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File size: 18,225 Bytes
630790d 7d15e85 630790d 7d15e85 630790d 49813d2 630790d 49813d2 630790d 49813d2 630790d 7d15e85 630790d 7d15e85 630790d 7d15e85 49813d2 630790d 49813d2 630790d 49813d2 630790d 49813d2 630790d 49813d2 630790d 49813d2 630790d 7d15e85 49813d2 630790d 7d15e85 49813d2 630790d 7d15e85 49813d2 630790d 7d15e85 49813d2 630790d 7d15e85 49813d2 7d15e85 630790d | 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 56 57 58 59 60 61 62 63 64 65 66 67 68 69 70 71 72 73 74 75 76 77 78 79 80 81 82 83 84 85 86 87 88 89 90 91 92 93 94 95 96 97 98 99 100 101 102 103 104 105 106 107 108 109 110 111 112 113 114 115 116 117 118 119 120 121 122 123 124 125 126 127 128 129 130 131 132 133 134 135 136 137 138 139 140 141 142 143 144 145 146 147 148 149 150 151 152 153 154 155 156 157 158 159 160 161 162 163 164 165 166 167 168 169 170 171 172 173 174 175 176 177 178 179 180 181 182 183 184 185 186 187 188 189 190 191 192 193 194 195 196 197 198 199 200 201 202 203 204 205 206 207 208 209 210 211 212 213 214 215 216 217 218 219 220 221 222 223 224 225 226 227 228 229 230 231 232 233 234 235 236 237 238 239 240 241 242 243 244 245 246 247 248 249 250 251 252 253 254 255 256 257 258 259 260 261 262 263 264 265 266 267 268 269 270 271 272 273 274 275 276 277 278 279 280 281 282 283 284 285 286 287 288 289 290 291 292 293 294 295 296 297 298 299 300 301 302 303 304 305 306 307 308 309 310 311 312 313 314 315 316 317 318 319 320 321 322 323 324 325 326 327 328 329 330 331 332 333 334 335 336 337 338 339 340 341 342 343 344 345 346 347 348 349 350 351 352 353 354 355 356 357 358 359 360 361 362 363 364 365 366 367 368 369 370 371 372 373 374 375 376 377 378 379 380 381 382 383 384 385 386 387 388 389 390 391 392 393 394 395 396 397 398 399 400 401 402 403 404 405 406 407 408 409 410 411 412 413 414 415 416 417 418 419 420 421 422 423 424 425 426 427 428 429 430 431 432 433 434 435 436 437 438 439 440 441 442 443 444 445 446 447 448 449 450 451 452 453 454 455 456 457 458 459 460 461 462 463 464 465 466 467 468 469 470 471 472 473 474 475 476 477 478 479 | """
Lógica de las 4 tools de RAG sobre ESL, ISLP, FES y PDSH.
Este módulo es agnóstico al transporte. Lo importan:
- `rag_books_mcp.server` → MCP stdio (FastMCP, para uso local con `mcp` SDK).
- `rag_books_mcp.app` → Gradio app con `mcp_server=True` (para HF Spaces).
Mantener UNA sola fuente de verdad para las tools evita drift entre transportes.
Si modificas la lógica, hazlo aquí.
"""
from __future__ import annotations
import os
from pathlib import Path
from typing import Optional
import chromadb
from chromadb.utils.embedding_functions import SentenceTransformerEmbeddingFunction
# --- Configuración ---
EMBEDDING_MODEL = "all-MiniLM-L6-v2"
CHROMA_DIR = Path(__file__).parent.parent / "chroma_db"
# Inicialización lazy del cliente y embedding (singletons por proceso).
_client: Optional[chromadb.ClientAPI] = None
_embedding_fn = None
def get_client() -> chromadb.ClientAPI:
"""Cliente ChromaDB persistente (singleton). La ruta puede sobreescribirse
con la variable de entorno `RAG_CHROMA_DIR`."""
global _client
if _client is None:
chroma_path = os.environ.get("RAG_CHROMA_DIR", str(CHROMA_DIR))
_client = chromadb.PersistentClient(path=chroma_path)
return _client
def get_embedding_fn():
"""Función de embedding `sentence-transformers/all-MiniLM-L6-v2` (singleton)."""
global _embedding_fn
if _embedding_fn is None:
_embedding_fn = SentenceTransformerEmbeddingFunction(model_name=EMBEDDING_MODEL)
return _embedding_fn
def get_collection(name: str):
"""Obtiene una colección de ChromaDB por nombre."""
return get_client().get_collection(name=name, embedding_function=get_embedding_fn())
# --- Tools (lógica pura, sin dependencias del transporte) ---
def search_theory(
query: str,
book: str = "all",
top_k: int = 5,
) -> str:
"""
Busca fragmentos relevantes en los libros ESL, ISLP, FES, PDSH y R4DS usando búsqueda semántica.
