615, -0.0615, -0.0617, -0.5515, -0.0891, -0.0891, -0.0891, 0.0144, 0.0256, 0.0256, 0.0313, 0.0313, 0.062, 0.062, 0.0618, 0.0618, 0.0618 ]

26

-0.9997

DHPE

-0

Homophenylalanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "CE2", "HE2", "CE1", "HE1", "CZ2", "HZ2", "CZ1", "HZ1", "CH", "HH", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

23

24

DHPE

Homophenylalanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "CE2", "HE2", "CE1", "HE1", "CZ2", "HZ2", "CZ1", "HZ1", "CH", "HH", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

23

24

2

9

18

24,642

8

D:DHQA

DHQA

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1cnc2c(c1)cccc2O

DHQA.pdb

D_SMI/DHQA.smi

D_PDB/DHQA.pdb

D_MOL2/DHQA.mol2

D_top/DHQA.top

D_rtp/DHQA.rtp

D_rtp/DHQA.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DHQ" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "NE1", "CZ1", "CZ2", "CH1", "CH2", "OH1", "CJ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HZ2", "HH1", "HH2", "HJ" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "C", "C", "O", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

29

17

12

DHQA.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "NE1", "CZ1", "CZ2", "CH1", "CH2", "OH1", "CJ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HZ2", "HH1", "HH2", "HJ" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3842, -0.0294, 0.0724, -0.3108, -0.0335, -0.0299, 0.0315, -0.0479, 0.0042, -0.251, 0.1122, -0.0523, 0.1427, -0.0576, -0.5046, -0.018, -0.8487, -0.0891, -0.0891, -0.0891, 0.0155, 0.0301, 0.0301, 0.0832, 0.0627, 0.0624, 0.2922, 0.0619, 0.0655 ]

29

30

-1.0002

DHQA

-0

3-(8-hydroxyquinolin-3-yl)-l-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "NE1", "CZ1", "CD2", "HD2", "CE2", "CZ2", "HZ2", "CH1", "OH1", "HH1", "CH2", "HH2", "CJ", "HJ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "NPYD", "CA", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.16, 0.15, -0.62, 0.31, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

26

28

DHQA

3-(8-hydroxyquinolin-3-yl)-l-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "NE1", "CZ1", "CD2", "HD2", "CE2", "CZ2", "HZ2", "CH1", "OH1", "HH1", "CH2", "HH2", "CJ", "HJ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "NPYD", "CA", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.16, 0.15, -0.62, 0.31, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

26

28

2

9

12

16,428

1

D:DHRG

DHRG

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCCCNC(=[NH2])N

DHRG.pdb

D_SMI/DHRG.smi

D_PDB/DHRG.pdb

D_MOL2/DHRG.mol2

D_top/DHRG.top

D_rtp/DHRG.rtp

D_rtp/DHRG.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DHR" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE", "NZ", "CH", "NJ1", "NJ2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ", "HJ11", "HJ12", "HJ21", "HJ22" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "N", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

30

13

17

DHRG.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE", "NZ", "CH", "NJ1", "NJ2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ", "HJ11", "HJ12", "HJ21", "HJ22" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "N.pl3", "C.cat", "N.pl3", "N.pl3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.0205, 0.342, -0.2483, -0.0559, -0.0512, -0.0223, 0.0645, -0.2787, 0.341, -0.2919, -0.2919, -0.2483, -0.0889, -0.0889, -0.0889, 0.0198, 0.0254, 0.0254, 0.0266, 0.0266, 0.0296, 0.0296, 0.0655, 0.0655, 0.2578, 0.2545, 0.2545, 0.2545, 0.2545 ]

30

29

0.9897

DHRG

1

homoarginine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "HE2", "HE1", "NZ", "HZ", "CH", "NJ1", "HJ11", "HJ12", "NJ2", "HJ21", "HJ22", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NC2", "HC", "C", "NC2", "HC", "HC", "NC2", "HC", "HC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.2, 0.09, 0.09, -0.7, 0.44, 0.64, -0.8, 0.46, 0.46, -0.8, 0.46, 0.46, 0.51, -0.51 ]

27

DHRG

homoarginine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "HE2", "HE1", "NZ", "HZ", "CH", "NJ1", "HJ11", "HJ12", "NJ2", "HJ21", "HJ22", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NC2", "HC", "C", "NC2", "HC", "HC", "NC2", "HC", "HC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.2, 0.09, 0.09, -0.7, 0.44, 0.64, -0.8, 0.46, 0.46, -0.8, 0.46, 0.46, 0.51, -0.51 ]

27

3

9

243

332,667

6

D:DHRP

DHRP

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1c[nH]c2c1cc(O)cc2

DHRP.pdb

D_SMI/DHRP.smi

D_PDB/DHRP.pdb

D_MOL2/DHRP.mol2

D_top/DHRP.top

D_rtp/DHRP.rtp

D_rtp/DHRP.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DHR" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "OZ3", "CH2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "O", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

28

16

12

DHRP.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "OZ3", "CH2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3842, -0.0294, 0.0724, -0.3108, -0.0329, -0.0234, 0.0059, 0.0062, 0.047, -0.0108, -0.3604, -0.0343, 0.1176, -0.5067, -0.0182, -0.8487, 0.0155, 0.0301, 0.0301, 0.081, 0.1653, 0.0661, 0.0639, 0.2921, 0.0655, -0.0891, -0.0891, -0.0891 ]

28

29

-1

DHRP

-0

5-Hydroxy-tryptophan

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CE3", "HE3", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "OZ3", "HZ3", "CH2", "HH2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

25

27

DHRP

5-Hydroxy-tryptophan

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CE3", "HE3", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "OZ3", "HZ3", "CH2", "HH2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

25

27

2

9

12,321

1

D:DHSE

DHSE

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCO

DHSE.pdb

D_SMI/DHSE.smi

D_PDB/DHSE.pdb

D_MOL2/DHSE.mol2

D_top/DHSE.top

D_rtp/DHSE.rtp

D_rtp/DHSE.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DHS" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OD", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

17

8

9

DHSE.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OD", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.0226, 0.3421, -0.2483, -0.0326, 0.0432, -0.3951, -0.2483, -0.0889, -0.0889, -0.0889, 0.0199, 0.0276, 0.0276, 0.0556, 0.0556, 0.2094 ]

17

16

-0.0003

DHSER

0

homoserine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "OD", "HD", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.05, 0.09, 0.09, -0.66, 0.43, 0.51, -0.51 ]

14

DHSE

homoserine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "OD", "HD", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.05, 0.09, 0.09, -0.66, 0.43, 0.51, -0.51 ]

14

2

5

9

12,321

3

D:DHTR

DHTR

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)[C@H](c1c[nH]c2c1cccc2)O

DHTR.pdb

D_SMI/DHTR.smi

D_PDB/DHTR.pdb

D_MOL2/DHTR.mol2

D_top/DHTR.top

D_rtp/DHTR.rtp

D_rtp/DHTR.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DHT" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OH", "OXT", "HA", "HB", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

28

16

12

DHTR.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OH", "OXT", "HA", "HB", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.389, 0.0511, 0.3448, -0.2481, 0.0795, 0.0048, 0.0083, 0.0052, 0.0468, -0.0522, -0.3603, -0.0378, -0.0611, -0.0598, -0.3882, -0.2481, 0.0227, 0.0633, 0.0811, 0.1653, 0.0624, 0.0638, 0.0618, 0.2102, 0.0618, -0.0887, -0.0887, -0.0887 ]

28

29

0.0002

DHTR

0

beta-hydroxytryptophane

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OH", "HH", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CE3", "HE3", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "HZ3", "CH2", "HH2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

25

27

DHTR

beta-hydroxytryptophane

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OH", "HH", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CE3", "HE3", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "HZ3", "CH2", "HH2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

25

27

2

10

9

12,321

2

D:DHVA

DHVA

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)C(C)(C)O

DHVA.pdb

D_SMI/DHVA.smi

D_PDB/DHVA.pdb

D_MOL2/DHVA.mol2

D_top/DHVA.top

D_rtp/DHVA.rtp

D_rtp/DHVA.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DHV" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "OG3", "OXT", "HA", "HG11", "HG12", "HG13", "HG21", "HG22", "HG23", "HG3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

20

9

11

DHVA.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "OG3", "OXT", "HA", "HG11", "HG12", "HG13", "HG21", "HG22", "HG23", "HG3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3858, -0.0046, 0.0748, -0.3107, 0.0536, -0.0375, -0.0375, -0.3904, -0.8487, 0.018, 0.0257, 0.0257, 0.0257, 0.0257, 0.0257, 0.0257, 0.2101, -0.089, -0.089, -0.089 ]

20

19

-0.9999

DHVA

0

3-hydroxy-l-valine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "OG3", "HG3", "CG1", "HG11", "HG12", "HG13", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "OH1", "H", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.23, -0.66, 0.43, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

17

DHVA

3-hydroxy-l-valine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "OG3", "HG3", "CG1", "HG11", "HG12", "HG13", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "OH1", "H", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.23, -0.66, 0.43, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

17

2

5

3

4,107

8

D:DI2M

DI2M

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)C(CC)(C)C

DI2M.pdb

D_SMI/DI2M.smi

D_PDB/DI2M.pdb

D_MOL2/DI2M.mol2

D_top/DI2M.top

D_rtp/DI2M.rtp

D_rtp/DI2M.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DI2" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CG3", "CD1", "OXT", "HA", "HG11", "HG12", "HG21", "HG22", "HG23", "HG31", "HG32", "HG33", "HD11", "HD12", "HD13", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

25

10

15

DI2M.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CG3", "CD1", "OXT", "HA", "HG11", "HG12", "HG21", "HG22", "HG23", "HG31", "HG32", "HG33", "HD11", "HD12", "HD13", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3874, 0.0257, 0.3425, -0.2482, -0.0379, -0.0517, -0.0608, -0.0608, -0.0648, -0.2482, 0.0203, 0.0267, 0.0267, 0.0235, 0.0235, 0.0235, 0.0235, 0.0235, 0.0235, 0.023, 0.023, 0.023, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

25

24

0.0002

DI2M

0

3-methyl-l-alloisoleucine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG3", "HG31", "HG32", "HG33", "CG2", "HG22", "HG21", "HG23", "CG1", "HG11", "HG12", "CD1", "HD11", "HD12", "HD13", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

22

DI2M

3-methyl-l-alloisoleucine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG3", "HG31", "HG32", "HG33", "CG2", "HG22", "HG21", "HG23", "CG1", "HG11", "HG12", "CD1", "HD11", "HD12", "HD13", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

22

2

6

9

12,321

4

D:DIGL

DIGL

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)[C@H]1Cc2c(C1)cccc2

DIGL.pdb

D_SMI/DIGL.smi

D_PDB/DIGL.pdb

D_MOL2/DIGL.mol2

D_top/DIGL.top

D_rtp/DIGL.rtp

D_rtp/DIGL.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DIG" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CH1", "CH2", "OXT", "HA", "HB", "HG11", "HG12", "HG21", "HG22", "HE1", "HE2", "HH1", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

27

14

13

DIGL.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CH1", "CH2", "OXT", "HA", "HB", "HG11", "HG12", "HG21", "HG22", "HE1", "HE2", "HH1", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3836, -0.0393, 0.0276, -0.5515, -0.041, -0.0255, -0.0255, -0.044, -0.044, -0.0583, -0.0583, -0.0615, -0.0615, -0.5515, 0.0147, 0.0294, 0.0316, 0.0316, 0.0316, 0.0316, 0.062, 0.062, 0.0618, 0.0618, -0.0891, -0.0891, -0.0891 ]

27

28

-0.9999

DIGL

-0

3-methyl-l-alloisoleucine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG1", "HG11", "HG12", "CG2", "HG21", "HG22", "CD1", "CD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CH1", "HH1", "CH2", "HH2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

24

26

DIGL

3-methyl-l-alloisoleucine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG1", "HG11", "HG12", "CG2", "HG21", "HG22", "CD1", "CD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CH1", "HH1", "CH2", "HH2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

24

26

2

9

3

4,107

8

D:DIL

DIL

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)[C@H](CC)C

DIL.pdb

D_SMI/DIL.smi

D_PDB/DIL.pdb

D_MOL2/DIL.mol2

D_top/DIL.top

D_rtp/DIL.rtp

D_rtp/DIL.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DIL" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD1", "OXT", "HA", "HB", "HG11", "HG12", "HG21", "HG22", "HG23", "HD11", "HD12", "HD13", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

22

9

13

DIL.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD1", "OXT", "HA", "HB", "HG11", "HG12", "HG21", "HG22", "HG23", "HD11", "HD12", "HD13", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3872, 0.0231, 0.3423, -0.2482, -0.047, -0.0543, -0.0634, -0.0651, -0.2482, 0.0201, 0.0287, 0.0265, 0.0265, 0.0232, 0.0232, 0.0232, 0.023, 0.023, 0.023, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

22

21

0.0001

DIL

0

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "CG1", "HG11", "HG12", "CD", "HD1", "HD2", "HD3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

19

DIL

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "CG1", "HG11", "HG12", "CD", "HD1", "HD2", "HD3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

19

2

6

9

12,321

5

D:DIYR

DIYR

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1cc(c(cc1)O)I

DIYR.pdb

D_SMI/DIYR.smi

D_PDB/DIYR.pdb

D_MOL2/DIYR.mol2

D_top/DIYR.top

D_rtp/DIYR.rtp

D_rtp/DIYR.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DIY" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OZ", "OXT", "IE1", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HZ", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "I", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

24

14

10

DIYR.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OZ", "OXT", "IE1", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HZ", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "O.co2", "I", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0245, 0.3423, -0.2482, -0.0305, -0.0472, -0.042, -0.0551, 0.055, -0.0189, 0.1299, -0.5057, -0.2482, -0.04, 0.0201, 0.0302, 0.0302, 0.0632, 0.0621, 0.0654, 0.2922, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

24

-0.0001

DIYR

0

3-iodo-tyrosine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "IE1", "CE2", "HE2", "CZ", "OZ", "HZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "I", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.08, -0.08, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]

