In HDNNPs[1]}, [2]}, which we use to compute the energies and forces driving the molecular dynamics (MD) simulations, the potential energy is constructed as a sum of atomic energy contributions \(E_n^\alpha \) ,
\(E(\lbrace \mathbf {R}\rbrace )=\sum _{\alpha =1}^{N_\mathrm {elem}}\sum _{n=1}^{N_\mathrm {atoms}^{\alpha }}E_n^\alpha \ .\) 

В HDNNPs[1], [2], которые мы используем для вычисления энергий и сил, ведущих молекулярную динамику (MD) симуляций, потенциальная энергия конструируется как сумма вкладов атомных энергий \(E_n^\alpha\),

\(E(\lbrace \mathbf{R}\rbrace )=\sum _{\alpha =1}^{N_\mathrm{elem}}\sum _{n=1}^{N_\mathrm{atoms}^{\alpha}}E_n^\alpha \ .\)