Args:
query (str): Consulta en lenguaje natural (ej: "bias-variance tradeoff",
"regularización L1 vs L2", "random forest out-of-bag error",
"exploratory data analysis iterative cycle").
book (str): Libro donde buscar. Opciones: "esl", "islp", "fes", "pdsh", "r4ds",
"both" (ESL+ISLP, retro-compat) o "all" (los 5, default).
top_k (int): Número de resultados a devolver (default: 5, máximo: 10).
Returns:
str: Fragmentos relevantes con metadata (libro, capítulo, sección, similitud).
Nota:
R4DS está escrito en R (tidyverse). Sus principios de EDA, transformación
de datos y manipulación tabular son agnósticos del lenguaje y se traducen
directamente a pandas/Python; el código en R debe leerse como pseudocódigo.
"""
top_k = min(max(int(top_k), 1), 10)
collections_to_search = []
if book in ("esl", "both", "all"):
try:
collections_to_search.append(("ESL", get_collection("esl_chapters")))
except Exception:
pass
if book in ("islp", "both", "all"):
try:
collections_to_search.append(("ISLP", get_collection("islp_chapters")))
except Exception:
pass
if book in ("fes", "all"):
try:
collections_to_search.append(("FES", get_collection("fes_chapters")))
except Exception:
pass
if book in ("pdsh", "all"):
try:
collections_to_search.append(("PDSH", get_collection("pdsh_chapters")))
except Exception:
pass
if book in ("r4ds", "all"):
try:
collections_to_search.append(("R4DS", get_collection("r4ds_chapters")))
except Exception:
pass
if not collections_to_search:
return (
"❌ No se encontraron colecciones. Ejecuta primero la ingesta: "
"python -m rag_books_mcp.ingest"
)
results = []
for book_label, collection in collections_to_search:
res = collection.query(query_texts=[query], n_results=top_k)
if res["documents"] and res["documents"][0]:
for doc, meta, dist in zip(
res["documents"][0], res["metadatas"][0], res["distances"][0]
):
similarity = 1 - dist # cosine distance → similarity
results.append({
"book": book_label,
"chapter": meta.get("chapter", ""),
"section": meta.get("section", ""),
"similarity": similarity,
"content": doc,
})
# Ordenar por similitud descendente
results.sort(key=lambda x: x["similarity"], reverse=True)
results = results[:top_k]
if not results:
return f"No se encontraron resultados para: '{query}'"
output_parts = [f"## Resultados para: \"{query}\"\n"]
for i, r in enumerate(results, 1):
output_parts.append(
f"### [{i}] {r['book']} — {r['chapter']} § {r['section']}\n"
f"**Similitud:** {r['similarity']:.3f}\n\n"
f"{r['content'][:1500]}\n\n---\n"
)
return "\n".join(output_parts)
def get_section(
book: str,
chapter: str,
section: str = "",
max_chunks: int = 5,
) -> str:
"""
Recupera una sección específica de un libro por referencia exacta.
Args:
book (str): Libro a consultar. Opciones: "esl", "islp", "fes", "pdsh" o "r4ds".
chapter (str): Nombre del capítulo (ej: "3 Linear Methods for Regression",
"8 Tree-Based Methods", "10 Exploratory data analysis").
Búsqueda parcial soportada.
section (str): Nombre de la sección dentro del capítulo (opcional).
Si se omite, devuelve el inicio del capítulo.
max_chunks (int): Máximo de chunks a devolver (default: 5).
Returns:
str: Contenido de la sección con metadata.