21

22

DIYR

3-iodo-tyrosine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "IE1", "CE2", "HE2", "CZ", "OZ", "HZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "I", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.08, -0.08, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]

21

22

2

7

12

16,428

2

D:DKYN

DKYN

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CC(=O)c1ccccc1N

DKYN.pdb

D_SMI/DKYN.smi

D_PDB/DKYN.pdb

D_MOL2/DKYN.mol2

D_top/DKYN.top

D_rtp/DKYN.rtp

D_rtp/DKYN.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DKY" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OG", "CD", "CE1", "CE2", "NE2", "CZ1", "CZ2", "CH", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HE1", "HE21", "HE22", "HZ1", "HZ2", "HH", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

27

15

12

DKYN.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OG", "CD", "CE1", "CE2", "NE2", "CZ1", "CZ2", "CH", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HE1", "HE21", "HE22", "HZ1", "HZ2", "HH", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.2", "O.2", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.pl3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3874, 0.0275, 0.3424, -0.2482, 0.0077, 0.1639, -0.292, 0.0379, -0.0495, 0.0351, -0.3574, -0.061, -0.0404, -0.06, -0.2482, 0.0202, 0.0334, 0.0334, 0.0625, 0.1423, 0.1423, 0.0618, 0.0636, 0.0618, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

27

-0.0002

DKYN

0

kynurenine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "OG", "CD", "CE2", "NE2", "HE21", "HE22", "CE1", "HE1", "CZ2", "HZ2", "CZ1", "HZ1", "CH", "HH", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "CA", "CA", "NH2", "H", "H", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.55, -0.55, 0, 0.1, -0.9, 0.4, 0.4, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

24

25

DKYN

kynurenine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "OG", "CD", "CE2", "NE2", "HE21", "HE22", "CE1", "HE1", "CZ2", "HZ2", "CZ1", "HZ1", "CH", "HH", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "CA", "CA", "NH2", "H", "H", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.55, -0.55, 0, 0.1, -0.9, 0.4, 0.4, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

24

25

4

8

36

49,284

8

D:DLDO

DLDO

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCCCO

DLDO.pdb

D_SMI/DLDO.smi

D_PDB/DLDO.pdb

D_MOL2/DLDO.mol2

D_top/DLDO.top

D_rtp/DLDO.rtp

D_rtp/DLDO.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DLD" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE", "OZ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA1", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HOZ" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

23

10

13

DLDO.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE", "OZ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA1", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HOZ" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.0205, 0.342, -0.2483, -0.0559, -0.052, -0.0298, 0.0442, -0.395, -0.2483, -0.0889, -0.0889, -0.0889, 0.0198, 0.0254, 0.0254, 0.0266, 0.0266, 0.0287, 0.0287, 0.0557, 0.0557, 0.2094 ]

23

22

-0.0002

DLDO

0

6-hydroxy-l-norleucine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "HE1", "HE2", "OZ", "HOZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.05, 0.09, 0.09, -0.66, 0.43, 0.51, -0.51 ]

20

DLDO

6-hydroxy-l-norleucine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "HE1", "HE2", "OZ", "HOZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.05, 0.09, 0.09, -0.66, 0.43, 0.51, -0.51 ]

20

2

7

81

110,889

8

D:DLE

DLE

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CC(C)C

DLE.pdb

D_SMI/DLE.smi

D_PDB/DLE.pdb

D_MOL2/DLE.mol2

D_top/DLE.top

D_rtp/DLE.rtp

D_rtp/DLE.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DLE" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HD11", "HD12", "HD13", "HD21", "HD22", "HD23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

22

9

13

DLE.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HD11", "HD12", "HD13", "HD21", "HD22", "HD23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.0207, 0.342, -0.2483, -0.0536, -0.0477, -0.0627, -0.0627, -0.2483, 0.0198, 0.0257, 0.0257, 0.0295, 0.0232, 0.0232, 0.0232, 0.0232, 0.0232, 0.0232, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

22

21

-0.0003

DLE

0

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "HD12", "HD13", "CD2", "HD21", "HD22", "HD23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

19

DLE

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "HD12", "HD13", "CD2", "HD21", "HD22", "HD23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

19

2

6

9

12,321

2

D:DLE1

DLE1

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)C(C)(C)S

DLE1.pdb

D_SMI/DLE1.smi

D_PDB/DLE1.pdb

D_MOL2/DLE1.mol2

D_top/DLE1.top

D_rtp/DLE1.rtp

D_rtp/DLE1.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DLE" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "SG3", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HG11", "HG12", "HG13", "HG21", "HG22", "HG23", "HG3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "S", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

20

9

11

DLE1.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "SG3", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HG11", "HG12", "HG13", "HG21", "HG22", "HG23", "HG3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "S.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.388, 0.0346, 0.3433, -0.2482, 0.0053, -0.052, -0.052, -0.1731, -0.2482, -0.0888, -0.0888, -0.0888, 0.0211, 0.0242, 0.0242, 0.0242, 0.0242, 0.0242, 0.0242, 0.1021 ]

20

19

-0.0003

DLE1

0

Penicillamine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "SG3", "HG3", "CG2", "HG23", "HG21", "HG22", "CG1", "HG11", "HG12", "HG13", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "S", "HS", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.07, -0.23, 0.16, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

17

DLE1

Penicillamine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "SG3", "HG3", "CG2", "HG23", "HG21", "HG22", "CG1", "HG11", "HG12", "HG13", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "S", "HS", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.07, -0.23, 0.16, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

17

2

5

3

4,107

3

D:DLED

DLED

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)C[C@@H](C)C=O

DLED.pdb

D_SMI/DLED.smi

D_PDB/DLED.pdb

D_MOL2/DLED.mol2

D_top/DLED.top

D_rtp/DLED.rtp

D_rtp/DLED.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DLE" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "OE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HD11", "HD12", "HD13", "HD2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

21

10

11

DLED.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "OE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HD11", "HD12", "HD13", "HD2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.2", "O.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.0211, 0.3421, -0.2483, -0.047, 0.0107, -0.056, 0.1231, -0.3008, -0.2483, 0.0198, 0.0261, 0.0261, 0.0371, 0.0236, 0.0236, 0.0236, 0.1029, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

21

20

-0.0002

DLED

0

(4r)-5-oxo-l-leucine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "HD12", "HD13", "CD2", "HD2", "OE", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "HCO", "O", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, 0.06, -0.57, 0.51, -0.51 ]

18

DLED

(4r)-5-oxo-l-leucine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "HD12", "HD13", "CD2", "HD2", "OE", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "HCO", "O", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, 0.06, -0.57, 0.51, -0.51 ]

18

3

6

27

36,963

1

D:DLEF

DLEF

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)C[C@@H](CF)C

DLEF.pdb

D_SMI/DLEF.smi

D_PDB/DLEF.pdb

D_MOL2/DLEF.mol2

D_top/DLEF.top

D_rtp/DLEF.rtp

D_rtp/DLEF.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DLE" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "OXT", "F1", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HD11", "HD12", "HD21", "HD22", "HD23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

22

10

12

DLEF.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "OXT", "F1", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HD11", "HD12", "HD21", "HD22", "HD23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "O.co2", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.0208, 0.342, -0.2483, -0.051, -0.0165, 0.0927, -0.0601, -0.2483, -0.2488, 0.0198, 0.0258, 0.0258, 0.0323, 0.0617, 0.0617, 0.0233, 0.0233, 0.0233, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

22

21

-0.0001

DLEF

0

(4s)-5-fluoro-l-leucine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "HD12", "F1", "CD2", "HD21", "HD22", "HD23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "CT2", "HA", "HA", "F1", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.09, 0.09, 0.16, 0.09, 0.09, -0.34, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

19

DLEF

(4s)-5-fluoro-l-leucine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "HG", "CD1", "HD11", "HD12", "F1", "CD2", "HD21", "HD22", "HD23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "CT2", "HA", "HA", "F1", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.09, 0.09, 0.16, 0.09, 0.09, -0.34, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

19

2

6

27

36,963

9

D:DLME

DLME

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)[C@@H](CC(=O)O)C

DLME.pdb

D_SMI/DLME.smi

D_PDB/DLME.pdb

D_MOL2/DLME.mol2

D_top/DLME.top

D_rtp/DLME.rtp

D_rtp/DLME.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DLM" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD", "OE1", "OE2", "OXT", "HA", "HB", "HG11", "HG12", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

21

11

10

DLME.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD", "OE1", "OE2", "OXT", "HA", "HB", "HG11", "HG12", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3836, -0.0397, 0.0276, -0.5515, -0.0417, 0.0506, -0.0631, 0.3562, -0.2464, -0.2464, -0.5515, 0.0147, 0.0291, 0.0381, 0.0381, 0.0232, 0.0232, 0.0232, -0.0891, -0.0891, -0.0891 ]

21

20

-1

DLME

-1

(3r)-3-methyl-l-glutamic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "CG1", "HG12", "HG11", "CD", "OE1", "OE2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "OC", "OC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.28, 0.09, 0.09, 0.62, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]

18

DLME

(3r)-3-methyl-l-glutamic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "CG1", "HG12", "HG11", "CD", "OE1", "OE2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "OC", "OC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.28, 0.09, 0.09, 0.62, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]

18

3

5

27

36,963

7

D:DLVN

DLVN

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)[C@@H](C=O)C

DLVN.pdb

D_SMI/DLVN.smi

D_PDB/DLVN.pdb

D_MOL2/DLVN.mol2

D_top/DLVN.top

D_rtp/DLVN.rtp

D_rtp/DLVN.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DLV" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "OG1", "OXT", "HA", "HB", "HG11", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

18

9

DLVN.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "OG1", "OXT", "HA", "HB", "HG11", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.2", "C.3", "O.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3839, -0.0337, 0.028, -0.5515, 0.0038, 0.1219, -0.0572, -0.3008, -0.5515, 0.0151, 0.0359, 0.1028, 0.0236, 0.0236, 0.0236, -0.0891, -0.0891, -0.0891 ]

18

17

-0.9998

DLVN

0

4-oxo-l-valine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG1", "HG11", "OG1", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "C", "HCO", "O", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, 0.51, 0.06, -0.57, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

15

DLVN

4-oxo-l-valine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG1", "HG11", "OG1", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "C", "HCO", "O", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, 0.51, 0.06, -0.57, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

15

3

5

9

12,321

6

D:DLY

DLY

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCCC[NH3]

DLY.pdb

D_SMI/DLY.smi

D_PDB/DLY.pdb

D_MOL2/DLY.mol2

D_top/DLY.top

D_rtp/DLY.rtp

D_rtp/DLY.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DLY" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE", "NZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

25

10

15

DLY.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE", "NZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "N.4", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.0205, 0.342, -0.2483, -0.0561, -0.0558, -0.069, -0.0963, 0.3781, -0.2483, 0.0198, 0.0254, 0.0254, 0.0264, 0.0264, 0.0247, 0.0247, 0.0049, 0.0049, -0.0901, -0.0901, -0.0901, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

25

24

-0.0005

DLY

1

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "HE1", "HE2", "NZ", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NH3", "HC", "HC", "HC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.21, 0.05, 0.05, -0.3, 0.33, 0.33, 0.33, 0.51, -0.51 ]

22

DLY

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "HE1", "HE2", "NZ", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NH3", "HC", "HC", "HC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.21, 0.05, 0.05, -0.3, 0.33, 0.33, 0.33, 0.51, -0.51 ]

22

2

7

81

110,889

9

D:DM2S

DM2S

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)C(C[S@@](C)O)(C)C

DM2S.pdb

D_SMI/DM2S.smi

D_PDB/DM2S.pdb

D_MOL2/DM2S.mol2

D_top/DM2S.top

D_rtp/DM2S.rtp

D_rtp/DM2S.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DM2" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CG1", "CG2", "SD", "CE", "OE", "OXT", "HA", "HG1", "HG11", "HG12", "HG13", "HG2", "HG21", "HG22", "HG23", "HE1", "HE2", "HE3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "S", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

27

12

15

DM2S.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CG1", "CG2", "SD", "CE", "OE", "OXT", "HA", "HG1", "HG11", "HG12", "HG13", "HG2", "HG21", "HG22", "HG23", "HE1", "HE2", "HE3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.3", "S.3", "C.3", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3874, 0.0265, 0.3426, -0.2482, -0.0273, 0.0155, -0.06, -0.06, -0.0459, -0.0001, -0.1623, -0.2482, 0.0204, 0.0395, 0.0235, 0.0235, 0.0235, 0.0395, 0.0235, 0.0235, 0.0235, 0.0355, 0.0355, 0.0355, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

27

26

0.0002

DM2S

0

3-{[(r)-methylsulfinyl]methyl}-l-valine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "CG1", "HG13", "HG11", "HG12", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "OE", "CE", "HE1", "HE2", "HE3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT0", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "SO", "O", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.01, 0.09, 0.09, 0.12, -0.5, -0.08, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

24

DM2S

3-{[(r)-methylsulfinyl [ atoms ]

[]

0

24

2

6

27

36,963

9

D:DM34

DM34

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1cc(c(cc1)C)C

DM34.pdb

D_SMI/DM34.smi

D_PDB/DM34.pdb

D_MOL2/DM34.mol2

D_top/DM34.top

D_rtp/DM34.rtp

D_rtp/DM34.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DM3" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CH", "CJ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HH1", "HH2", "HH3", "HJ1", "HJ2", "HJ3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

29

14

15

DM34.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CH", "CJ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HH1", "HH2", "HH3", "HJ1", "HJ2", "HJ3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3836, -0.0388, 0.0276, -0.5515, -0.0357, -0.0483, -0.0555, -0.0584, -0.0473, -0.0583, -0.0475, -0.0395, -0.0395, -0.5515, -0.0891, -0.0891, -0.0891, 0.0147, 0.03, 0.03, 0.0623, 0.062, 0.062, 0.0278, 0.0278, 0.0278, 0.0278, 0.0278, 0.0278 ]

29

-1.0001

DM344

-0

3,4-Dimethyl-phenylalanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD2", "HD2", "CD1", "HD1", "CE2", "HE2", "CE1", "CZ", "CJ", "HJ1", "HJ2", "HJ3", "CH", "HH1", "HH2", "HH3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0, 0, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

26

27

DM34

3,4-Dimethyl-phenylalanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD2", "HD2", "CD1", "HD1", "CE2", "HE2", "CE1", "CZ", "CJ", "HJ1", "HJ2", "HJ3", "CH", "HH1", "HH2", "HH3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0, 0, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

26

27

2

8

12

16,428

5

D:DME0

DME0

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCSCO

DME0.pdb

D_SMI/DME0.smi

D_PDB/DME0.pdb

D_MOL2/DME0.mol2

D_top/DME0.top

D_rtp/DME0.rtp

D_rtp/DME0.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DME" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "SD", "CE", "OZ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HZ" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "S", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

21

10

11

DME0.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "SD", "CE", "OZ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HZ" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "S.3", "C.3", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.0212, 0.3421, -0.2483, -0.0469, -0.0052, -0.1332, 0.0898, -0.3845, -0.2483, -0.0889, -0.0889, -0.0889, 0.0198, 0.0262, 0.0262, 0.0377, 0.0377, 0.0673, 0.0673, 0.2105 ]

21

20

-0.0002

DME0

-0

hydroxy-l-methionine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "CE", "HE1", "HE2", "OZ", "HZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT2", "HA", "HA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, 0.1, 0.09, 0.09, -0.66, 0.43, 0.51, -0.51 ]

18

DME0

hydroxy-l-methionine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "CE", "HE1", "HE2", "OZ", "HZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT2", "HA", "HA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, 0.1, 0.09, 0.09, -0.66, 0.43, 0.51, -0.51 ]

18

2

6

81

110,889

5

D:DMEG

DMEG

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)[C@H](CC(=O)O)C

DMEG.pdb

D_SMI/DMEG.smi

D_PDB/DMEG.pdb

D_MOL2/DMEG.mol2

D_top/DMEG.top

D_rtp/DMEG.rtp

D_rtp/DMEG.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DME" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD", "OE1", "OE2", "OXT", "HA", "HB", "HG11", "HG12", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

21

11

10

DMEG.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "CD", "OE1", "OE2", "OXT", "HA", "HB", "HG11", "HG12", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3836, -0.0397, 0.0276, -0.5515, -0.0417, 0.0506, -0.0631, 0.3562, -0.2464, -0.2464, -0.5515, 0.0147, 0.0291, 0.0381, 0.0381, 0.0232, 0.0232, 0.0232, -0.0891, -0.0891, -0.0891 ]

21

20

-1

DMEG

-1

(3s)-3-methyl-l-glutamic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG1", "HG12", "HG11", "CD", "OE1", "OE2", "CG2", "HG22", "HG21", "HG23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "OC", "OC", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, -0.28, 0.09, 0.09, 0.62, -0.76, -0.76, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

18

DMEG

(3s)-3-methyl-l-glutamic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG1", "HG12", "HG11", "CD", "OE1", "OE2", "CG2", "HG22", "HG21", "HG23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "OC", "OC", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, -0.28, 0.09, 0.09, 0.62, -0.76, -0.76, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

18

3

5

27

36,963

9

D:DMEN

DMEN

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CC(=O)NC

DMEN.pdb

D_SMI/DMEN.smi

D_PDB/DMEN.pdb

D_MOL2/DMEN.mol2

D_top/DMEN.top

D_rtp/DMEN.rtp

D_rtp/DMEN.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DME" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "ND", "OD1", "CE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD", "HE1", "HE2", "HE3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "N", "O", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

20

10

DMEN.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "ND", "OD1", "CE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD", "HE1", "HE2", "HE3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.2", "N.am", "O.2", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3874, 0.0288, 0.3425, -0.2482, 0.0211, 0.2117, -0.3184, -0.2759, 0.0001, -0.2482, 0.0203, 0.0347, 0.0347, 0.1484, 0.0426, 0.0426, 0.0426, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

20

19

0.0001

DMEN

-0

n-methyl asparagine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "OD1", "ND", "HD", "CE", "HE2", "HE1", "HE3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "NH1", "H", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.12, 0.09, 0.09, 0.57, -0.57, -0.73, 0.37, 0.03, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

17

DMEN

n-methyl asparagine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "OD1", "ND", "HD", "CE", "HE2", "HE1", "HE3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "NH1", "H", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.12, 0.09, 0.09, 0.57, -0.57, -0.73, 0.37, 0.03, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

17

4

5

18

24,642

1

D:DMEQ

DMEQ

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCC(=O)NC

DMEQ.pdb

D_SMI/DMEQ.smi

D_PDB/DMEQ.pdb

D_MOL2/DMEQ.mol2

D_top/DMEQ.top

D_rtp/DMEQ.rtp

D_rtp/DMEQ.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DME" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "NE2", "OE1", "CZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE2", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "N", "O", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

23

11

12

DMEQ.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "NE2", "OE1", "CZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE2", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.2", "N.am", "O.2", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.0209, 0.342, -0.2483, -0.0477, 0.0229, 0.2127, -0.3184, -0.2758, 0.0001, -0.2483, 0.0198, 0.0259, 0.0259, 0.0358, 0.0358, 0.1484, 0.0426, 0.0426, 0.0426, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

23

22

-0.0001

DMEQ

-0

n5-methylglutamine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "OE1", "NE2", "HE2", "CZ", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "NH1", "H", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.12, 0.09, 0.09, 0.57, -0.57, -0.73, 0.37, 0.03, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

20

DMEQ

n5-methylglutamine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "OE1", "NE2", "HE2", "CZ", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "NH1", "H", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.12, 0.09, 0.09, 0.57, -0.57, -0.73, 0.37, 0.03, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

20

4

6

54

73,926

1

D:DMHO

DMHO

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CC[S@](O)C

DMHO.pdb

D_SMI/DMHO.smi

D_PDB/DMHO.pdb

D_MOL2/DMHO.mol2

D_top/DMHO.top

D_rtp/DMHO.rtp

D_rtp/DMHO.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DMH" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OD", "SD", "CE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HE3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "S", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

21

10

11

DMHO.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OD", "SD", "CE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HE3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "O.3", "S.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.0213, 0.3421, -0.2483, -0.0456, 0.0103, -0.1623, -0.0464, -0.0001, -0.2483, 0.0198, 0.0263, 0.0263, 0.039, 0.039, 0.0355, 0.0355, 0.0355, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

21

20

-0

DMHO

0

s-oxymethionine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "OD", "CE", "HE1", "HE2", "HE3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "SO", "O", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.01, 0.09, 0.09, 0.12, -0.5, -0.08, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

18

DMHO

s-oxymethionine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "OD", "CE", "HE1", "HE2", "HE3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "SO", "O", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.01, 0.09, 0.09, 0.12, -0.5, -0.08, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

18

2

5

27

36,963

1

D:DMTY

DMTY

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1cc(O)ccc1

DMTY.pdb

D_SMI/DMTY.smi

D_PDB/DMTY.pdb

D_MOL2/DMTY.mol2

D_top/DMTY.top

D_rtp/DMTY.rtp

D_rtp/DMTY.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DMT" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "OE1", "CZ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

24

13

11

DMTY.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "OE1", "CZ", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3836, -0.0388, 0.0276, -0.5515, -0.0356, -0.0451, -0.017, -0.0584, 0.1171, -0.0581, -0.5068, -0.0202, -0.5515, -0.0891, -0.0891, -0.0891, 0.0147, 0.03, 0.03, 0.0657, 0.062, 0.2921, 0.0619, 0.0654 ]

24

-1.0002

DMTY

0

m-Tyrosine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "CD2", "HD2", "CD1", "HD1", "CE2", "HE2", "CE1", "OE1", "HE1", "CZ", "HZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

21

22

DMTY

m-Tyrosine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "CD2", "HD2", "CD1", "HD1", "CE2", "HE2", "CE1", "OE1", "HE1", "CZ", "HZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

21

22

2

8

12

16,428

2

D:DNAL

DNAL

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1ccc2c(c1)cccc2

DNAL.pdb

D_SMI/DNAL.smi

D_PDB/DNAL.pdb

D_MOL2/DNAL.mol2

D_top/DNAL.top

D_rtp/DNAL.rtp

D_rtp/DNAL.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DNA" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CH1", "CH2", "CJ1", "CJ2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HH1", "HH2", "HJ1", "HJ1" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

29

16

13

DNAL.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CH1", "CH2", "CJ1", "CJ2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HH1", "HH2", "HJ1", "HJ1" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0245, 0.3423, -0.2482, -0.0306, -0.0478, -0.058, -0.0509, -0.0538, -0.0176, -0.0179, -0.054, -0.054, -0.0612, -0.0612, -0.2482, -0.0889, -0.0889, -0.0889, 0.0201, 0.0302, 0.0302, 0.062, 0.0626, 0.0624, 0.0624, 0.0624, 0.0618, 0.0618 ]

29

30

-0.0001

DNAL

0

2-Naphtalene

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD2", "HD2", "CD1", "HD1", "CE2", "CE1", "HE1", "CZ", "CH2", "HH2", "CH1", "HH1", "CJ2", "HJ2", "CJ1", "HJ1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

26

28

DNAL

2-Naphtalene

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD2", "HD2", "CD1", "HD1", "CE2", "CE1", "HE1", "CZ", "CH2", "HH2", "CH1", "HH1", "CJ2", "HJ2", "CJ1", "HJ1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

26

28

2

10

12

16,428

5

D:DNTL

DNTL

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1c2c(cc3c1cccc3)cccc2

DNTL.pdb

D_SMI/DNTL.smi

D_PDB/DNTL.pdb

D_MOL2/DNTL.mol2

D_top/DNTL.top

D_rtp/DNTL.rtp

D_rtp/DNTL.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DNT" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CH1", "CH2", "CJ1", "CJ2", "CM1", "CM2", "OXT", "CF1", "CF2", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HZ", "HH1", "HH2", "HJ1", "HJ2", "HM1", "HM2", "HF1", "HF2" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "C", "C", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

35

20

15

DNTL.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CH1", "CH2", "CJ1", "CJ2", "CM1", "CM2", "OXT", "CF1", "CF2", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HZ", "HH1", "HH2", "HJ1", "HJ2", "HM1", "HM2", "HF1", "HF2" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "C.ar", "C.ar", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3836, -0.0387, 0.0276, -0.5515, -0.0345, -0.0332, -0.0142, -0.0142, -0.017, -0.017, -0.0463, -0.0538, -0.054, -0.0612, -0.0612, -0.0612, -0.0612, -0.5515, -0.0538, -0.054, -0.0891, -0.0891, -0.0891, 0.0147, 0.0301, 0.0301, 0.063, 0.0624, 0.0624, 0.0618, ...

35

37

-0.9999

DNTLH

0

3-(9-anthryl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CF1", "HF1", "CE2", "CH1", "HH1", "CF2", "HF2", "CZ", "HZ", "CJ1", "HJ1", "CH2", "HH2", "CM1", "HM1", "CJ2", "HJ2", "CM2", "HM2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "CA", "CA", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0, 0, 0, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

32

35

DNTL

3-(9-anthryl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CF1", "HF1", "CE2", "CH1", "HH1", "CF2", "HF2", "CZ", "HZ", "CJ1", "HJ1", "CH2", "HH2", "CM1", "HM1", "CJ2", "HJ2", "CM2", "HM2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "CA", "CA", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0, 0, 0, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

32

35

2

12

6

8,214

7

D:DNVA

DNVA

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCC

DNVA.pdb

D_SMI/DNVA.smi

D_PDB/DNVA.pdb

D_MOL2/DNVA.mol2

D_top/DNVA.top

D_rtp/DNVA.rtp

D_rtp/DNVA.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DNV" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HD3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

19

8

11

DNVA.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HD3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3834, -0.0428, 0.0273, -0.5515, -0.0613, -0.0571, -0.0653, -0.5515, -0.0891, -0.0891, -0.0891, 0.0144, 0.0253, 0.0253, 0.0262, 0.0262, 0.023, 0.023, 0.023 ]

19

18

-0.9997

DNVA

0

Norvaline

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD1", "HD2", "HD3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

16

DNVA

Norvaline

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD1", "HD2", "HD3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

16

2

5

9

12,321

3

D:DOAS

DOAS

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)COC(=O)C

DOAS.pdb

D_SMI/DOAS.smi

D_PDB/DOAS.pdb

D_MOL2/DOAS.mol2

D_top/DOAS.top

D_rtp/DOAS.rtp

D_rtp/DOAS.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DOA" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "OG", "CD", "OD", "CE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HE1", "HE2", "HE3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "O", "C", "O", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

19

10

9

DOAS.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "OG", "CD", "OD", "CE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HE1", "HE2", "HE3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "O.3", "C.2", "O.2", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3893, 0.0552, 0.3453, -0.2481, 0.0898, -0.4659, 0.3039, -0.2512, 0.0332, -0.2481, 0.0232, 0.0686, 0.0686, 0.0342, 0.0342, 0.0342, -0.0887, -0.0887, -0.0887 ]

19

18

0.0003

DOAS

0

o-acetylserine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "OG", "CD", "OD", "CE", "HE3", "HE1", "HE2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "OCC", "CC", "O", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.1, 0.09, 0.09, -0.43, 0.66, -0.57, -0.21, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

16

DOAS

o-acetylserine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "OG", "CD", "OD", "CE", "HE3", "HE1", "HE2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "OCC", "CC", "O", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.1, 0.09, 0.09, -0.43, 0.66, -0.57, -0.21, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

16

3

4

27

36,963

2

D:DOBF

DOBF

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CC(F)F

DOBF.pdb

D_SMI/DOBF.smi

D_PDB/DOBF.pdb

D_MOL2/DOBF.mol2

D_top/DOBF.top

D_rtp/DOBF.rtp

D_rtp/DOBF.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DOB" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OXT", "FG1", "FG2", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "F", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