"""
max_chunks = int(max_chunks)
collection_name = f"{book}_chapters"
try:
collection = get_collection(collection_name)
except Exception:
return f"❌ Colección '{collection_name}' no encontrada. Opciones: esl, islp, fes, pdsh, r4ds"
# Intentar con filtro de metadata
try:
if section:
results = collection.get(
where={"$and": [
{"chapter": {"$contains": chapter}},
{"section": {"$contains": section}},
]},
limit=max_chunks,
)
else:
results = collection.get(
where={"chapter": {"$contains": chapter}},
limit=max_chunks,
)
except Exception:
# Fallback: búsqueda semántica con el nombre del capítulo/sección
search_query = f"{chapter} {section}".strip()
results = collection.query(query_texts=[search_query], n_results=max_chunks)
if results["documents"] and results["documents"][0]:
output_parts = [f"## {book.upper()} — {chapter}\n"]
for doc, meta in zip(results["documents"][0], results["metadatas"][0]):
output_parts.append(
f"### § {meta.get('section', 'N/A')}\n\n{doc}\n\n---\n"
)
return "\n".join(output_parts)
return f"No se encontró el capítulo '{chapter}' en {book.upper()}"
if not results["documents"]:
# Fallback semántico
search_query = f"{chapter} {section}".strip()
results = collection.query(query_texts=[search_query], n_results=max_chunks)
if results["documents"] and results["documents"][0]:
output_parts = [f"## {book.upper()} — {chapter}\n"]
for doc, meta in zip(results["documents"][0], results["metadatas"][0]):
output_parts.append(
f"### § {meta.get('section', 'N/A')}\n\n{doc}\n\n---\n"
)
return "\n".join(output_parts)
return f"No se encontró el capítulo '{chapter}' en {book.upper()}"
output_parts = [f"## {book.upper()} — {chapter}"]
if section:
output_parts[0] += f" § {section}"
output_parts[0] += "\n"
for doc, meta in zip(results["documents"], results["metadatas"]):
sec_title = meta.get("section", "")
chunk_idx = meta.get("chunk_index", 0)
total = meta.get("total_chunks_in_section", 1)
output_parts.append(
f"### § {sec_title} (parte {chunk_idx + 1}/{total})\n\n{doc}\n\n---\n"
)
return "\n".join(output_parts)
def cite_foundation(
topic: str,
detail_level: str = "medium",
) -> str:
"""
Devuelve la fundamentación teórica para un tema de ML/estadística,
citando los libros (ESL, ISLP, FES, PDSH, R4DS) para dar perspectiva completa.
Args:
topic (str): Tema a fundamentar (ej: "ridge regression", "bagging",
"cross-validation", "feature engineering", "missing data",
"exploratory data analysis").
detail_level (str): Nivel de detalle. Opciones: "brief" (1-2 fragmentos clave),
"medium" (3-4 fragmentos, default),
"deep" (6-8 fragmentos con contexto amplio).
Returns:
str: Fundamentación teórica con citas de los libros, organizada para
entender el concepto desde lo intuitivo (ISLP) hasta lo riguroso (ESL),
más prácticas de feature engineering (FES), código Python (PDSH)
y workflow iterativo de EDA / data wrangling (R4DS, ejemplos en R).
"""
top_k_map = {"brief": 2, "medium": 4, "deep": 8}
top_k = top_k_map.get(detail_level, 4)
islp_results = []
try:
islp_col = get_collection("islp_chapters")
res = islp_col.query(query_texts=[topic], n_results=top_k)
if res["documents"] and res["documents"][0]:
for doc, meta, dist in zip(
res["documents"][0], res["metadatas"][0], res["distances"][0]
):
islp_results.append({
"content": doc,
"chapter": meta.get("chapter", ""),
"section": meta.get("section", ""),
"similarity": 1 - dist,
})
except Exception:
pass
esl_results = []
try:
esl_col = get_collection("esl_chapters")
res = esl_col.query(query_texts=[topic], n_results=top_k)
if res["documents"] and res["documents"][0]:
for doc, meta, dist in zip(
res["documents"][0], res["metadatas"][0], res["distances"][0]
):
esl_results.append({
"content": doc,
"chapter": meta.get("chapter", ""),
"section": meta.get("section", ""),
"similarity": 1 - dist,
})
except Exception:
pass
fes_results = []
try:
fes_col = get_collection("fes_chapters")
res = fes_col.query(query_texts=[topic], n_results=top_k)
if res["documents"] and res["documents"][0]:
for doc, meta, dist in zip(
res["documents"][0], res["metadatas"][0], res["distances"][0]
):
fes_results.append({
"content": doc,
"chapter": meta.get("chapter", ""),
"section": meta.get("section", ""),
"similarity": 1 - dist,
})
except Exception:
pass
pdsh_results = []
try:
pdsh_col = get_collection("pdsh_chapters")
res = pdsh_col.query(query_texts=[topic], n_results=top_k)
if res["documents"] and res["documents"][0]:
for doc, meta, dist in zip(
res["documents"][0], res["metadatas"][0], res["distances"][0]
):
pdsh_results.append({
"content": doc,
"chapter": meta.get("chapter", ""),
"section": meta.get("section", ""),
"similarity": 1 - dist,
})
except Exception:
pass
r4ds_results = []
try:
r4ds_col = get_collection("r4ds_chapters")
res = r4ds_col.query(query_texts=[topic], n_results=top_k)
if res["documents"] and res["documents"][0]:
for doc, meta, dist in zip(
res["documents"][0], res["metadatas"][0], res["distances"][0]
):
r4ds_results.append({
"content": doc,
"chapter": meta.get("chapter", ""),
"section": meta.get("section", ""),
"similarity": 1 - dist,
})
except Exception:
pass
if not islp_results and not esl_results and not fes_results and not pdsh_results and not r4ds_results:
return (
f"❌ No se encontró fundamentación para '{topic}'. "
"Verifica que la ingesta se haya ejecutado correctamente."