16

9

7

DOBF.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OXT", "FG1", "FG2", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "O.co2", "F", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3872, 0.0256, 0.3422, -0.2483, 0.005, 0.2383, -0.2483, -0.2093, -0.2093, -0.0889, -0.0889, -0.0889, 0.02, 0.0308, 0.0308, 0.1017 ]

16

15

-0.0003

DOBF

0

(2s)-2-amino-4,4-difluorobutanoic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "FG1", "FG2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "F2", "F2", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.59, 0.09, -0.34, -0.34, 0.51, -0.51 ]

13

DOBF

(2s)-2-amino-4,4-difluorobutanoic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "FG1", "FG2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT1", "HA", "F2", "F2", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.59, 0.09, -0.34, -0.34, 0.51, -0.51 ]

13

2

4

9

12,321

4

D:DOCY

DOCY

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CSCCO

DOCY.pdb

D_SMI/DOCY.smi

D_PDB/DOCY.pdb

D_MOL2/DOCY.mol2

D_top/DOCY.top

D_rtp/DOCY.rtp

D_rtp/DOCY.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DOC" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "SG", "CD", "CE", "OZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "S", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

21

10

11

DOCY.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "SG", "CD", "CE", "OZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "S.3", "C.3", "C.3", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3876, 0.0296, 0.3428, -0.2482, -0.0091, -0.1596, 0.0168, 0.0532, -0.3942, -0.2482, 0.0206, 0.0365, 0.0365, 0.0399, 0.0399, 0.0565, 0.0565, 0.2094, -0.0888, -0.0888, -0.0888 ]

21

20

0.0001

DOCY

0

s-(2-hydroxyethyl)-l-cysteine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "SG", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "HE2", "HE1", "OZ", "HZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, -0.13, 0.09, 0.09, 0.05, 0.09, 0.09, -0.66, 0.43, 0.51, -0.51 ]

18

DOCY

s-(2-hydroxyethyl)-l-cysteine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "SG", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "HE2", "HE1", "OZ", "HZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, -0.13, 0.09, 0.09, 0.05, 0.09, 0.09, -0.66, 0.43, 0.51, -0.51 ]

18

2

6

81

110,889

7

D:DOMT

DOMT

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCS(=O)(=O)C

DOMT.pdb

D_SMI/DOMT.smi

D_PDB/DOMT.pdb

D_MOL2/DOMT.mol2

D_top/DOMT.top

D_rtp/DOMT.rtp

D_rtp/DOMT.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DOM" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "SD", "CE", "OE1", "OE2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HE3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "S", "C", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

22

11

DOMT.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "SD", "CE", "OE1", "OE2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HE3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "S.O2", "C.3", "O.2", "O.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.384, -0.032, 0.0722, -0.3108, -0.0409, 0.0643, -0.0338, 0.0544, -0.1746, -0.1746, -0.8487, 0.0153, 0.0268, 0.0268, 0.0499, 0.0499, 0.0464, 0.0464, 0.0464, -0.0891, -0.0891, -0.0891 ]

22

21

-0.9999

DOMT

0

Methionine sulfone

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "OE1", "OE2", "CE", "HE1", "HE2", "HE3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "SO2", "OC", "OC", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.07, 0.09, 0.09, 1.08, -0.65, -0.65, -0.16, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

19

DOMT

Methionine sulfone

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "OE1", "OE2", "CE", "HE1", "HE2", "HE3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "SO2", "OC", "OC", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.07, 0.09, 0.09, 1.08, -0.65, -0.65, -0.16, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

19

2

5

27

36,963

3

D:DOMX

DOMX

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)[C@@H](c1ccc(cc1)O)O

DOMX.pdb

D_SMI/DOMX.smi

D_PDB/DOMX.pdb

D_MOL2/DOMX.mol2

D_top/DOMX.top

D_rtp/DOMX.rtp

D_rtp/DOMX.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DOM" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OH", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB", "HG", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HH" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

25

14

11

DOMX.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OH", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB", "HG", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HH" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "O.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.389, 0.0511, 0.3448, -0.2481, 0.0775, -0.02, -0.3883, -0.0527, -0.0527, -0.0198, -0.0198, 0.1169, -0.5068, -0.2481, -0.0887, -0.0887, -0.0887, 0.0227, 0.0632, 0.2102, 0.0622, 0.0622, 0.0654, 0.0654, 0.2921 ]

25

0.0003

DOMX

-0

(betar)-beta-hydroxy-l-tyrosine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG", "HG", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "OH", "HH", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]

22

23

DOMX

(betar)-beta-hydroxy-l-tyrosine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG", "HG", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "OH", "HH", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]

22

23

2

9

0

16,428

2

D:DOMY

DOMY

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)[C@@H](c1cc(c(cc1)O)Cl)O

DOMY.pdb

D_SMI/DOMY.smi

D_PDB/DOMY.pdb

D_MOL2/DOMY.mol2

D_top/DOMY.top

D_rtp/DOMY.rtp

D_rtp/DOMY.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DOM" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OH", "CL", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB", "HG", "HD1", "HD2", "HE2", "HH" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "CL", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

25

15

10

DOMY.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "OG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OH", "CL", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB", "HG", "HD1", "HD2", "HE2", "HH" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "O.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "Cl", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.389, 0.0511, 0.3448, -0.2481, 0.0776, -0.0186, -0.3883, -0.0343, -0.0526, 0.0826, -0.0184, 0.1351, -0.5053, -0.0798, -0.2481, -0.0887, -0.0887, -0.0887, 0.0227, 0.0632, 0.2102, 0.0637, 0.0622, 0.0654, 0.2922 ]

25

0.0002

DOMY

0

(betar)-3-chloro-beta-hydroxy-l-tyrosine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG", "HG", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "CL", "CE2", "HE2", "CZ", "OH", "HH", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]

22

23

DOMY

(betar)-3-chloro-beta-hydroxy-l-tyrosine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG", "HG", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "CL", "CE2", "HE2", "CZ", "OH", "HH", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CLAL", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.17, -0.17, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]

22

23

2

8

12

16,428

3

D:DONL

DONL

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCC(=O)C

DONL.pdb

D_SMI/DONL.smi

D_PDB/DONL.pdb

D_MOL2/DONL.mol2

D_top/DONL.top

D_rtp/DONL.rtp

D_rtp/DONL.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DON" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "OD", "CE", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HE3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "O", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

21

10

11

DONL.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "OD", "CE", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HE3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.2", "O.2", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3871, 0.0209, 0.342, -0.2483, -0.0493, 0.0045, 0.1303, -0.2977, -0.0061, -0.2483, -0.0889, -0.0889, -0.0889, 0.0198, 0.0258, 0.0258, 0.0341, 0.0341, 0.0306, 0.0306, 0.0306 ]

21

20

-0.0002

DONL

0

5-oxo-l-norleucine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "OD", "CE", "HE1", "HE2", "HE3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.12, 0.09, 0.09, 0.45, -0.57, -0.21, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

18

DONL

5-oxo-l-norleucine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "OD", "CE", "HE1", "HE2", "HE3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.12, 0.09, 0.09, 0.45, -0.57, -0.21, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

18

3

5

27

36,963

5

D:DPF5

DPF5

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1c(c(c(c(c1F)F)F)F)F

DPF5.pdb

D_SMI/DPF5.smi

D_PDB/DPF5.pdb

D_MOL2/DPF5.mol2

D_top/DPF5.top

D_rtp/DPF5.rtp

D_rtp/DPF5.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DPF" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "FD1", "FD2", "FE1", "FE2", "FZ", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "F", "F", "F", "F", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

23

17

6

DPF5.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "FD1", "FD2", "FE1", "FE2", "FZ", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "F", "F", "F", "F", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3836, -0.0386, 0.0276, -0.5515, -0.03, 0.0276, 0.1673, 0.1673, 0.1967, 0.1967, 0.1991, -0.5515, -0.202, -0.202, -0.1993, -0.1993, -0.1993, -0.0891, -0.0891, -0.0891, 0.0147, 0.0302, 0.0302 ]

23

-0.9998

DPF5

0

pentafluoro-phenylalanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "FD1", "CD2", "FD2", "CE1", "FE1", "CE2", "FE2", "CZ", "FZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "F1", "CA", "F1", "CA", "F1", "CA", "F1", "CA", "F1", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.19, -0.19, 0.19, -0.19, 0.19, -0.19, 0.19, -0.19, 0.19, -0.19, 0.51, -0.51 ]

20

21

DPF5

pentafluoro-phenylalanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "FD1", "CD2", "FD2", "CE1", "FE1", "CE2", "FE2", "CZ", "FZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "F1", "CA", "F1", "CA", "F1", "CA", "F1", "CA", "F1", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.19, -0.19, 0.19, -0.19, 0.19, -0.19, 0.19, -0.19, 0.19, -0.19, 0.51, -0.51 ]

20

21

2

3

6

8,214

8

D:DPFF

DPFF

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1ccc(cc1)F

DPFF.pdb

D_SMI/DPFF.smi

D_PDB/DPFF.pdb

D_MOL2/DPFF.mol2

D_top/DPFF.top

D_rtp/DPFF.rtp

D_rtp/DPFF.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DPF" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "FZ", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

23

13

10

DPFF.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "FZ", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0245, 0.3423, -0.2482, -0.0306, -0.0482, -0.0559, -0.0559, -0.0262, -0.0262, 0.1234, -0.2482, -0.2055, -0.0889, -0.0889, -0.0889, 0.0201, 0.0302, 0.0302, 0.0621, 0.0621, 0.0646, 0.0646 ]

23

-0.0002

DPFF

-0

4-Fluoro-Phenylalanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "FZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "F1", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, 0.51, -0.51 ]

20

21

DPFF

4-Fluoro-Phenylalanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "FZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "F1", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, 0.51, -0.51 ]

20

21

2

7

6

8,214

7

D:DPHI

DPHI

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1ccc(cc1)I

DPHI.pdb

D_SMI/DPHI.smi

D_PDB/DPHI.pdb

D_MOL2/DPHI.mol2

D_top/DPHI.top

D_rtp/DPHI.rtp

D_rtp/DPHI.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DPH" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "IZ", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "I", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

23

13

10

DPHI.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "IZ", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "I", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3836, -0.0388, 0.0276, -0.5515, -0.0357, -0.0485, -0.0576, -0.0576, -0.0484, -0.0484, 0.0134, -0.5515, -0.0438, -0.0891, -0.0891, -0.0891, 0.0147, 0.03, 0.03, 0.0621, 0.0621, 0.0628, 0.0628 ]

23

-1

DPHI

-0

4-Iodo-Phe

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "IZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "I", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.08, -0.08, 0.51, -0.51 ]

20

21

DPHI

4-Iodo-Phe

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "IZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "I", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.08, -0.08, 0.51, -0.51 ]

20

21

2

7

6

8,214

8

D:DPN

DPN

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1ccccc1

DPN.pdb

D_SMI/DPN.smi

D_PDB/DPN.pdb

D_MOL2/DPN.mol2

D_top/DPN.top

D_rtp/DPN.rtp

D_rtp/DPN.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DPN" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

23

12

11

DPN.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0245, 0.3423, -0.2482, -0.0306, -0.0484, -0.0586, -0.0586, -0.0615, -0.0615, -0.0617, -0.2482, 0.0201, 0.0302, 0.0302, 0.062, 0.062, 0.0618, 0.0618, 0.0618, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

23

0

DPN

0

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CE1", "HE1", "CZ", "HZ", "CD2", "HD2", "CE2", "HE2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

20

21

DPN

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CE1", "HE1", "CZ", "HZ", "CD2", "HD2", "CE2", "HE2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

20

21

2

8

18

8,214

6

D:DPO6

DPO6

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)[C@@H](C)OP(=O)(O)O

DPO6.pdb

D_SMI/DPO6.smi

D_PDB/DPO6.pdb

D_MOL2/DPO6.mol2

D_top/DPO6.top

D_rtp/DPO6.rtp

D_rtp/DPO6.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DPO" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG2", "OG1", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "OXT", "HA", "HB", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "P", "O", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

20

12

8

DPO6.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG2", "OG1", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "OXT", "HA", "HB", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "O.3", "P.3", "O.3", "O.3", "O.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3851, -0.0157, 0.0298, -0.5515, 0.0597, -0.0393, -0.2819, 0.5321, -0.1145, -0.1145, -0.2224, -0.5515, 0.0169, 0.0586, 0.0254, 0.0254, 0.0254, -0.089, -0.089, -0.089 ]

20

19

-0.9999

DPO62

-2

phosphothreonine (charge: -1)

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG1", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OCC", "PO4", "OC", "OC", "OC", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.19, 0.09, -0.55, 1.36, -1.03, -1.03, -1.03, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

17

DPO6

phosphothreonine (charge: -1)

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG1", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OCC", "PO4", "OC", "OC", "OC", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.19, 0.09, -0.55, 1.36, -1.03, -1.03, -1.03, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

17

2

4

27

36,963

9

D:DPPN

DPPN

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1ccc(cc1)N(=O)=O

DPPN.pdb

D_SMI/DPPN.smi

D_PDB/DPPN.pdb

D_MOL2/DPPN.mol2

D_top/DPPN.top

D_rtp/DPPN.rtp

D_rtp/DPPN.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DPP" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "NH", "OJ1", "OJ2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

25

15

10

DPPN.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "NH", "OJ1", "OJ2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.pl3", "O.2", "O.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3836, -0.0388, 0.0276, -0.5515, -0.0357, -0.0484, -0.0565, -0.0565, -0.0312, -0.0312, 0.1262, 0.0564, -0.1261, -0.1261, -0.5515, -0.0891, -0.0891, -0.0891, 0.0147, 0.03, 0.03, 0.0621, 0.0621, 0.064, 0.064 ]

25

-1.0001

DPPN

-0

4-Nitrophenylalanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "NH", "OJ1", "OJ2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "NH2", "OC", "OC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, 0.83, -0.47, -0.47, 0.51, -0.51 ]

22

23

DPPN

4-Nitrophenylalanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "NH", "OJ1", "OJ2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "NH2", "OC", "OC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, 0.83, -0.47, -0.47, 0.51, -0.51 ]

22

23

3

7

6

8,214

1

D:DPT6

DPT6

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1ccc(cc1)OP(=O)(O)O

DPT6.pdb

D_SMI/DPT6.smi

D_PDB/DPT6.pdb

D_MOL2/DPT6.mol2

D_top/DPT6.top

D_rtp/DPT6.rtp

D_rtp/DPT6.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DPT" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OH", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "P", "O", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

27

17

10

DPT6.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OH", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "P.3", "O.3", "O.3", "O.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3836, -0.0388, 0.0276, -0.5515, -0.0357, -0.0484, -0.0552, -0.0552, -0.0191, -0.0191, 0.1322, -0.4011, 0.5886, -0.1039, -0.1039, -0.2114, -0.5515, -0.0891, -0.0891, -0.0891, 0.0147, 0.03, 0.03, 0.0621, 0.0621, 0.0654, 0.0654 ]

27

-1.0004

DPT62

-2

phosphonotyrosine (charge: -2)

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "OH", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OCC", "PO4", "OC", "OC", "OC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.08, -0.35, 1.36, -1.03, -1.03, -1.03, 0.51, -0.51 ]

24

25

DPT6

phosphonotyrosine (charge: -2)

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "CZ", "OH", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OCC", "PO4", "OC", "OC", "OC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.08, -0.35, 1.36, -1.03, -1.03, -1.03, 0.51, -0.51 ]

24

25

2

7

36

49,284

9

D:DPZ4

DPZ4

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cn1cccn1

DPZ4.pdb

D_SMI/DPZ4.smi

D_PDB/DPZ4.pdb

D_MOL2/DPZ4.mol2

D_top/DPZ4.top

D_rtp/DPZ4.rtp

D_rtp/DPZ4.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DPZ" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "NG", "CD2", "ND1", "CE1", "CE2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "HE2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "N", "C", "N", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

20

11

9

DPZ4.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "NG", "CD2", "ND1", "CE1", "CE2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "HE2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "N.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3846, -0.0229, 0.029, -0.5515, 0.0337, -0.2727, 0.0254, -0.1797, 0.0494, -0.0242, -0.5515, 0.0162, 0.0496, 0.0496, 0.0826, 0.0848, 0.0648, -0.089, -0.089, -0.089 ]

20

-0.9998

DPZ41

-0

3-(1-Pyrazolyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "NG", "CD2", "HD2", "ND1", "CE2", "HE2", "CE1", "HE1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "NY", "C5A", "HP", "N5A", "C5B", "HP", "C5B", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.07, 0.09, 0.09, 0.32, -0.3, 0.15, -0.71, -0.15, 0.15, 0.14, 0.15, 0.51, -0.51 ]

17

18

DPZ4

3-(1-Pyrazolyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "NG", "CD2", "HD2", "ND1", "CE2", "HE2", "CE1", "HE1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "NY", "C5A", "HP", "N5A", "C5B", "HP", "C5B", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.07, 0.09, 0.09, 0.32, -0.3, 0.15, -0.71, -0.15, 0.15, 0.14, 0.15, 0.51, -0.51 ]

17

18

6

9

12,321

8

D:DQ32

DQ32

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1ccc2c(n1)cccc2

DQ32.pdb

D_SMI/DQ32.smi

D_PDB/DQ32.pdb

D_MOL2/DQ32.mol2

D_top/DQ32.top

D_rtp/DQ32.rtp

D_rtp/DQ32.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DQ3" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "ND2", "CE1", "CE2", "CZ", "CH1", "CH2", "CJ1", "CJ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HH1", "HH2", "HJ1", "HJ2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

28

16

12

DQ32.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "ND2", "CE1", "CE2", "CZ", "CH1", "CH2", "CJ1", "CJ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HH1", "HH2", "HJ1", "HJ2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0259, 0.3424, -0.2482, -0.0133, 0.0409, -0.0398, -0.2517, -0.0509, 0.0713, 0.0004, -0.0526, -0.0357, -0.0611, -0.0597, -0.2482, 0.0202, 0.0317, 0.0317, 0.0636, 0.0625, 0.0624, 0.0639, 0.0618, 0.0618, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

28

29

-0.0001

DQ322

0

3-(2-Quinolyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "ND2", "CE2", "CD1", "HD1", "CE1", "HE1", "CZ", "CH2", "HH2", "CH1", "HH1", "CJ2", "HJ2", "CJ1", "HJ1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "NPYD", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.31, -0.62, 0.31, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

25

27

DQ32

3-(2-Quinolyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "ND2", "CE2", "CD1", "HD1", "CE1", "HE1", "CZ", "CH2", "HH2", "CH1", "HH1", "CJ2", "HJ2", "CJ1", "HJ1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "NPYD", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.31, -0.62, 0.31, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

25

27

2

9

12

16,428

2

D:DQ33

DQ33

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1cnc2c(c1)cccc2

DQ33.pdb

D_SMI/DQ33.smi

D_PDB/DQ33.pdb

D_MOL2/DQ33.mol2

D_top/DQ33.top

D_rtp/DQ33.rtp

D_rtp/DQ33.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DQ3" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "NE1", "CZ", "CH1", "CH2", "CJ1", "CJ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HH1", "HH2", "HJ1", "HJ2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

28

16

12

DQ33.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "NE1", "CZ", "CH1", "CH2", "CJ1", "CJ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HH1", "HH2", "HJ1", "HJ2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0246, 0.3423, -0.2482, -0.0291, -0.0297, 0.0314, -0.048, 0.0006, -0.2547, 0.071, -0.0357, -0.0526, -0.0597, -0.0611, -0.2482, 0.0201, 0.0303, 0.0303, 0.0832, 0.0627, 0.0639, 0.0624, 0.0618, 0.0618, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

28

29

-0

DQ333

0

3-(3-quinolyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "NE1", "CZ", "CD2", "HD2", "CE2", "CH2", "HH2", "CH1", "HH1", "CJ2", "HJ2", "CJ1", "HJ1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "NPYD", "CA", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.16, 0.15, -0.62, 0.31, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

25

27

DQ33

3-(3-quinolyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "NE1", "CZ", "CD2", "HD2", "CE2", "CH2", "HH2", "CH1", "HH1", "CJ2", "HJ2", "CJ1", "HJ1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "NPYD", "CA", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.16, 0.15, -0.62, 0.31, -0.115, 0.115, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

25

27

2

9

12

16,428

7

D:DQ34

DQ34

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1c2c(ncc1)cccc2

DQ34.pdb

D_SMI/DQ34.smi

D_PDB/DQ34.pdb

D_MOL2/DQ34.mol2

D_top/DQ34.top

D_rtp/DQ34.rtp

D_rtp/DQ34.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DQ3" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "NZ", "CH1", "CH2", "CJ1", "CJ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE2", "HH1", "HH2", "HJ1", "HJ2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

28

16

12

DQ34.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "NZ", "CH1", "CH2", "CJ1", "CJ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE2", "HH1", "HH2", "HJ1", "HJ2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0245, 0.3423, -0.2482, -0.0299, -0.0378, 0.0035, -0.0399, 0.0712, 0.0285, -0.255, -0.0523, -0.0357, -0.0611, -0.0597, -0.2482, 0.0201, 0.0302, 0.0302, 0.0636, 0.083, 0.0624, 0.0639, 0.0618, 0.0618, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

28

29

-0.0002

DQ344

0

3-(4-quinolyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "CD2", "HD2", "CE2", "HE2", "NZ", "CE1", "CH1", "HH1", "CH2", "HH2", "CJ1", "HJ1", "CJ2", "HJ2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "NPYD", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0, -0.115, 0.115, 0.16, 0.15, -0.62, 0.31, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

25

27

DQ34

3-(4-quinolyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "CD2", "HD2", "CE2", "HE2", "NZ", "CE1", "CH1", "HH1", "CH2", "HH2", "CJ1", "HJ1", "CJ2", "HJ2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "NPYD", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0, -0.115, 0.115, 0.16, 0.15, -0.62, 0.31, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

25

27

2

9

12

16,428

7

D:DQ35

DQ35

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1ccc2c(c1)nccc2

DQ35.pdb

D_SMI/DQ35.smi

D_PDB/DQ35.pdb

D_MOL2/DQ35.mol2

D_top/DQ35.top

D_rtp/DQ35.rtp

D_rtp/DQ35.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DQ3" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CH1", "NH2", "CJ1", "CJ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HH1", "HJ1", "HJ2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

28

16

12

DQ35.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CH1", "NH2", "CJ1", "CJ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HH1", "HJ1", "HJ2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0245, 0.3423, -0.2482, -0.0305, -0.0464, -0.0579, -0.0326, -0.0523, 0.0712, 0.0004, -0.0511, -0.255, -0.043, 0.0283, -0.2482, 0.0201, 0.0302, 0.0302, 0.062, 0.0642, 0.0624, 0.0625, 0.0633, 0.083, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

28

29

0

DQ355

0

3-(5-Quinolyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "NH2", "CJ2", "HJ2", "CZ", "CH1", "HH1", "CJ1", "HJ1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "NPYD", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.31, -0.62, 0.16, 0.15, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

25

27

DQ35

3-(5-Quinolyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "NH2", "CJ2", "HJ2", "CZ", "CH1", "HH1", "CJ1", "HJ1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "NPYD", "CA", "HP", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.31, -0.62, 0.16, 0.15, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

25

27

2

9

12

16,428

2

D:DQ36

DQ36

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1ccc2c(c1)cncc2

DQ36.pdb

D_SMI/DQ36.smi

D_PDB/DQ36.pdb

D_MOL2/DQ36.mol2

D_top/DQ36.top

D_rtp/DQ36.rtp

D_rtp/DQ36.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DQ3" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CH1", "CH2", "CJ1", "NJ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HH1", "HH2", "HJ1", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

28

16

12

DQ36.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "CH1", "CH2", "CJ1", "NJ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HH1", "HH2", "HJ1", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0245, 0.3423, -0.2482, -0.0306, -0.0478, -0.058, -0.0494, -0.0537, 0.0005, -0.015, -0.0359, 0.0353, 0.0281, -0.2626, -0.2482, 0.0201, 0.0302, 0.0302, 0.062, 0.0627, 0.0624, 0.0639, 0.0836, 0.083, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

28

29

-0

DQ366

-0

3-(6-Quinolyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "CZ", "CH2", "HH2", "NJ2", "CJ1", "HJ1", "CH1", "HH1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CA", "CA", "HP", "NPYD", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0, 0, 0.16, 0.15, -0.62, 0.16, 0.15, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

25

27

DQ36

3-(6-Quinolyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "CZ", "CH2", "HH2", "NJ2", "CJ1", "HJ1", "CH1", "HH1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "CA", "CA", "HP", "NPYD", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0, 0, 0.16, 0.15, -0.62, 0.16, 0.15, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

25

27

2

9

12

16,428

2

D:DQX3

DQX3

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1cnc2c(n1)cccc2

DQX3.pdb

D_SMI/DQX3.smi

D_PDB/DQX3.pdb

D_MOL2/DQX3.mol2

D_top/DQX3.top

D_rtp/DQX3.rtp

D_rtp/DQX3.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DQX" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD2", "ND1", "CE1", "NE2", "CZ", "CH1", "CH2", "CJ1", "CJ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HH1", "HH2", "HJ1", "HJ2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "N", "C", "N", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

27

16

11

DQX3.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD2", "ND1", "CE1", "NE2", "CZ", "CH1", "CH2", "CJ1", "CJ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HH1", "HH2", "HJ1", "HJ2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.026, 0.3424, -0.2482, -0.0118, 0.059, 0.0495, -0.2486, 0.0895, -0.2517, 0.0892, -0.0342, -0.0342, -0.0596, -0.0596, -0.2482, 0.0202, 0.0318, 0.0318, 0.0848, 0.0639, 0.0639, 0.0618, 0.0618, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

27

28

0.0001

DQX32

0

3-(2-quinoxalyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "ND1", "CE1", "CD2", "HD2", "NE2", "CZ", "CH1", "HH1", "CH2", "HH2", "CJ1", "HJ1", "CJ2", "HJ2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "NPYD", "CA", "CA", "HP", "NPYD", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.31, -0.62, 0.31, 0.16, 0.15, -0.62, 0.31, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

24

26

DQX3

3-(2-quinoxalyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "ND1", "CE1", "CD2", "HD2", "NE2", "CZ", "CH1", "HH1", "CH2", "HH2", "CJ1", "HJ1", "CJ2", "HJ2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "NPYD", "CA", "CA", "HP", "NPYD", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.31, -0.62, 0.31, 0.16, 0.15, -0.62, 0.31, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

24

26

2

8

12

16,428

9

D:DSE2

DSE2

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)COP(=O)(O)O

DSE2.pdb

D_SMI/DSE2.smi

D_PDB/DSE2.pdb

D_MOL2/DSE2.mol2

D_top/DSE2.top

D_rtp/DSE2.rtp

D_rtp/DSE2.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DSE" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "OG", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "O", "P", "O", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

17

11

6

DSE2.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "OG", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "O.3", "P.3", "O.3", "O.2", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3855, -0.0091, 0.0743, -0.3107, 0.0521, -0.2849, 0.5318, -0.1145, -0.2224, -0.1145, -0.8487, 0.0175, 0.0553, 0.0553, -0.089, -0.089, -0.089 ]

17

16

-1

DSE22

-2

phosphoserine (charge: -2)

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "OG", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "OCC", "PO4", "OC", "OC", "OC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.1, 0.09, 0.09, -0.55, 1.36, -1.03, -1.03, -1.03, 0.51, -0.51 ]

14

DSE2

phosphoserine (charge: -2)

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "OG", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "OCC", "PO4", "OC", "OC", "OC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.1, 0.09, 0.09, -0.55, 1.36, -1.03, -1.03, -1.03, 0.51, -0.51 ]

14

2

3

27

36,963

4

D:DSEP

DSEP

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)COP(=O)(O)O

DSEP.pdb

D_SMI/DSEP.smi

D_PDB/DSEP.pdb

D_MOL2/DSEP.mol2

D_top/DSEP.top

D_rtp/DSEP.rtp

D_rtp/DSEP.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DSE" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "OG", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HOP3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "O", "P", "O", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