)
output_parts = [
f"# Fundamentación Teórica: {topic}\n",
f"**Nivel de detalle:** {detail_level}\n",
]
if islp_results:
output_parts.append("\n## 📘 ISLP (Explicación Intuitiva)\n")
for i, r in enumerate(islp_results, 1):
output_parts.append(
f"### [{i}] Cap. {r['chapter']} § {r['section']} "
f"(sim: {r['similarity']:.3f})\n\n"
f"{r['content'][:1200]}\n\n---\n"
)
if esl_results:
output_parts.append("\n## 📗 ESL (Tratamiento Riguroso)\n")
for i, r in enumerate(esl_results, 1):
output_parts.append(
f"### [{i}] Cap. {r['chapter']} § {r['section']} "
f"(sim: {r['similarity']:.3f})\n\n"
f"{r['content'][:1200]}\n\n---\n"
)
if fes_results:
output_parts.append("\n## 📙 FES (Feature Engineering Práctico)\n")
for i, r in enumerate(fes_results, 1):
output_parts.append(
f"### [{i}] Cap. {r['chapter']} § {r['section']} "
f"(sim: {r['similarity']:.3f})\n\n"
f"{r['content'][:1200]}\n\n---\n"
)
if pdsh_results:
output_parts.append("\n## 📓 PDSH (Código Práctico Python)\n")
for i, r in enumerate(pdsh_results, 1):
output_parts.append(
f"### [{i}] Cap. {r['chapter']} § {r['section']} "
f"(sim: {r['similarity']:.3f})\n\n"
f"{r['content'][:1200]}\n\n---\n"
)
if r4ds_results:
output_parts.append(
"\n## 📕 R4DS (EDA & Data Wrangling — ejemplos en R, principios universales)\n"
"> ⚠️ El código está en R con tidyverse. Léelo como pseudocódigo: el flujo, "
"las heurísticas y la filosofía iterativa de EDA se traducen directamente a "
"pandas/Python.\n"
)
for i, r in enumerate(r4ds_results, 1):
output_parts.append(
f"### [{i}] Cap. {r['chapter']} § {r['section']} "
f"(sim: {r['similarity']:.3f})\n\n"
f"{r['content'][:1200]}\n\n---\n"
)
output_parts.append("\n## 📚 Referencias\n")
if islp_results:
chapters = set(r["chapter"] for r in islp_results)
output_parts.append(f"- **ISLP:** {', '.join(chapters)}\n")
if esl_results:
chapters = set(r["chapter"] for r in esl_results)
output_parts.append(f"- **ESL:** {', '.join(chapters)}\n")
if fes_results:
chapters = set(r["chapter"] for r in fes_results)
output_parts.append(f"- **FES:** {', '.join(chapters)}\n")
if pdsh_results:
chapters = set(r["chapter"] for r in pdsh_results)
output_parts.append(f"- **PDSH:** {', '.join(chapters)}\n")
if r4ds_results:
chapters = set(r["chapter"] for r in r4ds_results)
output_parts.append(
f"- **R4DS:** {', '.join(chapters)} _(R / tidyverse — principios transferibles a pandas)_\n"
)
return "\n".join(output_parts)
def list_available_topics() -> str:
"""
Lista los capítulos y temas disponibles en la base de conocimiento.
Útil para saber qué contenido está indexado y qué consultas se pueden hacer.
Returns:
str: Lista organizada de capítulos por libro con sus secciones principales.
"""
output_parts = ["# 📚 Contenido Disponible en la Base de Conocimiento\n"]
for book_key, collection_name in [
("ESL", "esl_chapters"),
("ISLP", "islp_chapters"),
("FES", "fes_chapters"),
("PDSH", "pdsh_chapters"),
("R4DS", "r4ds_chapters"),
]:
try:
collection = get_collection(collection_name)
all_data = collection.get(include=["metadatas"])
if not all_data["metadatas"]:
output_parts.append(f"\n## {book_key}: Sin datos\n")
continue
chapters = {}
for meta in all_data["metadatas"]:
chapter = meta.get("chapter", "Unknown")
section = meta.get("section", "")
if chapter not in chapters:
chapters[chapter] = set()
if section:
chapters[chapter].add(section)
output_parts.append(f"\n## 📗 {book_key}\n")
for chapter in sorted(chapters.keys()):
sections = sorted(chapters[chapter])
output_parts.append(f"\n### {chapter}\n")
if sections:
for sec in sections[:8]:
output_parts.append(f" - {sec}\n")
if len(sections) > 8:
output_parts.append(f" - ... y {len(sections) - 8} secciones más\n")
total = collection.count()
output_parts.append(f"\n**Total chunks indexados:** {total}\n")
except Exception as e:
output_parts.append(f"\n## {book_key}: ❌ Error ({e})\n")
return "\n".join(output_parts)
|