18

11

7

DSEP.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "OG", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HOP3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "O.3", "P.3", "O.3", "O.2", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3855, -0.0092, 0.0743, -0.3107, 0.0478, -0.3288, 0.2099, -0.4374, -0.5173, -0.3436, -0.8487, 0.0175, 0.0551, 0.0551, 0.2176, -0.089, -0.089, -0.089 ]

18

17

-1.9999

DSEP

-1

phosphoserine (charge: -1)

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "OG", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "HOP3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "OCC", "PO4", "OC", "OC", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.1, 0.09, 0.09, -0.55, 1.44, -0.95, -0.95, -0.77, 0.5, 0.51, -0.51 ]

15

DSEP

phosphoserine (charge: -1)

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "OG", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "HOP3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "OCC", "PO4", "OC", "OC", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.1, 0.09, 0.09, -0.55, 1.44, -0.95, -0.95, -0.77, 0.5, 0.51, -0.51 ]

15

2

4

27

36,963

1

D:DSG

DSG

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CC(=O)N

DSG.pdb

D_SMI/DSG.smi

D_PDB/DSG.pdb

D_MOL2/DSG.mol2

D_top/DSG.top

D_rtp/DSG.rtp

D_rtp/DSG.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DSG" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "ND2", "OD1", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD21", "HD22", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "N", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

17

9

8

DSG.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "ND2", "OD1", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD21", "HD22", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.2", "N.am", "O.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3874, 0.0288, 0.3425, -0.2482, 0.0209, 0.2094, -0.3294, -0.2761, -0.2482, 0.0203, 0.0347, 0.0347, 0.1449, 0.1449, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

17

16

-0.0001

DSG

0

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "OD1", "ND2", "HD21", "HD22", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.55, -0.55, -0.62, 0.32, 0.3, 0.51, -0.51 ]

14

DSG

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "OD1", "ND2", "HD21", "HD22", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.55, -0.55, -0.62, 0.32, 0.3, 0.51, -0.51 ]

14

6

4

18

24,642

6

D:DSLZ

DSLZ

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CSCC[NH3]

DSLZ.pdb

D_SMI/DSLZ.smi

D_PDB/DSLZ.pdb

D_MOL2/DSLZ.mol2

D_top/DSLZ.top

D_rtp/DSLZ.rtp

D_rtp/DSLZ.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DSL" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "SG", "CD", "CE", "NZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "S", "C", "C", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

23

10

13

DSLZ.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "SG", "CD", "CE", "NZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "S.3", "C.3", "C.3", "N.4", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3876, 0.0296, 0.3428, -0.2482, -0.0092, -0.1637, -0.0221, -0.0871, 0.3787, -0.2482, 0.0206, 0.0365, 0.0365, 0.0358, 0.0358, 0.0057, 0.0057, -0.09, -0.09, -0.09, -0.0888, -0.0888, -0.0888 ]

23

22

0.0004

DSLZ

1

thialysine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "SG", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "HE1", "HE2", "NZ", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NH3", "HC", "HC", "HC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, -0.13, 0.09, 0.09, 0.21, 0.05, 0.05, -0.3, 0.33, 0.33, 0.33, 0.51, -0.51 ]

20

DSLZ

thialysine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "SG", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "HE1", "HE2", "NZ", "HZ1", "HZ2", "HZ3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NH3", "HC", "HC", "HC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, -0.13, 0.09, 0.09, 0.21, 0.05, 0.05, -0.3, 0.33, 0.33, 0.33, 0.51, -0.51 ]

20

2

6

81

110,889

8

D:DSME

DSME

D

[NH3][C@@H](C($O)$O)CC[S@@](C)O

DSME.pdb

D_SMI/DSME.smi

D_PDB/DSME.pdb

D_MOL2/DSME.mol2

D_top/DSME.top

D_rtp/DSME.rtp

D_rtp/DSME.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "SME" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "SD", "CE", "OE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HE3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "S", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

21

10

11

DSME.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "SD", "CE", "OE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HE1", "HE2", "HE3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.3", "O.3", "C.3", "C.3", "S.3", "C.3", "O.3", "O.3", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3837, -0.0165, 0.279, -0.1895, -0.0505, 0.01, -0.0464, -0.0001, -0.1623, -0.1895, 0.014, 0.0259, 0.0259, 0.039, 0.039, 0.0355, 0.0355, 0.0355, -0.0894, -0.0894, -0.0894 ]

21

20

0

DSME

0

Methionine sulfoxide

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "OE", "CE", "HE3", "HE2", "HE1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "SO", "O", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.01, 0.09, 0.09, 0.12, -0.5, -0.08, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

18

DSME

Methionine sulfoxide

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "HG1", "HG2", "SD", "OE", "CE", "HE3", "HE2", "HE1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "SO", "O", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.01, 0.09, 0.09, 0.12, -0.5, -0.08, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

18

3

5

27

36,963

9

D:DSN

DSN

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CO

DSN.pdb

D_SMI/DSN.smi

D_PDB/DSN.pdb

D_MOL2/DSN.mol2

D_top/DSN.top

D_rtp/DSN.rtp

D_rtp/DSN.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DSN" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "OG", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

14

7

DSN.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "OG", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3886, 0.044, 0.3442, -0.2482, 0.0415, -0.3961, -0.2482, 0.0221, 0.0546, 0.0546, 0.2093, -0.0888, -0.0888, -0.0888 ]

14

13

-0

DSN

0

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "OG", "HG1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.05, 0.09, 0.09, -0.66, 0.43, 0.51, -0.51 ]

11

DSN

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "OG", "HG1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.05, 0.09, 0.09, -0.66, 0.43, 0.51, -0.51 ]

11

2

4

3

4,107

2

D:DSYA

DSYA

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CC=Cc1ccccc1

DSYA.pdb

D_SMI/DSYA.smi

D_PDB/DSYA.pdb

D_MOL2/DSYA.mol2

D_top/DSYA.top

D_rtp/DSYA.rtp

D_rtp/DSYA.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DSY" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE", "CZ1", "CZ2", "CH1", "CH2", "CJ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HD", "HZ1", "HZ2", "HH1", "HH2", "HJ", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

27

14

13

DSYA.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE", "CZ1", "CZ2", "CH1", "CH2", "CJ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG", "HD", "HZ1", "HZ2", "HH1", "HH2", "HJ", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.2", "C.2", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.024, 0.3423, -0.2482, -0.0374, -0.0845, -0.0586, -0.0253, -0.0546, -0.0546, -0.0612, -0.0612, -0.0617, -0.2482, 0.0201, 0.0296, 0.0296, 0.0572, 0.062, 0.0623, 0.0623, 0.0618, 0.0618, 0.0618, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

27

-0.0001

DSYAA

0

styryl-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "CD", "HD", "CE", "CZ1", "HZ1", "CZ2", "HZ2", "CH1", "HH1", "CH2", "HH2", "CJ", "HJ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CE1", "HE1", "CE1", "HE1", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.15, 0.15, -0.15, 0.15, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

24

25

DSYA

styryl-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG", "CD", "HD", "CE", "CZ1", "HZ1", "CZ2", "HZ2", "CH1", "HH1", "CH2", "HH2", "CJ", "HJ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CE1", "HE1", "CE1", "HE1", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.15, 0.15, -0.15, 0.15, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

24

25

4

10

24

32,856

7

D:DTEZ

DTEZ

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cn1nncn1

DTEZ.pdb

D_SMI/DTEZ.smi

D_PDB/DTEZ.pdb

D_MOL2/DTEZ.mol2

D_top/DTEZ.top

D_rtp/DTEZ.rtp

D_rtp/DTEZ.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DTE" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "NG", "ND1", "ND2", "CE2", "NE1", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HE2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "N", "N", "N", "C", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

18

11

7

DTEZ.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "NG", "ND1", "ND2", "CE2", "NE1", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HE2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "N.ar", "N.ar", "N.ar", "C.ar", "N.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3883, 0.042, 0.3438, -0.2482, 0.0601, -0.1645, -0.0464, -0.1391, 0.1617, -0.1164, -0.2482, 0.0217, 0.0515, 0.0515, 0.1085, -0.0888, -0.0888, -0.0888 ]

18

-0.0001

DTEZA

0

3-(2-Tetrazolyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "NG", "ND1", "ND2", "NE1", "CE2", "HE2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "NY", "N5A", "N5A", "N5B", "C5B", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.08, 0.09, 0.09, 0.58, -0.42, -0.71, -0.22, 0.36, 0.15, 0.51, -0.51 ]

15

16

DTEZ

3-(2-Tetrazolyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "NG", "ND1", "ND2", "NE1", "CE2", "HE2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "NY", "N5A", "N5A", "N5B", "C5B", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.08, 0.09, 0.09, 0.58, -0.42, -0.71, -0.22, 0.36, 0.15, 0.51, -0.51 ]

15

16

4

9

12,321

1

D:DTH

DTH

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)[C@@H](C)O

DTH.pdb

D_SMI/DTH.smi

D_PDB/DTH.pdb

D_MOL2/DTH.mol2

D_top/DTH.top

D_rtp/DTH.rtp

D_rtp/DTH.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DTH" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG2", "OG1", "OXT", "HA", "HB", "HG1", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

17

8

9

DTH.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG2", "OG1", "OXT", "HA", "HB", "HG1", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3888, 0.0466, 0.3445, -0.2482, 0.0498, -0.04, -0.3932, -0.2482, 0.0223, 0.0579, 0.2097, 0.0254, 0.0254, 0.0254, -0.0888, -0.0888, -0.0888 ]

17

16

-0.0002

DTH

0

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG1", "HG1", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

14

DTH

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG1", "HG1", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

14

2

5

3

4,107

3

D:DTH6

DTH6

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)[C@H](O)CO

DTH6.pdb

D_SMI/DTH6.smi

D_PDB/DTH6.pdb

D_MOL2/DTH6.mol2

D_top/DTH6.top

D_rtp/DTH6.rtp

D_rtp/DTH6.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DTH" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "OB1", "CG", "OD", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB", "HB1", "HG1", "HG2", "HD" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "O", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

18

9

DTH6.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "OB1", "CG", "OD", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB", "HB1", "HG1", "HG2", "HD" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "O.3", "C.3", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3852, -0.0141, 0.0298, -0.5515, 0.0705, -0.3908, 0.0689, -0.3925, -0.5515, -0.089, -0.089, -0.089, 0.017, 0.0603, 0.2098, 0.0582, 0.0582, 0.2095 ]

18

17

-1

DTH6

0

4-hydroxy-l-threonine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OB1", "HB1", "CG", "HG1", "HG2", "OD", "HD", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT2", "HA", "HA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, 0.05, 0.09, 0.09, -0.66, 0.43, 0.51, -0.51 ]

15

DTH6

4-hydroxy-l-threonine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OB1", "HB1", "CG", "HG1", "HG2", "OD", "HD", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT2", "HA", "HA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, 0.05, 0.09, 0.09, -0.66, 0.43, 0.51, -0.51 ]

15

2

6

9

12,321

5

D:DTH9

DTH9

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1csc2c1cccc2

DTH9.pdb

D_SMI/DTH9.smi

D_PDB/DTH9.pdb

D_MOL2/DTH9.mol2

D_top/DTH9.top

D_rtp/DTH9.rtp

D_rtp/DTH9.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DTH" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "SE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH2" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "S", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

26

15

11

DTH9.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "SE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH2" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "S.2", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3836, -0.0387, 0.0276, -0.5515, -0.0346, -0.0339, -0.02, -0.0077, 0.0196, -0.0533, -0.0964, -0.0474, -0.0611, -0.0607, -0.5515, -0.0891, -0.0891, -0.0891, 0.0147, 0.0301, 0.0301, 0.0696, 0.0624, 0.0629, 0.0618, 0.0618 ]

26

27

-0.9999

DTH93

0

3-(3-benzothienyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "CD2", "CD1", "HD1", "CE3", "HE3", "CE2", "SE1", "CZ3", "HZ3", "CZ2", "HZ2", "CH2", "HH2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CPT", "STHI", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, -0.02, -0.09, 0.15, -0.115, 0.115, 0.07, -0.08, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

23

25

DTH9

3-(3-benzothienyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "CG", "CD2", "CD1", "HD1", "CE3", "HE3", "CE2", "SE1", "CZ3", "HZ3", "CZ2", "HZ2", "CH2", "HH2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CPT", "STHI", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, -0.02, -0.09, 0.15, -0.115, 0.115, 0.07, -0.08, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

23

25

2

8

9

12,321

6

D:DTIH

DTIH

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1cccs1

DTIH.pdb

D_SMI/DTIH.smi

D_PDB/DTIH.pdb

D_MOL2/DTIH.mol2

D_top/DTIH.top

D_rtp/DTIH.rtp

D_rtp/DTIH.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DTI" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD2", "SD1", "CE1", "CE2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "HE2" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "S", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

20

11

9

DTIH.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD2", "SD1", "CE1", "CE2", "OXT", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "HE2" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "S.2", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3836, -0.0383, 0.0276, -0.5515, -0.0294, -0.0114, -0.0516, -0.1017, -0.0241, -0.0545, -0.5515, -0.0891, -0.0891, -0.0891, 0.0148, 0.0306, 0.0306, 0.0626, 0.0693, 0.0623 ]

20

-0.9999

DTIH

-0

3-(2-thienyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD2", "HD2", "SD1", "CE2", "HE2", "CE1", "HE1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "C5A", "C5B", "HP", "STHI", "C5B", "HP", "C5A", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.04, -0.15, 0.15, -0.08, -0.15, 0.15, -0.11, 0.15, 0.51, -0.51 ]

17

18

DTIH

3-(2-thienyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD2", "HD2", "SD1", "CE2", "HE2", "CE1", "HE1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "C5A", "C5B", "HP", "STHI", "C5B", "HP", "C5A", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.04, -0.15, 0.15, -0.08, -0.15, 0.15, -0.11, 0.15, 0.51, -0.51 ]

17

18

5

6

9

12,321

9

D:DTPO

DTPO

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)[C@@H](C)OP(=O)(O)O

DTPO.pdb

D_SMI/DTPO.smi

D_PDB/DTPO.pdb

D_MOL2/DTPO.mol2

D_top/DTPO.top

D_rtp/DTPO.rtp

D_rtp/DTPO.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DTP" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG2", "OG1", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "OXT", "HA", "HB", "HG21", "HG22", "HG23", "HOP3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "P", "O", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

21

12

9

DTPO.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG2", "OG1", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "OXT", "HA", "HB", "HG21", "HG22", "HG23", "HOP3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "O.3", "P.3", "O.2", "O.3", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3851, -0.0159, 0.0297, -0.5515, 0.0553, -0.0395, -0.3258, 0.2101, -0.5173, -0.4374, -0.3436, -0.5515, 0.0169, 0.0584, 0.0254, 0.0254, 0.0254, 0.2176, -0.089, -0.089, -0.089 ]

21

20

-2.0002

DTPO

-1

phosphothreonine (charge: -1)

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG1", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "HOP3", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OCC", "PO4", "OC", "OC", "OH1", "H", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.19, 0.09, -0.55, 1.44, -0.95, -0.95, -0.77, 0.5, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

18

DTPO

phosphothreonine (charge: -1)

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG1", "P", "O1P", "O2P", "O3P", "HOP3", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OCC", "PO4", "OC", "OC", "OH1", "H", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.19, 0.09, -0.55, 1.44, -0.95, -0.95, -0.77, 0.5, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

18

2

5

27

36,963

6

D:DTR

DTR

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1c[nH]c2c1cccc2

DTR.pdb

D_SMI/DTR.smi

D_PDB/DTR.pdb

D_MOL2/DTR.mol2

D_top/DTR.top

D_rtp/DTR.rtp

D_rtp/DTR.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DTR" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

27

15

12

DTR.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0246, 0.3423, -0.2482, -0.0286, -0.0234, 0.0059, 0.0028, 0.0467, -0.0523, -0.3604, -0.0378, -0.0611, -0.0598, -0.2482, 0.0201, 0.0303, 0.0303, 0.081, 0.1653, 0.0624, 0.0638, 0.0618, 0.0618, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

27

28

-0.0001

DTR

0

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "NE1", "HE1", "CE2", "CD2", "CE3", "HE3", "CZ3", "HZ3", "CZ2", "HZ2", "CH2", "HH2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "NY", "H", "CPT", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.61, 0.38, 0.13, -0.02, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

24

26

DTR

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "NE1", "HE1", "CE2", "CD2", "CE3", "HE3", "CZ3", "HZ3", "CZ2", "HZ2", "CH2", "HH2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "NY", "H", "CPT", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.61, 0.38, 0.13, -0.02, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

24

26

2

9

12,321

4

D:DTRO

DTRO

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1c(O)[nH]c2c1cccc2

DTRO.pdb

D_SMI/DTRO.smi

D_PDB/DTRO.pdb

D_MOL2/DTRO.mol2

D_top/DTRO.top

D_rtp/DTRO.rtp

D_rtp/DTRO.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DTR" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "OD1", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "C", "C", "N", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

28

16

12

DTRO.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "OD1", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0247, 0.3423, -0.2482, -0.025, 0.0201, 0.1944, 0.0065, -0.4934, 0.0495, -0.0522, -0.3257, -0.0377, -0.0611, -0.0598, -0.2482, 0.0201, 0.0304, 0.0304, 0.2937, 0.1688, 0.0624, 0.0638, 0.0618, 0.0618, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

28

29

-0

DTRO

-0

2-hydroxy-tryptophan

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "OD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CE3", "HE3", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "HZ3", "CH2", "HH2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "OH1", "H", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.2, -0.51, 0.43, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

25

27

DTRO

2-hydroxy-tryptophan

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "OD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CE3", "HE3", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "HZ3", "CH2", "HH2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "OH1", "H", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.2, -0.51, 0.43, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

25

27

2

9

12,321

6

D:DTRX

DTRX

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1c[nH]c2c1ccc(c2)O

DTRX.pdb

D_SMI/DTRX.smi

D_PDB/DTRX.pdb

D_MOL2/DTRX.mol2

D_top/DTRX.top

D_rtp/DTRX.rtp

D_rtp/DTRX.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DTR" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OH2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

28

16

12

DTRX.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "CE3", "NE1", "CZ2", "CZ3", "CH2", "OH2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HE1", "HE3", "HZ2", "HZ3", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3836, -0.0387, 0.0276, -0.5515, -0.0337, -0.0236, 0.0059, 0.003, 0.0502, -0.0489, -0.3603, 0.0037, -0.0195, 0.1188, -0.5067, -0.5515, 0.0147, 0.0301, 0.0301, 0.081, 0.1653, 0.0625, 0.0675, 0.0654, 0.2921, -0.0891, -0.0891, -0.0891 ]

28

29

-1.0002

DTRX

0

6-hydroxytryptophan

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CE3", "HE3", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "HZ3", "CH2", "OH2", "HH2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]

25

27

DTRX

6-hydroxytryptophan

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "NE1", "HE1", "CE2", "CE3", "HE3", "CZ2", "HZ2", "CZ3", "HZ3", "CH2", "OH2", "HH2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CY", "CA", "HP", "CPT", "NY", "H", "CPT", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.03, 0.035, 0.115, -0.02, -0.61, 0.38, 0.13, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]

25

27

2

9

12,321

2

D:DTVI

DTVI

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCCNC(=S)N

DTVI.pdb

D_SMI/DTVI.smi

D_PDB/DTVI.pdb

D_MOL2/DTVI.mol2

D_top/DTVI.top

D_rtp/DTVI.rtp

D_rtp/DTVI.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DTV" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "NE", "CZ", "SZ", "NH", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HE", "HH1", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "N", "C", "S", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

25

12

13

DTVI.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "NE", "CZ", "SZ", "NH", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "HE", "HH1", "HH2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "N.am", "C.2", "S.2", "N.am", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3834, -0.0428, 0.0273, -0.5515, -0.0597, -0.0386, 0.0106, -0.3267, 0.1277, -0.0191, -0.3406, -0.5515, 0.0144, 0.0253, 0.0253, 0.028, 0.028, 0.0462, 0.0462, 0.1477, 0.144, 0.144, -0.0891, -0.0891, -0.0891 ]

25

24

-0.9997

DTVIC

-0

Thio-citrulline

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "HD1", "HD2", "NE", "HE", "CZ", "NH", "HH1", "HH2", "SZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NH1", "H", "CC", "NH2", "H", "H", "SCN", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.12, 0.09, 0.09, -0.73, 0.37, 0.5, -0.8, 0.37, 0.37, -0.38, 0.51, -0.51 ]

22

DTVI

Thio-citrulline

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG2", "HG1", "CD", "HD1", "HD2", "NE", "HE", "CZ", "NH", "HH1", "HH2", "SZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "NH1", "H", "CC", "NH2", "H", "H", "SCN", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.12, 0.09, 0.09, -0.73, 0.37, 0.5, -0.8, 0.37, 0.37, -0.38, 0.51, -0.51 ]

22

5

7

81

110,889

4

D:DTY

DTY

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1ccc(cc1)O

DTY.pdb

D_SMI/DTY.smi

D_PDB/DTY.pdb

D_MOL2/DTY.mol2

D_top/DTY.top

D_rtp/DTY.rtp

D_rtp/DTY.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DTY" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OH", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HH", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

24

13

11

DTY.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OH", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "HH", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0245, 0.3423, -0.2482, -0.0306, -0.0482, -0.0552, -0.0552, -0.0199, -0.0199, 0.1169, -0.5068, -0.2482, 0.0201, 0.0302, 0.0302, 0.0621, 0.0621, 0.0654, 0.0654, 0.2921, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

24

-0.0003

DTY

0

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CE1", "HE1", "CZ", "OH", "HH", "CD2", "HD2", "CE2", "HE2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

21

22

DTY

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CE1", "HE1", "CZ", "OH", "HH", "CD2", "HD2", "CE2", "HE2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

21

22

2

8

6

8,214

6

D:DTY2

DTY2

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1cc(N)c(cc1)O

DTY2.pdb

D_SMI/DTY2.smi

D_PDB/DTY2.pdb

D_MOL2/DTY2.mol2

D_top/DTY2.top

D_rtp/DTY2.rtp

D_rtp/DTY2.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DTY" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "NE1", "CZ", "OZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE11", "HE12", "HE2", "HZ", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

26

14

12

DTY2.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "NE1", "CZ", "OZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE11", "HE12", "HE2", "HZ", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.pl3", "C.ar", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3842, -0.0294, 0.0724, -0.3108, -0.0349, -0.0466, -0.0343, -0.0551, 0.0668, -0.0181, -0.3551, 0.1374, -0.5049, -0.8487, 0.0155, 0.0301, 0.0301, 0.064, 0.0621, 0.1424, 0.1424, 0.0655, 0.2922, -0.0891, -0.0891, -0.0891 ]

26

-1.0001

DTY2

-0

3-Amino-L-tyrosine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD2", "HD2", "CD1", "HD1", "CE2", "HE2", "CE1", "NE1", "HE11", "HE12", "CZ", "OZ", "HZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "NH2", "H", "H", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.1, -0.9, 0.4, 0.4, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]

23

24

DTY2

3-Amino-L-tyrosine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD2", "HD2", "CD1", "HD1", "CE2", "HE2", "CE1", "NE1", "HE11", "HE12", "CZ", "OZ", "HZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "NH2", "H", "H", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.1, -0.9, 0.4, 0.4, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]

23

24

3

8

12

16,428

3

D:DTYI

DTYI

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1cc(c(c(c1)I)O)I

DTYI.pdb

D_SMI/DTYI.smi

D_PDB/DTYI.pdb

D_MOL2/DTYI.mol2

D_top/DTYI.top

D_rtp/DTYI.rtp

D_rtp/DTYI.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DTY" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OH", "OXT", "IE1", "IE2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HH", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "I", "I", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

24

15

9

DTYI.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OH", "OXT", "IE1", "IE2", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HH", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "O.co2", "I", "I", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0245, 0.3423, -0.2482, -0.0305, -0.0462, -0.0419, -0.0419, 0.056, 0.056, 0.143, -0.5047, -0.2482, -0.04, -0.04, 0.0201, 0.0302, 0.0302, 0.0632, 0.0632, 0.2922, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

24

-0.0001

DTYI

0

3,5-diiodotyrosine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "IE1", "CE2", "IE2", "CZ", "OH", "HH", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "I", "CA", "I", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.08, -0.08, 0.08, -0.08, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]

21

22

DTYI

3,5-diiodotyrosine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "IE1", "CE2", "IE2", "CZ", "OH", "HH", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "I", "CA", "I", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.08, -0.08, 0.08, -0.08, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]

21

22

2

6

8,214

1

D:DTYQ

DTYQ

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1c(O)cc(c(c1)N)O

DTYQ.pdb

D_SMI/DTYQ.smi

D_PDB/DTYQ.pdb

D_MOL2/DTYQ.mol2

D_top/DTYQ.top

D_rtp/DTYQ.rtp

D_rtp/DTYQ.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DTY" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "OD1", "CE1", "CE2", "NE2", "CZ", "OH", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE21", "HE22", "HH", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "C", "C", "N", "C", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

27

15

12

DTYQ.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "OD1", "CE1", "CE2", "NE2", "CZ", "OH", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE21", "HE22", "HH", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "C.ar", "C.ar", "N.pl3", "C.ar", "O.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0246, 0.3423, -0.2482, -0.0271, -0.005, 0.1235, -0.0309, -0.5064, 0.0234, 0.0671, -0.3551, 0.1409, -0.5048, -0.2482, 0.0201, 0.0303, 0.0303, 0.2921, 0.0641, 0.0691, 0.1424, 0.1424, 0.2922, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

27

-0.0003

DTYQ

-0

3-amino-6-hydroxy-tyrosine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "OD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "NE2", "HE21", "HE22", "CZ", "OH", "HH", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "NH2", "H", "H", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.1, -0.9, 0.4, 0.4, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]

24

25

DTYQ

3-amino-6-hydroxy-tyrosine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "OD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "NE2", "HE21", "HE22", "CZ", "OH", "HH", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "OH1", "H", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "NH2", "H", "H", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.11, -0.54, 0.43, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.1, -0.9, 0.4, 0.4, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]

24

25

2

8

12

16,428

1

D:DTZR

DTZR

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cn1cncn1

DTZR.pdb

D_SMI/DTZR.smi

D_PDB/DTZR.pdb

D_MOL2/DTZR.mol2

D_top/DTZR.top

D_rtp/DTZR.rtp

D_rtp/DTZR.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DTZ" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "NG", "CD2", "ND1", "CE1", "NE2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "N", "C", "N", "C", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

19

11

8

DTZR.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "NG", "CD2", "ND1", "CE1", "NE2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD2", "HE1", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "N.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "N.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3846, -0.0228, 0.029, -0.5515, 0.0354, -0.2533, 0.1142, -0.1585, 0.1379, -0.2228, -0.5515, 0.0162, 0.0496, 0.0496, 0.1043, 0.1065, -0.089, -0.089, -0.089 ]

19

-1.0001

DTZR4

-0

3-(1,2,4-Triazol-1-yl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "NG", "CD2", "HD2", "ND1", "NE2", "CE1", "HE1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "NY", "C5A", "HP", "N5A", "N5B", "C5B", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.08, 0.09, 0.09, 0.31, 0.04, 0.15, -0.71, -0.57, 0.37, 0.15, 0.51, -0.51 ]

16

17

DTZR

3-(1,2,4-Triazol-1-yl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "NG", "CD2", "HD2", "ND1", "NE2", "CE1", "HE1", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "NY", "C5A", "HP", "N5A", "N5B", "C5B", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.08, 0.09, 0.09, 0.31, 0.04, 0.15, -0.71, -0.57, 0.37, 0.15, 0.51, -0.51 ]

16

17

5

9

12,321

4

D:DUN1

DUN1

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CCCC(=O)O

DUN1.pdb

D_SMI/DUN1.smi

D_PDB/DUN1.pdb

D_MOL2/DUN1.mol2

D_top/DUN1.top

D_rtp/DUN1.rtp

D_rtp/DUN1.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DUN" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE", "OZ1", "OZ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

21

11

10

DUN1.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD", "CE", "OZ1", "OZ2", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HG1", "HG2", "HD1", "HD2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "C.2", "O.co2", "O.co2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.384, -0.0335, 0.0721, -0.3108, -0.0598, -0.044, 0.0491, 0.356, -0.2464, -0.2464, -0.8487, 0.0152, 0.0253, 0.0253, 0.027, 0.027, 0.0379, 0.0379, -0.0891, -0.0891, -0.0891 ]

21

20

-1.0001

DUN1

-1

2-Aminoadipic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "OZ1", "OZ2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "OC", "OC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.28, 0.09, 0.09, 0.62, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]

18

DUN1

2-Aminoadipic acid

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "HG1", "HG2", "CD", "HD1", "HD2", "CE", "OZ1", "OZ2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CT2", "HA", "HA", "CC", "OC", "OC", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, -0.28, 0.09, 0.09, 0.62, -0.76, -0.76, 0.51, -0.51 ]

18

3

5

81

110,889

3

D:DVA

DVA

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)C(C)C

DVA.pdb

D_SMI/DVA.smi

D_PDB/DVA.pdb

D_MOL2/DVA.mol2

D_top/DVA.top

D_rtp/DVA.rtp

D_rtp/DVA.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DVA" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "OXT", "HA", "HB", "HG11", "HG12", "HG13", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

19

8

11

DVA.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG1", "CG2", "OXT", "HA", "HB", "HG11", "HG12", "HG13", "HG21", "HG22", "HG23", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3872, 0.0229, 0.3423, -0.2482, -0.0496, -0.0637, -0.0637, -0.2482, 0.0201, 0.0285, 0.0232, 0.0232, 0.0232, 0.0232, 0.0232, 0.0232, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

19

18

0.0001

DVA

0

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG1", "HG11", "HG12", "HG13", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

16

DVA

null

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "CG1", "HG11", "HG12", "HG13", "CG2", "HG21", "HG22", "HG23", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

16

2

5

3

4,107

7

D:DVAH

DVAH

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)[C@@H](CC)O

DVAH.pdb

D_SMI/DVAH.smi

D_PDB/DVAH.pdb

D_MOL2/DVAH.mol2

D_top/DVAH.top

D_rtp/DVAH.rtp

D_rtp/DVAH.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "VAH" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG2", "OG1", "CD", "OXT", "HA", "HB", "HG1", "HG21", "HG22", "HD1", "HD2", "HD3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "O", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

20

9

11

DVAH.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG2", "OG1", "CD", "OXT", "HA", "HB", "HG1", "HG21", "HG22", "HD1", "HD2", "HD3", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.3", "O.3", "C.3", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3888, 0.0469, 0.3445, -0.2482, 0.0524, -0.0307, -0.3929, -0.063, -0.2482, 0.0224, 0.0582, 0.2097, 0.0287, 0.0287, 0.0231, 0.0231, 0.0231, -0.0888, -0.0888, -0.0888 ]

20

19

0.0002

DVAH

0

Hydroxynorvaline

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG1", "HG1", "CG2", "HG21", "HG22", "CD", "HD1", "HD2", "HD3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT2", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.18, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

17

DVAH

Hydroxynorvaline

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB", "OG1", "HG1", "CG2", "HG21", "HG22", "CD", "HD1", "HD2", "HD3", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT1", "HA", "OH1", "H", "CT2", "HA", "HA", "CT3", "HA", "HA", "HA", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.14, 0.09, -0.66, 0.43, -0.18, 0.09, 0.09, -0.27, 0.09, 0.09, 0.09, 0.51, -0.51 ]

17

2

6

9

12,321

6

D:DWFP

DWFP

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1cc(cc(c1)F)F

DWFP.pdb

D_SMI/DWFP.smi

D_PDB/DWFP.pdb

D_MOL2/DWFP.mol2

D_top/DWFP.top

D_rtp/DWFP.rtp

D_rtp/DWFP.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DWF" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "FE1", "FE2", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HZ" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "F", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

23

14

9

DWFP.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "FE1", "FE2", "HN1", "HN2", "HN3", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HZ" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.co2", "F", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0245, 0.3423, -0.2482, -0.0304, -0.043, -0.0231, -0.0231, 0.1264, 0.1264, 0.0088, -0.2482, -0.2054, -0.2054, -0.0889, -0.0889, -0.0889, 0.0201, 0.0302, 0.0302, 0.0649, 0.0649, 0.0675 ]

23

0

DWFP

-0

3,5-Difluoro-phenylalanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "FE1", "CE2", "FE2", "CZ", "HZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "F1", "CA", "F1", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, 0.19, -0.19, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

20

21

DWFP

3,5-Difluoro-phenylalanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "FE1", "CE2", "FE2", "CZ", "HZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "F1", "CA", "F1", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, 0.19, -0.19, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

20

21

2

6

8,214

1

D:DY23

DY23

D

[NH3][C@@H](C($O)$O)Cc1ccccn1

DY23.pdb

D_SMI/DY23.smi

D_PDB/DY23.pdb

D_MOL2/DY23.mol2

D_top/DY23.top

D_rtp/DY23.rtp

D_rtp/DY23.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "PYR" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD2", "ND1", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "H", "HA", "HB2", "HB3", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ", "H1", "H2" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "N", "C", "C", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

22

12

10

DY23.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD2", "ND1", "CE1", "CE2", "CZ", "OXT", "H", "HA", "HB2", "HB3", "HD2", "HE1", "HE2", "HZ", "H1", "H2" ]

[ "N.4", "C.3", "C.3", "O.3", "C.3", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.384, -0.0118, 0.2793, -0.1895, -0.0182, 0.0399, -0.0404, -0.2599, 0.0279, -0.0586, -0.0436, -0.1895, -0.0894, 0.0143, 0.0314, 0.0314, 0.0635, 0.0829, 0.0619, 0.0633, -0.0894, -0.0894 ]

22

0.0001

DY232

-0

3-(2-Pyridyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "ND1", "CE1", "HE1", "CD2", "HD2", "CE2", "HE2", "CZ", "HZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "NPYD", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.31, -0.62, 0.16, 0.15, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

19

20

DY23

3-(2-Pyridyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "ND1", "CE1", "HE1", "CD2", "HD2", "CE2", "HE2", "CZ", "HZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "NPYD", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0.31, -0.62, 0.16, 0.15, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

19

20

2

7

12

16,428

6

D:DY33

DY33

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1cnccc1

DY33.pdb

D_SMI/DY33.smi

D_PDB/DY33.pdb

D_MOL2/DY33.mol2

D_top/DY33.top

D_rtp/DY33.rtp

D_rtp/DY33.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DY3" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "NE1", "CZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HZ", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "C", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

22

12

10

DY33.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE2", "NE1", "CZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HZ", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "C.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0246, 0.3423, -0.2482, -0.0291, -0.0303, 0.0307, -0.0558, -0.0433, -0.263, 0.0276, -0.2482, 0.0201, 0.0303, 0.0303, 0.0832, 0.0621, 0.0633, 0.0829, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

22

0.0001

DY333

0

3-(3-Pyridyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "NE1", "CZ", "HZ", "CD2", "HD2", "CE2", "HE2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "NPYD", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.16, 0.15, -0.62, 0.16, 0.15, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

19

20

DY33

3-(3-Pyridyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "NE1", "CZ", "HZ", "CD2", "HD2", "CE2", "HE2", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "NPYD", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, 0.16, 0.15, -0.62, 0.16, 0.15, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.51, -0.51 ]

19

20

2

7

12

16,428

8

D:DY34

DY34

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1ccncc1

DY34.pdb

D_SMI/DY34.smi

D_PDB/DY34.pdb

D_MOL2/DY34.mol2

D_top/DY34.top

D_rtp/DY34.rtp

D_rtp/DY34.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DY3" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "NZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

22

12

10

DY34.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "NZ", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE1", "HE2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "N.ar", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0245, 0.3423, -0.2482, -0.0305, -0.0456, -0.0405, -0.0405, 0.0278, 0.0278, -0.2632, -0.2482, 0.0201, 0.0302, 0.0302, 0.0635, 0.0635, 0.0829, 0.0829, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

22

-0.0004

DY344

0

3-(4-Pyridyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "NZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "NPYD", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.16, 0.15, 0.16, 0.15, -0.62, 0.51, -0.51 ]

19

20

DY34

3-(4-Pyridyl)-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "HE1", "CE2", "HE2", "NZ", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "HP", "NPYD", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.16, 0.15, 0.16, 0.15, -0.62, 0.51, -0.51 ]

19

20

2

7

6

8,214

9

D:DYCM

DYCM

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CSCC(=O)N

DYCM.pdb

D_SMI/DYCM.smi

D_PDB/DYCM.pdb

D_MOL2/DYCM.mol2

D_top/DYCM.top

D_rtp/DYCM.rtp

D_rtp/DYCM.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DYC" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "SG", "CD", "CE", "NZ2", "OZ1", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HZ21", "HZ22", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "S", "C", "C", "N", "O", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

21

11

10

DYCM.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "SG", "CD", "CE", "NZ2", "OZ1", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HZ21", "HZ22", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "S.3", "C.3", "C.2", "N.am", "O.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3845, -0.0243, 0.0729, -0.3108, -0.0131, -0.1527, 0.0699, 0.2203, -0.3286, -0.2751, -0.8487, 0.016, 0.0364, 0.0364, 0.0471, 0.0471, 0.145, 0.145, -0.0891, -0.0891, -0.0891 ]

21

20

-1

DYCM

-0

cysteine-s-acetamide

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "SG", "CD", "HD2", "HD1", "CE", "OZ1", "NZ2", "HZ21", "HZ22", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, -0.13, 0.09, 0.09, 0.55, -0.55, -0.62, 0.32, 0.3, 0.51, -0.51 ]

18

DYCM

cysteine-s-acetamide

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "SG", "CD", "HD2", "HD1", "CE", "OZ1", "NZ2", "HZ21", "HZ22", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "S", "CT2", "HA", "HA", "CC", "O", "NH2", "H", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.14, 0.09, 0.09, -0.09, -0.13, 0.09, 0.09, 0.55, -0.55, -0.62, 0.32, 0.3, 0.51, -0.51 ]

18

4

5

108

147,852

7

D:DYOF

DYOF

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)Cc1cc(c(cc1)O)F

DYOF.pdb

D_SMI/DYOF.smi

D_PDB/DYOF.pdb

D_MOL2/DYOF.mol2

D_top/DYOF.top

D_rtp/DYOF.rtp

D_rtp/DYOF.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DYO" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OH", "OXT", "FE1", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HH", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "C", "O", "O", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

24

14

10

DYOF.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "CG", "CD1", "CD2", "CE1", "CE2", "CZ", "OH", "OXT", "FE1", "HA", "HB1", "HB2", "HD1", "HD2", "HE2", "HH", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "C.ar", "O.3", "O.co2", "F", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3873, 0.0245, 0.3423, -0.2482, -0.0305, -0.0455, -0.0197, -0.055, 0.1648, -0.0171, 0.1519, -0.5039, -0.2482, -0.2017, 0.0201, 0.0302, 0.0302, 0.065, 0.0621, 0.0655, 0.2923, -0.0889, -0.0889, -0.0889 ]

24

-0.0003

DYOF

0

3-fluorotyrosine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "FE1", "CE2", "HE2", "CZ", "OH", "HH", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "F1", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]

21

22

DYOF

3-fluorotyrosine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB1", "HB2", "CG", "CD1", "HD1", "CD2", "HD2", "CE1", "FE1", "CE2", "HE2", "CZ", "OH", "HH", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "CA", "CA", "HP", "CA", "HP", "CA", "F1", "CA", "HP", "CA", "OH1", "H", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, -0.18, 0.09, 0.09, 0, -0.115, 0.115, -0.115, 0.115, 0.19, -0.19, -0.115, 0.115, 0.11, -0.54, 0.43, 0.51, -0.51 ]

21

22

2

7

12

16,428

1

D:DZDA

DZDA

D

[NH3][C@@H](C(=O)O)CN=[N]=N

DZDA.pdb

D_SMI/DZDA.smi

D_PDB/DZDA.pdb

D_MOL2/DZDA.mol2

D_top/DZDA.top

D_rtp/DZDA.rtp

D_rtp/DZDA.hdb

true

[ ".hdb", ".mol2", ".pdb", ".png", ".rtp", ".smi", ".top", ".zip" ]

[ "DZD" ]

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "NG", "ND", "NE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N", "C", "C", "O", "C", "N", "N", "N", "O", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

15

9

6

DZDA.pdb

SMALL

GASTEIGER

[ "N", "CA", "C", "O", "CB", "NG", "ND", "NE", "OXT", "HA", "HB1", "HB2", "H1", "H2", "H3" ]

[ "N.4", "C.3", "C.2", "O.co2", "C.3", "N.2", "N.2", "N.2", "O.co2", "H", "H", "H", "H", "H", "H" ]

[ 0.3852, -0.0109, 0.074, -0.3107, 0.0671, -0.1114, -0.1671, 0.0678, -0.8487, 0.0171, 0.0524, 0.0524, -0.089, -0.089, -0.089 ]

15

14

-0.9998

DZDAA

0

azido-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "NG", "ND", "NE", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "N=C", "=N=", "NAZT", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.07, 0.09, 0.09, -0.56, 0.68, -0.37, 0.51, -0.51 ]

12

DZDA

azido-alanine

[ "N", "HN", "CA", "HA", "CB", "HB2", "HB1", "NG", "ND", "NE", "C", "O" ]

[ "NH1", "H", "CT1", "HB", "CT2", "HA", "HA", "N=C", "=N=", "NAZT", "C", "O" ]

[ -0.47, 0.31, 0.07, 0.09, 0.07, 0.09, 0.09, -0.56, 0.68, -0.37, 0.51, -0.51 ]

12

2

3

9

12,321

5